Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G047333.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W289
Pfam PF00166
Panther DB PTHR10772 PTHR10772:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology K04078; groES, chaperonin GroES
Gene Ontology GO:0006457; protein folding GO:0005737cytoplasm


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14980 : chaperonin 10
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g25050.1 : chaperonin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002606
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G058700 chaperonin, putative, expressed -
2 Sobic.001G048100 OsAPRL5 adenosine 5\'-phosphosulfate reductase-like OsAPRL5, expressed -
3 Sobic.004G181700 calmodulin binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G370900 expressed protein -
5 Sobic.004G164400 expressed protein -
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7 Sobic.001G479100 ORC2 - Putative origin recognition complex subunit 2, expressed K02604: origin recognition complex subunit 2
8 Sobic.010G262000 tRNA-dihydrouridine synthase, putative, expressed K05542: tRNA-dihydrouridine synthase 1
9 Sobic.001G181700 expressed protein -
10 Sobic.009G097200 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
11 Sobic.001G080700 casein kinase II subunit alpha-2, putative, expressed K03097: casein kinase II subunit alpha
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14 Sobic.007G159500 uncharacterized protein, YigZ family, putative, expressed -
15 Sobic.007G019800 expressed protein -
16 Sobic.001G113000 tRNA synthetases class II domain containing protein, expressed K01893: NARS, asparaginyl-tRNA synthetase
17 Sobic.004G174400 ZOS2-09 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.004G149600 - -
19 Sobic.008G133600 diaminopimelate epimerase, chloroplast precursor, putative, expressed K01778: diaminopimelate epimerase
20 Sobic.007G108500 lipid phosphatase protein, putative, expressed K18693: DPP1, DPPL, diacylglycerol diphosphate phosphatase / phosphatidate phosphatase


Gene co-expression network
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Sobic001G181700--Sobic002G110700 Sobic004G348300 Sobic004G348300 Sobic001G181700--Sobic004G348300 Sobic002G352600 Sobic002G352600 Sobic001G181700--Sobic002G352600
Octagon: transcription factors


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