Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G269300.4
Synonym
Functional annotation OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S7T6
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF74
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g31340.1 : OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G060200 basic proline-rich protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G180432 - -
3 Sobic.005G036600 calmodulin-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G209600 CBS domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G201750 - -
6 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
7 Sobic.004G143400 - -
8 Sobic.008G131700 PsbP, putative, expressed -
9 Sobic.004G315800 ZOS2-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
10 Sobic.009G251300 endonuclease, putative, expressed -
11 Sobic.001G217700 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G063700 OsFBW2 - F-box domain and WD40 repeat containing protein, expressed -
13 Sobic.008G105900 - -
14 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
16 Sobic.006G048775 - -
17 Sobic.007G225800 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K15335: NSUN2, tRNA (cytosine34-C5)-methyltransferase
18 Sobic.003G074700 thylakoid lumenal protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G054000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
20 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic006G060200 Sobic006G060200 Sobic001G269300--Sobic006G060200 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic001G269300--Sobic006G180432 Sobic005G036600 Sobic005G036600 Sobic001G269300--Sobic005G036600 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic001G269300--Sobic002G209600 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic001G269300--Sobic003G201750 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic001G269300--Sobic007G052900 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic001G269300--Sobic004G143400 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic001G269300--Sobic008G131700 Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic001G269300--Sobic004G315800 Sobic006G060200--Sobic001G269300 Sobic002G215000 Sobic002G215000 Sobic006G060200--Sobic002G215000 Sobic001G217700 Sobic001G217700 Sobic006G060200--Sobic001G217700 Sobic006G060200--Sobic008G131700 Sobic001G233400 Sobic001G233400 Sobic006G060200--Sobic001G233400 Sobic006G060200--Sobic005G036600 Sobic003G137100 Sobic003G137100 Sobic006G060200--Sobic003G137100 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic006G060200--Sobic001G495300 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic006G060200--Sobic005G084000 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic006G180432--Sobic003G057800 Sobic006G180432--Sobic001G269300 Sobic006G180432--Sobic007G052900 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic006G180432--Sobic001G479500 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic006G180432--Sobic001G497200 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic006G180432--Sobic001G046600 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic006G180432--Sobic005G187200 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic006G180432--Sobic004G016500 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic006G180432--Sobic006G048775 Sobic001G118100 Sobic001G118100 Sobic005G036600--Sobic001G118100 Sobic005G036600--Sobic001G269300 Sobic005G036600--Sobic007G052900 Sobic005G036600--Sobic006G060200 Sobic005G036600--Sobic006G180432 Sobic006G249050 Sobic006G249050 Sobic005G036600--Sobic006G249050 Sobic004G065650 Sobic004G065650 Sobic005G036600--Sobic004G065650 Sobic005G036600--Sobic001G217700 Sobic009G212700 Sobic009G212700 Sobic005G036600--Sobic009G212700 Sobic004G246800 Sobic004G246800 Sobic002G209600--Sobic004G246800 Sobic002G209600--Sobic007G052900 Sobic006G191400 Sobic006G191400 Sobic002G209600--Sobic006G191400 Sobic002G209600--Sobic001G269300 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic002G209600--Sobic009G251300 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic002G209600--Sobic005G063700 Sobic002G209600--Sobic008G131700 Sobic007G076700 Sobic007G076700 Sobic002G209600--Sobic007G076700 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic002G209600--Sobic002G330400 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic003G201750--Sobic005G001900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic003G201750--Sobic006G088580 Sobic003G201750--Sobic001G269300 Sobic003G201750--Sobic002G330400 Sobic003G201750--Sobic006G048775 Sobic006G137400 Sobic006G137400 Sobic003G201750--Sobic006G137400 Sobic003G006833 Sobic003G006833 Sobic003G201750--Sobic003G006833 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G201750--Sobic007G037900 Sobic007G037100 Sobic007G037100 Sobic003G201750--Sobic007G037100 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic007G052900--Sobic010G056200 Sobic004G113800 Sobic004G113800 Sobic007G052900--Sobic004G113800 Sobic007G052900--Sobic002G209600 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic007G052900--Sobic010G005600 Sobic004G083700 Sobic004G083700 Sobic007G052900--Sobic004G083700 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic007G052900--Sobic007G054000 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic007G052900--Sobic010G280100 Sobic007G052900--Sobic006G180432 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic007G052900--Sobic009G065100 Sobic004G143400--Sobic005G084000 Sobic004G143400--Sobic001G269300 Sobic007G210600 Sobic007G210600 Sobic004G143400--Sobic007G210600 Sobic004G143400--Sobic001G495300 Sobic004G151900 Sobic004G151900 Sobic004G143400--Sobic004G151900 Sobic004G143400--Sobic006G060200 Sobic008G008500 Sobic008G008500 Sobic004G143400--Sobic008G008500 Sobic008G021700 Sobic008G021700 Sobic004G143400--Sobic008G021700 Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic004G143400--Sobic008G105300 Sobic003G074700 Sobic003G074700 Sobic008G131700--Sobic003G074700 Sobic008G131700--Sobic002G215000 Sobic008G131700--Sobic005G084000 Sobic008G131700--Sobic001G495300 Sobic003G305300 Sobic003G305300 Sobic008G131700--Sobic003G305300 Sobic008G131700--Sobic004G246800 Sobic008G131700--Sobic007G210600 Sobic008G131700--Sobic006G060200 Sobic008G131700--Sobic002G209600 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic004G315800--Sobic007G130100 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic004G315800--Sobic006G204200 Sobic004G315800--Sobic008G131700 Sobic004G315800--Sobic002G209600 Sobic004G315800--Sobic001G269300 Sobic004G241500 Sobic004G241500 Sobic004G315800--Sobic004G241500 Sobic004G315800--Sobic004G016500 Sobic004G315800--Sobic007G052900 Sobic004G315800--Sobic007G076700
Octagon: transcription factors


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