Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G181700.1
Synonym Sb01g015800
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QJM9
Pfam -
Panther DB PTHR36754 PTHR36754:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13677 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g38500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007106
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G222500 expressed protein -
2 Sobic.003G370900 expressed protein -
3 Sobic.001G080700 casein kinase II subunit alpha-2, putative, expressed K03097: casein kinase II subunit alpha
4 Sobic.009G165800 G10 protein, putative, expressed K12873: BUD31, bud site selection protein 31
5 Sobic.003G012200 tRNA synthetases class II domain containing protein, expressed K01876: aspartyl-tRNA synthetase
6 Sobic.003G344900 selT-like protein precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G110700 uncharacterized ACR, YggU family COG1872 containing protein, expressed K09131: uncharacterized protein
8 Sobic.004G348300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K06269: serine/threonine-protein phosphatase PP1 catalytic subunit
9 Sobic.002G352600 expressed protein -
10 Sobic.009G259400 pleckstrin homology domain-containing protein-related taxo, putative, expressed -
11 Sobic.001G508100 expressed protein -
12 Sobic.006G092400 calmodulin binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G235000 methyltransferase, putative, expressed K10770: ALKBH8, alkylated DNA repair protein alkB homolog 8
14 Sobic.010G000900 spotted leaf 11, putative, expressed -
15 Sobic.007G058700 chaperonin, putative, expressed -
16 Sobic.007G098200 - -
17 Sobic.009G217100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
18 Sobic.004G121100 expressed protein -
19 Sobic.003G063000 expressed protein -
20 Sobic.004G066200 ubiquitin fusion degradation protein, putative, expressed K14016: ubiquitin fusion degradation protein 1


Gene co-expression network
sample Sobic001G181700 Sobic001G181700 Sobic009G222500 Sobic009G222500 Sobic001G181700--Sobic009G222500 Sobic003G370900 Sobic003G370900 Sobic001G181700--Sobic003G370900 Sobic001G080700 Sobic001G080700 Sobic001G181700--Sobic001G080700 Sobic009G165800 Sobic009G165800 Sobic001G181700--Sobic009G165800 Sobic003G012200 Sobic003G012200 Sobic001G181700--Sobic003G012200 Sobic003G344900 Sobic003G344900 Sobic001G181700--Sobic003G344900 Sobic002G110700 Sobic002G110700 Sobic001G181700--Sobic002G110700 Sobic004G348300 Sobic004G348300 Sobic001G181700--Sobic004G348300 Sobic002G352600 Sobic002G352600 Sobic001G181700--Sobic002G352600 Sobic009G075800 Sobic009G075800 Sobic009G222500--Sobic009G075800 Sobic006G049700 Sobic006G049700 Sobic009G222500--Sobic006G049700 Sobic009G222500--Sobic001G080700 Sobic006G101700 Sobic006G101700 Sobic009G222500--Sobic006G101700 Sobic004G066200 Sobic004G066200 Sobic009G222500--Sobic004G066200 Sobic007G166400 Sobic007G166400 Sobic009G222500--Sobic007G166400 Sobic010G027600 Sobic010G027600 Sobic009G222500--Sobic010G027600 Sobic003G264200 Sobic003G264200 Sobic009G222500--Sobic003G264200 Sobic004G235000 Sobic004G235000 Sobic009G222500--Sobic004G235000 Sobic001G106700 Sobic001G106700 Sobic003G370900--Sobic001G106700 Sobic001G473300 Sobic001G473300 Sobic003G370900--Sobic001G473300 Sobic003G117900 Sobic003G117900 Sobic003G370900--Sobic003G117900 Sobic003G370900--Sobic001G181700 Sobic001G460600 Sobic001G460600 Sobic003G370900--Sobic001G460600 Sobic007G058700 Sobic007G058700 Sobic003G370900--Sobic007G058700 Sobic003G370900--Sobic004G235000 Sobic001G007200 Sobic001G007200 Sobic003G370900--Sobic001G007200 Sobic003G370900--Sobic009G165800 Sobic001G392300 Sobic001G392300 Sobic001G080700--Sobic001G392300 Sobic001G080700--Sobic009G165800 Sobic010G251000 Sobic010G251000 Sobic001G080700--Sobic010G251000 Sobic001G080700--Sobic004G066200 Sobic001G080700--Sobic003G264200 Sobic001G080700--Sobic009G222500 Sobic001G080700--Sobic006G101700 Sobic001G332500 Sobic001G332500 Sobic001G080700--Sobic001G332500 Sobic001G007000 Sobic001G007000 Sobic001G080700--Sobic001G007000 Sobic009G165800--Sobic001G080700 Sobic001G047400 Sobic001G047400 Sobic009G165800--Sobic001G047400 Sobic009G165800--Sobic006G101700 Sobic009G165800--Sobic002G110700 Sobic003G015900 Sobic003G015900 Sobic009G165800--Sobic003G015900 Sobic010G083700 Sobic010G083700 Sobic009G165800--Sobic010G083700 Sobic009G165800--Sobic010G251000 Sobic004G121100 Sobic004G121100 Sobic009G165800--Sobic004G121100 Sobic009G165800--Sobic003G264200 Sobic001G199100 Sobic001G199100 Sobic003G012200--Sobic001G199100 Sobic003G012200--Sobic003G344900 Sobic010G000900 Sobic010G000900 Sobic003G012200--Sobic010G000900 Sobic001G085100 Sobic001G085100 Sobic003G012200--Sobic001G085100 Sobic003G012200--Sobic004G348300 Sobic003G012200--Sobic009G075800 Sobic004G275700 Sobic004G275700 Sobic003G012200--Sobic004G275700 Sobic009G259400 Sobic009G259400 Sobic003G012200--Sobic009G259400 Sobic003G012200--Sobic001G047400 Sobic003G344900--Sobic003G012200 Sobic003G344900--Sobic010G000900 Sobic003G344900--Sobic004G348300 Sobic003G344900--Sobic009G259400 Sobic005G044800 Sobic005G044800 Sobic003G344900--Sobic005G044800 Sobic001G123000 Sobic001G123000 Sobic003G344900--Sobic001G123000 Sobic003G344900--Sobic001G047400 Sobic003G344900--Sobic001G181700 Sobic001G051200 Sobic001G051200 Sobic003G344900--Sobic001G051200 Sobic002G110700--Sobic009G165800 Sobic002G110700--Sobic010G027600 Sobic002G110700--Sobic004G121100 Sobic010G184100 Sobic010G184100 Sobic002G110700--Sobic010G184100 Sobic002G110700--Sobic001G080700 Sobic007G078500 Sobic007G078500 Sobic002G110700--Sobic007G078500 Sobic007G166100 Sobic007G166100 Sobic002G110700--Sobic007G166100 Sobic003G250500 Sobic003G250500 Sobic002G110700--Sobic003G250500 Sobic002G113900 Sobic002G113900 Sobic002G110700--Sobic002G113900 Sobic004G348300--Sobic003G012200 Sobic004G348300--Sobic003G344900 Sobic004G348300--Sobic001G199100 Sobic004G348300--Sobic002G352600 Sobic006G249700 Sobic006G249700 Sobic004G348300--Sobic006G249700 Sobic004G006200 Sobic004G006200 Sobic004G348300--Sobic004G006200 Sobic002G059300 Sobic002G059300 Sobic004G348300--Sobic002G059300 Sobic009G217100 Sobic009G217100 Sobic004G348300--Sobic009G217100 Sobic005G004200 Sobic005G004200 Sobic004G348300--Sobic005G004200 Sobic002G352600--Sobic003G015900 Sobic002G352600--Sobic010G027600 Sobic009G228700 Sobic009G228700 Sobic002G352600--Sobic009G228700 Sobic002G352600--Sobic004G121100 Sobic002G352600--Sobic009G217100 Sobic001G121200 Sobic001G121200 Sobic002G352600--Sobic001G121200 Sobic002G352600--Sobic010G000900 Sobic002G352600--Sobic004G066200 Sobic003G248200 Sobic003G248200 Sobic002G352600--Sobic003G248200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.