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Transcriptome id Sobic.005G210350.1
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UniProt A0A1Z5RJT0
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G028950 - -
2 Sobic.005G012000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.6 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
3 Sobic.008G126200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@calmodulin binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G132100 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
5 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G244800 - -
7 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
10 Sobic.010G074500 -(PubMedID : 26320239)@phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
11 Sobic.004G164650 - -
12 Sobic.004G006300 translationally-controlled tumor protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G042900 expressed protein -
14 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G192900 DNA excision repair protein ERCC-1, putative, expressed K10849: DNA excision repair protein ERCC-1
16 Sobic.010G209501 - -
17 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G117400 protein kinase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
20 Sobic.001G111366 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G210350 Sobic005G210350 Sobic010G028950 Sobic010G028950 Sobic005G210350--Sobic010G028950 Sobic005G012000 Sobic005G012000 Sobic005G210350--Sobic005G012000 Sobic008G126200 Sobic008G126200 Sobic005G210350--Sobic008G126200 Sobic006G132100 Sobic006G132100 Sobic005G210350--Sobic006G132100 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic005G210350--Sobic005G212600 Sobic003G244800 Sobic003G244800 Sobic005G210350--Sobic003G244800 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G210350--Sobic008G009500 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic005G210350--Sobic005G043800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G210350--Sobic010G144000 Sobic010G028950--Sobic005G212600 Sobic010G028950--Sobic008G009500 Sobic003G208700 Sobic003G208700 Sobic010G028950--Sobic003G208700 Sobic010G028950--Sobic010G144000 Sobic005G203400 Sobic005G203400 Sobic010G028950--Sobic005G203400 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic010G028950--Sobic002G062300 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic010G028950--Sobic004G076732 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic010G028950--Sobic001G253100 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic010G028950--Sobic004G092300 Sobic003G044900 Sobic003G044900 Sobic005G012000--Sobic003G044900 Sobic002G039500 Sobic002G039500 Sobic005G012000--Sobic002G039500 Sobic006G184300 Sobic006G184300 Sobic005G012000--Sobic006G184300 Sobic007G023700 Sobic007G023700 Sobic005G012000--Sobic007G023700 Sobic003G093600 Sobic003G093600 Sobic005G012000--Sobic003G093600 Sobic005G012000--Sobic008G126200 Sobic006G194150 Sobic006G194150 Sobic005G012000--Sobic006G194150 Sobic002G221700 Sobic002G221700 Sobic005G012000--Sobic002G221700 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic005G012000--Sobic007G073400 Sobic008G126200--Sobic006G184300 SobicK024000 SobicK024000 Sobic008G126200--SobicK024000 Sobic002G270300 Sobic002G270300 Sobic008G126200--Sobic002G270300 Sobic008G126200--Sobic007G023700 Sobic008G126200--Sobic008G009500 Sobic001G347600 Sobic001G347600 Sobic008G126200--Sobic001G347600 Sobic008G126200--Sobic005G012000 Sobic008G126200--Sobic003G093600 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic008G126200--Sobic002G108800 Sobic010G042900 Sobic010G042900 Sobic006G132100--Sobic010G042900 Sobic001G221100 Sobic001G221100 Sobic006G132100--Sobic001G221100 Sobic004G164650 Sobic004G164650 Sobic006G132100--Sobic004G164650 Sobic006G132100--Sobic005G012000 Sobic009G117300 Sobic009G117300 Sobic006G132100--Sobic009G117300 Sobic006G132100--Sobic008G126200 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic006G132100--Sobic009G117400 Sobic003G422000 Sobic003G422000 Sobic006G132100--Sobic003G422000 Sobic006G132100--Sobic001G347600 Sobic005G212600--Sobic002G062300 Sobic005G212600--Sobic001G253100 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic005G212600--Sobic009G113600 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic005G212600--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic005G212600--Sobic008G108900 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G212600--Sobic002G221200 Sobic005G212600--Sobic008G009500 Sobic005G212600--SobicK024000 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic003G244800--Sobic002G410200 Sobic003G244800--Sobic004G076732 SobicK009900 SobicK009900 Sobic003G244800--SobicK009900 Sobic003G244800--Sobic001G253100 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic003G244800--Sobic009G209800 Sobic003G244800--Sobic008G009500 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic003G244800--Sobic008G042250 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G244800--Sobic004G212800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic003G244800--Sobic008G049701 Sobic008G009500--SobicK024000 Sobic008G009500--Sobic004G076732 Sobic008G009500--Sobic002G062300 Sobic008G009500--Sobic009G113600 Sobic008G009500--Sobic001G253100 Sobic008G009500--Sobic007G073400 Sobic008G009500--Sobic009G209800 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic008G009500--Sobic008G031350 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic008G009500--Sobic005G221425 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G043800--Sobic004G121000 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic005G043800--Sobic010G164350 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic005G043800--Sobic001G261480 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G043800--Sobic008G045600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G043800--Sobic001G305400 Sobic005G043800--Sobic002G221200 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043800--Sobic005G142200 Sobic005G043800--Sobic010G144000 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G043800--Sobic003G366850 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic010G144000--Sobic003G436900 Sobic010G144000--Sobic005G142200 Sobic010G144000--Sobic002G221200 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic010G144000--Sobic004G317600 Sobic010G144000--Sobic004G121000 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic010G144000--Sobic001G240400 Sobic010G144000--Sobic004G092300 Sobic010G144000--Sobic001G305400 Sobic010G144000--Sobic008G045600
Octagon: transcription factors


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