Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G315800.1
Synonym ZFP8, Sb04g034740
Functional annotation ZOS2-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5XTJ9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G41940 : zinc finger protein 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g53530.1 : ZOS2-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007430 , Zm00025a030753 , Zm00025a047195 , Zm00025a017316 , Zm00025a033046 , Zm00025a004392 , Zm00025a025172 , Zm00025a042483 , Zm00025a049619 , Zm00025a001503 , Zm00025a022299 , Zm00025a014022 , Zm00025a052932
Brachypodium KQJ98574 , KQK19094 , KQJ90446 , KQK01658
Barley HORVU6Hr1G080870.1 , HORVU6Hr1G080870.2 , HORVU4Hr1G064150.2 , HORVU4Hr1G064150.3 , HORVU4Hr1G064150.1 , HORVU4Hr1G013330.1 , HORVU7Hr1G034930.2
Wheat TraesCS4D02G230300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G315800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G130100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
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5 Sobic.001G269300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G241500 expressed protein -
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9 Sobic.007G076700 coproporphyrinogen III oxidase, chloroplast precursor, putative, expressed K00228: CPOX, coproporphyrinogen III oxidase
10 Sobic.008G105900 - -
11 Sobic.002G104000 - -
12 Sobic.005G036600 calmodulin-binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G217700 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G180432 - -
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18 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.009G212700 ras-related protein, putative, expressed K07897: Ras-related protein Rab-7A
20 Sobic.004G020401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic004G315800--Sobic007G130100 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic004G315800--Sobic006G204200 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic004G315800--Sobic008G131700 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic004G315800--Sobic002G209600 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic004G315800--Sobic001G269300 Sobic004G241500 Sobic004G241500 Sobic004G315800--Sobic004G241500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic004G315800--Sobic004G016500 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic004G315800--Sobic007G052900 Sobic007G076700 Sobic007G076700 Sobic004G315800--Sobic007G076700 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic007G130100--Sobic004G020401 Sobic007G130100--Sobic004G315800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic007G130100--Sobic004G291800 Sobic003G324000 Sobic003G324000 Sobic007G130100--Sobic003G324000 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic007G130100--Sobic010G280100 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic007G130100--Sobic009G198900 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic007G130100--Sobic003G057800 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic007G130100--Sobic006G048775 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic007G130100--Sobic009G110366 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic006G204200--Sobic002G376800 Sobic006G204200--Sobic003G057800 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic006G204200--Sobic001G479500 Sobic006G204200--Sobic004G016500 Sobic006G204200--Sobic004G315800 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic006G204200--Sobic002G330400 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic006G204200--Sobic008G161401 Sobic006G204200--Sobic004G020401 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic006G204200--Sobic010G248200 Sobic003G074700 Sobic003G074700 Sobic008G131700--Sobic003G074700 Sobic002G215000 Sobic002G215000 Sobic008G131700--Sobic002G215000 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic008G131700--Sobic005G084000 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic008G131700--Sobic001G495300 Sobic003G305300 Sobic003G305300 Sobic008G131700--Sobic003G305300 Sobic004G246800 Sobic004G246800 Sobic008G131700--Sobic004G246800 Sobic007G210600 Sobic007G210600 Sobic008G131700--Sobic007G210600 Sobic006G060200 Sobic006G060200 Sobic008G131700--Sobic006G060200 Sobic008G131700--Sobic002G209600 Sobic002G209600--Sobic004G246800 Sobic002G209600--Sobic007G052900 Sobic006G191400 Sobic006G191400 Sobic002G209600--Sobic006G191400 Sobic002G209600--Sobic001G269300 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic002G209600--Sobic009G251300 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic002G209600--Sobic005G063700 Sobic002G209600--Sobic008G131700 Sobic002G209600--Sobic007G076700 Sobic002G209600--Sobic002G330400 Sobic001G269300--Sobic006G060200 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic001G269300--Sobic006G180432 Sobic005G036600 Sobic005G036600 Sobic001G269300--Sobic005G036600 Sobic001G269300--Sobic002G209600 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic001G269300--Sobic003G201750 Sobic001G269300--Sobic007G052900 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic001G269300--Sobic004G143400 Sobic001G269300--Sobic008G131700 Sobic001G269300--Sobic004G315800 Sobic004G241500--Sobic007G052900 Sobic004G113800 Sobic004G113800 Sobic004G241500--Sobic004G113800 Sobic004G241500--Sobic004G315800 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic004G241500--Sobic004G035000 Sobic004G174400 Sobic004G174400 Sobic004G241500--Sobic004G174400 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic004G241500--Sobic009G140500 Sobic004G241500--Sobic006G191400 Sobic001G118100 Sobic001G118100 Sobic004G241500--Sobic001G118100 Sobic004G001300 Sobic004G001300 Sobic004G241500--Sobic004G001300 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic004G016500--Sobic001G046600 Sobic002G150766 Sobic002G150766 Sobic004G016500--Sobic002G150766 Sobic004G016500--Sobic002G330400 Sobic008G167300 Sobic008G167300 Sobic004G016500--Sobic008G167300 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic004G016500--Sobic004G212800 Sobic004G016500--Sobic003G057800 Sobic004G016500--Sobic001G479500 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic004G016500--Sobic004G164600 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic004G016500--Sobic003G424100 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic007G052900--Sobic010G056200 Sobic007G052900--Sobic004G113800 Sobic007G052900--Sobic002G209600 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic007G052900--Sobic010G005600 Sobic004G083700 Sobic004G083700 Sobic007G052900--Sobic004G083700 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic007G052900--Sobic007G054000 Sobic007G052900--Sobic010G280100 Sobic007G052900--Sobic006G180432 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic007G052900--Sobic009G065100 Sobic007G076700--Sobic004G035000 Sobic001G031300 Sobic001G031300 Sobic007G076700--Sobic001G031300 Sobic007G076700--Sobic002G209600 Sobic003G040000 Sobic003G040000 Sobic007G076700--Sobic003G040000 Sobic009G127400 Sobic009G127400 Sobic007G076700--Sobic009G127400 Sobic004G142700 Sobic004G142700 Sobic007G076700--Sobic004G142700 Sobic003G112700 Sobic003G112700 Sobic007G076700--Sobic003G112700 Sobic002G114700 Sobic002G114700 Sobic007G076700--Sobic002G114700 Sobic001G354501 Sobic001G354501 Sobic007G076700--Sobic001G354501
Octagon: transcription factors


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