Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G246800.1
Synonym Sb04g028670, CRR22
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5XZ98
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF889
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11290 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g50280.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032675
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G076200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein ycf44, putative, expressed K07399: resB, cytochrome c biogenesis protein
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20 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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