Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G104400.1
Synonym EPF2
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PLC0
Pfam -
Panther DB PTHR33109 PTHR33109:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G34245 : Putative membrane lipoprotein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g38470.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056189
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G080030.1
Wheat TraesCS2D02G321300 , TraesCS2B02G340600 , TraesCS2A02G343000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
2 Sobic.003G424100 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G240900 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower and stem, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20528920)@auxin efflux carrier component, putative, expressed K13947: auxin efflux carrier family protein
4 Sobic.004G164600 - -
5 Sobic.001G132500 - -
6 Sobic.004G193800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K14759: isochorismate synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase / 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase / O-succinylbenzoate synthase
7 Sobic.004G169501 - -
8 Sobic.002G047100 - -
9 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G267233 - -
11 Sobic.002G090400 polygalacturonase, putative, expressed -
12 Sobic.007G116400 - -
13 Sobic.004G112500 - -
14 Sobic.002G285200 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR53 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
15 Sobic.004G289500 - -
16 Sobic.004G286900 - -
17 Sobic.002G073300 - -
18 Sobic.005G110430 - -
19 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
20 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G104400 Sobic006G104400 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic006G104400--Sobic009G059600 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic006G104400--Sobic003G424100 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic006G104400--Sobic004G240900 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic006G104400--Sobic004G164600 Sobic001G132500 Sobic001G132500 Sobic006G104400--Sobic001G132500 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic006G104400--Sobic004G193800 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic006G104400--Sobic004G169501 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic006G104400--Sobic002G047100 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic006G104400--Sobic008G068800 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic009G059600--Sobic004G076732 Sobic003G424100--Sobic004G164600 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic004G212800 Sobic003G424100--Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic007G073400 Sobic003G424100--Sobic009G059600 Sobic003G424100--Sobic007G099500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic008G068800 Sobic004G240900--Sobic003G424100 Sobic006G133600 Sobic006G133600 Sobic004G240900--Sobic006G133600 Sobic004G240900--Sobic001G046600 Sobic004G240900--Sobic007G099500 Sobic004G240900--Sobic004G016500 Sobic004G240900--Sobic009G059600 Sobic003G029300 Sobic003G029300 Sobic004G240900--Sobic003G029300 Sobic004G240900--Sobic004G193800 Sobic004G240900--Sobic004G164600 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic001G132500--Sobic006G132200 Sobic001G132500--Sobic008G157950 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic001G132500--Sobic009G196700 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic001G132500--Sobic003G031750 Sobic001G132500--Sobic008G042250 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic001G132500--Sobic008G036500 Sobic001G132500--Sobic004G164600 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G132500--Sobic008G091900 Sobic001G132500--Sobic005G110430 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic004G193800--Sobic003G185250 Sobic004G193800--Sobic004G016500 Sobic004G193800--Sobic003G424100 Sobic004G193800--Sobic008G068800 Sobic004G193800--Sobic007G099500 Sobic003G023400 Sobic003G023400 Sobic004G193800--Sobic003G023400 Sobic004G193800--Sobic004G240900 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic004G193800--Sobic010G208500 Sobic004G193800--Sobic004G169501 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic002G047100--Sobic008G049000 Sobic002G047100--Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic006G132200 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic003G038000 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic002G047100--Sobic007G066050 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic002G047100--Sobic003G219000 Sobic002G318900 Sobic002G318900 Sobic002G047100--Sobic002G318900 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic002G047100--Sobic008G167100 Sobic002G047100--Sobic008G091900 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200
Octagon: transcription factors


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