Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G289500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YS89
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G269600 zinc finger, RING-type, putative, expressed -
2 Sobic.002G073300 - -
3 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
4 Sobic.010G139301 - -
5 Sobic.004G286900 - -
6 Sobic.006G063300 - -
7 Sobic.004G193800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K14759: isochorismate synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase / 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase / O-succinylbenzoate synthase
8 Sobic.002G050500 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
9 Sobic.008G086200 expressed protein -
10 Sobic.007G116400 - -
11 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G099500 - -
13 Sobic.004G169501 - -
14 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
15 Sobic.002G177400 expressed protein -
16 Sobic.010G123500 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G023400 SCAR-like protein 2, putative, expressed -
18 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
19 Sobic.005G099150 - -
20 Sobic.006G104400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic006G269600 Sobic006G269600 Sobic004G289500--Sobic006G269600 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic004G289500--Sobic002G073300 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic004G289500--Sobic002G140800 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic004G289500--Sobic010G139301 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic004G289500--Sobic004G286900 Sobic006G063300 Sobic006G063300 Sobic004G289500--Sobic006G063300 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic004G289500--Sobic004G193800 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic004G289500--Sobic002G050500 Sobic008G086200 Sobic008G086200 Sobic004G289500--Sobic008G086200 Sobic006G269600--Sobic004G289500 Sobic006G269600--Sobic002G073300 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic006G269600--Sobic002G177400 Sobic006G269600--Sobic002G050500 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic006G269600--Sobic009G059600 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic006G269600--Sobic006G210200 Sobic003G420201 Sobic003G420201 Sobic006G269600--Sobic003G420201 Sobic006G269600--Sobic010G139301 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic006G269600--Sobic004G088400 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic010G139301 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G073300--Sobic004G169501 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic001G454301 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G073300--Sobic002G182300 Sobic002G073300--Sobic004G289500 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic002G181450 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G073300--Sobic007G142050 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic002G073300--Sobic004G045566 Sobic002G140800--Sobic001G454301 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic002G140800--Sobic003G128600 Sobic002G140800--Sobic004G169501 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic002G140800--Sobic007G116400 Sobic002G140800--Sobic004G088400 Sobic002G140800--Sobic002G050500 Sobic002G140800--Sobic010G139301 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic002G140800--Sobic008G117200 Sobic002G140800--Sobic009G059600 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic007G089600 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic007G142050 Sobic010G139301--Sobic004G169501 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic002G073300 Sobic010G139301--Sobic002G182300 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic010G139301--Sobic005G099150 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic010G139301--Sobic008G068800 Sobic004G286900--Sobic008G068800 Sobic007G121400 Sobic007G121400 Sobic004G286900--Sobic007G121400 Sobic004G286900--Sobic009G059600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic004G286900--Sobic007G115000 Sobic004G286900--Sobic007G142050 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic004G286900--Sobic003G424100 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic004G286900--Sobic004G164600 Sobic004G286900--Sobic003G128600 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic004G286900--Sobic004G076732 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic006G063300--Sobic004G112500 Sobic006G063300--Sobic007G142050 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic006G063300--Sobic001G024200 Sobic006G063300--Sobic007G089600 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic006G063300--Sobic001G272000 Sobic006G063300--Sobic008G068800 Sobic002G346600 Sobic002G346600 Sobic006G063300--Sobic002G346600 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic006G063300--Sobic003G204000 Sobic006G063300--Sobic009G059600 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic004G193800--Sobic003G185250 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic004G193800--Sobic004G016500 Sobic004G193800--Sobic003G424100 Sobic004G193800--Sobic008G068800 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic004G193800--Sobic007G099500 Sobic003G023400 Sobic003G023400 Sobic004G193800--Sobic003G023400 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic004G193800--Sobic004G240900 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic004G193800--Sobic010G208500 Sobic004G193800--Sobic004G169501 Sobic002G050500--Sobic006G210200 Sobic001G268700 Sobic001G268700 Sobic002G050500--Sobic001G268700 Sobic002G050500--Sobic002G140800 Sobic008G056350 Sobic008G056350 Sobic002G050500--Sobic008G056350 Sobic001G045700 Sobic001G045700 Sobic002G050500--Sobic001G045700 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic002G050500--Sobic002G060450 Sobic002G050500--Sobic001G454301 Sobic002G223300 Sobic002G223300 Sobic002G050500--Sobic002G223300 Sobic002G050500--Sobic003G128600 Sobic004G225700 Sobic004G225700 Sobic008G086200--Sobic004G225700 Sobic009G175200 Sobic009G175200 Sobic008G086200--Sobic009G175200 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic008G086200--Sobic003G174900 Sobic003G375000 Sobic003G375000 Sobic008G086200--Sobic003G375000 Sobic009G123500 Sobic009G123500 Sobic008G086200--Sobic009G123500 Sobic008G190500 Sobic008G190500 Sobic008G086200--Sobic008G190500 Sobic008G086200--Sobic004G289500 Sobic009G164900 Sobic009G164900 Sobic008G086200--Sobic009G164900 Sobic010G118700 Sobic010G118700 Sobic008G086200--Sobic010G118700
Octagon: transcription factors


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