Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G086200.1,Sobic.008G086200.2
Synonym Sb08g008680
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PCK7 , A0A1B6PCB0
Pfam -
Panther DB PTHR31949 PTHR31949:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G27850 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13670.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024990 , Zm00025a054289
Brachypodium KQJ91749 , KQJ91750 , KQJ91751
Barley HORVU5Hr1G030640.4 , HORVU5Hr1G030640.5 , HORVU5Hr1G030640.2 , HORVU5Hr1G030640.3 , HORVU5Hr1G030630.1
Wheat TraesCS5D02G124400 , TraesCS5D02G124400 , TraesCSU02G135900 , TraesCS5B02G121900 , TraesCS5B02G121900 , TraesCS5B02G121900 , TraesCS5B02G121900
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.008G086200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G225700 F-box/LRR-repeat protein 2, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
2 Sobic.009G175200 expressed protein -
3 Sobic.003G174900 fimbrin-like protein 2, putative, expressed K17336: plastin-3
4 Sobic.003G375000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G123500 TKL_IRAK_CR4L.5 - The CR4L subfamily has homology with Crinkly4, expressed -
6 Sobic.008G190500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
7 Sobic.004G289500 - -
8 Sobic.009G164900 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
9 Sobic.010G118700 microtubule-associated protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G210900 expressed protein -
11 Sobic.001G352600 expressed protein -
12 Sobic.004G205500 expressed protein -
13 Sobic.002G177400 expressed protein -
14 Sobic.004G199700 expressed protein -
15 Sobic.006G167300 AGC_PVPK_like_kin82y.11 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
16 Sobic.001G315400 expressed protein -
17 Sobic.009G030300 RNA polymerase II-associated protein 3, putative, expressed -
18 Sobic.003G023400 SCAR-like protein 2, putative, expressed -
19 Sobic.005G159600 lymphoid organ expressed yellow head virus receptor protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G277900 "D61(Ortholog in rice:Morinaka et al., 2006(PubMedID : 31659871)@systemin receptor SR160 precursor, putative, expressed K13415: protein brassinosteroid insensitive 1


Gene co-expression network
sample Sobic008G086200 Sobic008G086200 Sobic004G225700 Sobic004G225700 Sobic008G086200--Sobic004G225700 Sobic009G175200 Sobic009G175200 Sobic008G086200--Sobic009G175200 Sobic003G174900 Sobic003G174900 Sobic008G086200--Sobic003G174900 Sobic003G375000 Sobic003G375000 Sobic008G086200--Sobic003G375000 Sobic009G123500 Sobic009G123500 Sobic008G086200--Sobic009G123500 Sobic008G190500 Sobic008G190500 Sobic008G086200--Sobic008G190500 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic008G086200--Sobic004G289500 Sobic009G164900 Sobic009G164900 Sobic008G086200--Sobic009G164900 Sobic010G118700 Sobic010G118700 Sobic008G086200--Sobic010G118700 Sobic004G225700--Sobic008G086200 Sobic002G218700 Sobic002G218700 Sobic004G225700--Sobic002G218700 Sobic003G077500 Sobic003G077500 Sobic004G225700--Sobic003G077500 Sobic002G393200 Sobic002G393200 Sobic004G225700--Sobic002G393200 Sobic004G225700--Sobic009G175200 Sobic001G385400 Sobic001G385400 Sobic004G225700--Sobic001G385400 Sobic005G159600 Sobic005G159600 Sobic004G225700--Sobic005G159600 Sobic006G254500 Sobic006G254500 Sobic004G225700--Sobic006G254500 Sobic004G134100 Sobic004G134100 Sobic004G225700--Sobic004G134100 Sobic009G175200--Sobic008G086200 Sobic009G175200--Sobic003G174900 Sobic009G099700 Sobic009G099700 Sobic009G175200--Sobic009G099700 Sobic001G361800 Sobic001G361800 Sobic009G175200--Sobic001G361800 Sobic004G247300 Sobic004G247300 Sobic009G175200--Sobic004G247300 Sobic007G210900 Sobic007G210900 Sobic009G175200--Sobic007G210900 Sobic004G154600 Sobic004G154600 Sobic009G175200--Sobic004G154600 Sobic009G175200--Sobic003G375000 Sobic009G175200--Sobic004G225700 Sobic004G199700 Sobic004G199700 Sobic003G174900--Sobic004G199700 Sobic002G216600 Sobic002G216600 Sobic003G174900--Sobic002G216600 Sobic009G259500 Sobic009G259500 Sobic003G174900--Sobic009G259500 Sobic003G174900--Sobic001G361800 Sobic001G258100 Sobic001G258100 Sobic003G174900--Sobic001G258100 Sobic005G204100 Sobic005G204100 Sobic003G174900--Sobic005G204100 Sobic002G348700 Sobic002G348700 Sobic003G174900--Sobic002G348700 Sobic003G174900--Sobic008G086200 Sobic004G205500 Sobic004G205500 Sobic003G174900--Sobic004G205500 Sobic003G375000--Sobic008G086200 Sobic003G375000--Sobic003G174900 Sobic003G375000--Sobic009G175200 Sobic007G187400 Sobic007G187400 Sobic003G375000--Sobic007G187400 Sobic001G494100 Sobic001G494100 Sobic003G375000--Sobic001G494100 Sobic006G248300 Sobic006G248300 Sobic003G375000--Sobic006G248300 Sobic003G375000--Sobic004G225700 Sobic003G277900 Sobic003G277900 Sobic003G375000--Sobic003G277900 Sobic003G375000--Sobic005G204100 Sobic009G123500--Sobic008G086200 Sobic009G123500--Sobic005G159600 Sobic009G123500--Sobic003G277900 Sobic003G347300 Sobic003G347300 Sobic009G123500--Sobic003G347300 Sobic009G123500--Sobic008G190500 Sobic004G006700 Sobic004G006700 Sobic009G123500--Sobic004G006700 Sobic001G435201 Sobic001G435201 Sobic009G123500--Sobic001G435201 Sobic009G123500--Sobic010G118700 Sobic004G053300 Sobic004G053300 Sobic009G123500--Sobic004G053300 Sobic008G190500--Sobic007G210900 Sobic008G190500--Sobic008G086200 Sobic010G135300 Sobic010G135300 Sobic008G190500--Sobic010G135300 Sobic008G190500--Sobic003G077500 Sobic001G021500 Sobic001G021500 Sobic008G190500--Sobic001G021500 Sobic003G023400 Sobic003G023400 Sobic008G190500--Sobic003G023400 Sobic008G190500--Sobic009G123500 Sobic003G420800 Sobic003G420800 Sobic008G190500--Sobic003G420800 Sobic001G315400 Sobic001G315400 Sobic008G190500--Sobic001G315400 Sobic006G269600 Sobic006G269600 Sobic004G289500--Sobic006G269600 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic004G289500--Sobic002G073300 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic004G289500--Sobic002G140800 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic004G289500--Sobic010G139301 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic004G289500--Sobic004G286900 Sobic006G063300 Sobic006G063300 Sobic004G289500--Sobic006G063300 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic004G289500--Sobic004G193800 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic004G289500--Sobic002G050500 Sobic004G289500--Sobic008G086200 Sobic002G007200 Sobic002G007200 Sobic009G164900--Sobic002G007200 Sobic003G380500 Sobic003G380500 Sobic009G164900--Sobic003G380500 Sobic001G216600 Sobic001G216600 Sobic009G164900--Sobic001G216600 Sobic003G356200 Sobic003G356200 Sobic009G164900--Sobic003G356200 Sobic001G217100 Sobic001G217100 Sobic009G164900--Sobic001G217100 Sobic004G229100 Sobic004G229100 Sobic009G164900--Sobic004G229100 Sobic009G011500 Sobic009G011500 Sobic009G164900--Sobic009G011500 Sobic007G195400 Sobic007G195400 Sobic009G164900--Sobic007G195400 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic009G164900--Sobic002G157200 Sobic003G115100 Sobic003G115100 Sobic010G118700--Sobic003G115100 Sobic010G118700--Sobic008G086200 Sobic002G224700 Sobic002G224700 Sobic010G118700--Sobic002G224700 Sobic010G118700--Sobic007G195400 Sobic003G412300 Sobic003G412300 Sobic010G118700--Sobic003G412300 Sobic007G086500 Sobic007G086500 Sobic010G118700--Sobic007G086500 Sobic001G226000 Sobic001G226000 Sobic010G118700--Sobic001G226000 Sobic001G367100 Sobic001G367100 Sobic010G118700--Sobic001G367100 Sobic003G380400 Sobic003G380400 Sobic010G118700--Sobic003G380400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.