Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G370900.1,Sobic.003G370900.2
Synonym Sb03g041185
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q779
Pfam -
Panther DB PTHR36002
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71865 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g65094.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK10811
Barley -
Wheat -
Populus PNT07917 , PNT07916


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G106700 expressed protein -
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11 Sobic.007G216100 expressed protein -
12 Sobic.001G073000 expressed protein K09659: dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3
13 Sobic.004G183501 - -
14 Sobic.001G113000 tRNA synthetases class II domain containing protein, expressed K01893: NARS, asparaginyl-tRNA synthetase
15 Sobic.009G222500 expressed protein -
16 Sobic.001G080700 casein kinase II subunit alpha-2, putative, expressed K03097: casein kinase II subunit alpha
17 Sobic.009G129900 endo-1,3@1,4-beta-D-glucanase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G352600 expressed protein -
19 Sobic.002G226900 zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2, putative, expressed K07119: PTGR3, prostaglandin reductase 3
20 Sobic.003G015900 CWC15 homolog A, putative, expressed K12863: protein CWC15


Gene co-expression network
sample Sobic003G370900 Sobic003G370900 Sobic001G106700 Sobic001G106700 Sobic003G370900--Sobic001G106700 Sobic001G473300 Sobic001G473300 Sobic003G370900--Sobic001G473300 Sobic003G117900 Sobic003G117900 Sobic003G370900--Sobic003G117900 Sobic001G181700 Sobic001G181700 Sobic003G370900--Sobic001G181700 Sobic001G460600 Sobic001G460600 Sobic003G370900--Sobic001G460600 Sobic007G058700 Sobic007G058700 Sobic003G370900--Sobic007G058700 Sobic004G235000 Sobic004G235000 Sobic003G370900--Sobic004G235000 Sobic001G007200 Sobic001G007200 Sobic003G370900--Sobic001G007200 Sobic009G165800 Sobic009G165800 Sobic003G370900--Sobic009G165800 Sobic001G106700--Sobic003G370900 Sobic001G106700--Sobic003G117900 Sobic001G106700--Sobic001G007200 Sobic001G106700--Sobic001G473300 Sobic001G106700--Sobic001G460600 Sobic001G415500 Sobic001G415500 Sobic001G106700--Sobic001G415500 Sobic002G134001 Sobic002G134001 Sobic001G106700--Sobic002G134001 Sobic007G216100 Sobic007G216100 Sobic001G106700--Sobic007G216100 Sobic009G185800 Sobic009G185800 Sobic001G106700--Sobic009G185800 Sobic001G473300--Sobic003G370900 Sobic001G473300--Sobic001G106700 Sobic006G254100 Sobic006G254100 Sobic001G473300--Sobic006G254100 Sobic004G118200 Sobic004G118200 Sobic001G473300--Sobic004G118200 Sobic001G473300--Sobic001G181700 Sobic010G074300 Sobic010G074300 Sobic001G473300--Sobic010G074300 Sobic006G092400 Sobic006G092400 Sobic001G473300--Sobic006G092400 Sobic001G473300--Sobic003G117900 Sobic001G473300--Sobic004G235000 Sobic010G042100 Sobic010G042100 Sobic003G117900--Sobic010G042100 Sobic003G117900--Sobic003G370900 Sobic003G117900--Sobic001G106700 Sobic001G329100 Sobic001G329100 Sobic003G117900--Sobic001G329100 Sobic003G117900--Sobic001G007200 Sobic004G167400 Sobic004G167400 Sobic003G117900--Sobic004G167400 Sobic004G067100 Sobic004G067100 Sobic003G117900--Sobic004G067100 Sobic002G045300 Sobic002G045300 Sobic003G117900--Sobic002G045300 Sobic010G253800 Sobic010G253800 Sobic003G117900--Sobic010G253800 Sobic009G222500 Sobic009G222500 Sobic001G181700--Sobic009G222500 Sobic001G181700--Sobic003G370900 Sobic001G080700 Sobic001G080700 Sobic001G181700--Sobic001G080700 Sobic001G181700--Sobic009G165800 Sobic003G012200 Sobic003G012200 Sobic001G181700--Sobic003G012200 Sobic003G344900 Sobic003G344900 Sobic001G181700--Sobic003G344900 Sobic002G110700 Sobic002G110700 Sobic001G181700--Sobic002G110700 Sobic004G348300 Sobic004G348300 Sobic001G181700--Sobic004G348300 Sobic002G352600 Sobic002G352600 Sobic001G181700--Sobic002G352600 Sobic009G225000 Sobic009G225000 Sobic001G460600--Sobic009G225000 Sobic001G460600--Sobic001G106700 Sobic009G135600 Sobic009G135600 Sobic001G460600--Sobic009G135600 Sobic001G460600--Sobic003G370900 Sobic010G000900 Sobic010G000900 Sobic001G460600--Sobic010G000900 Sobic001G460600--Sobic003G117900 Sobic001G461900 Sobic001G461900 Sobic001G460600--Sobic001G461900 Sobic004G289800 Sobic004G289800 Sobic001G460600--Sobic004G289800 Sobic003G323600 Sobic003G323600 Sobic001G460600--Sobic003G323600 Sobic007G058700--Sobic003G370900 Sobic007G058700--Sobic001G181700 Sobic001G113000 Sobic001G113000 Sobic007G058700--Sobic001G113000 Sobic007G058700--Sobic009G165800 Sobic007G058700--Sobic001G080700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic007G058700--Sobic001G479100 Sobic004G121100 Sobic004G121100 Sobic007G058700--Sobic004G121100 Sobic007G058700--Sobic009G222500 Sobic002G047333 Sobic002G047333 Sobic007G058700--Sobic002G047333 Sobic004G235000--Sobic009G222500 Sobic004G235000--Sobic006G092400 Sobic003G214500 Sobic003G214500 Sobic004G235000--Sobic003G214500 Sobic003G220800 Sobic003G220800 Sobic004G235000--Sobic003G220800 Sobic010G027600 Sobic010G027600 Sobic004G235000--Sobic010G027600 Sobic004G235000--Sobic001G007200 Sobic004G235000--Sobic003G012200 Sobic004G086600 Sobic004G086600 Sobic004G235000--Sobic004G086600 Sobic009G084000 Sobic009G084000 Sobic004G235000--Sobic009G084000 Sobic010G083700 Sobic010G083700 Sobic001G007200--Sobic010G083700 Sobic001G007200--Sobic001G415500 Sobic007G186300 Sobic007G186300 Sobic001G007200--Sobic007G186300 Sobic001G007200--Sobic010G253800 Sobic001G007200--Sobic004G086600 Sobic001G073000 Sobic001G073000 Sobic001G007200--Sobic001G073000 Sobic009G246950 Sobic009G246950 Sobic001G007200--Sobic009G246950 Sobic004G141700 Sobic004G141700 Sobic001G007200--Sobic004G141700 Sobic009G146100 Sobic009G146100 Sobic001G007200--Sobic009G146100 Sobic009G165800--Sobic001G080700 Sobic001G047400 Sobic001G047400 Sobic009G165800--Sobic001G047400 Sobic006G101700 Sobic006G101700 Sobic009G165800--Sobic006G101700 Sobic009G165800--Sobic002G110700 Sobic003G015900 Sobic003G015900 Sobic009G165800--Sobic003G015900 Sobic009G165800--Sobic010G083700 Sobic010G251000 Sobic010G251000 Sobic009G165800--Sobic010G251000 Sobic009G165800--Sobic004G121100 Sobic003G264200 Sobic003G264200 Sobic009G165800--Sobic003G264200
Octagon: transcription factors


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