Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G441301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1J2
Pfam PF11977
Panther DB PTHR13547 PTHR13547:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G16650 : proteinaceous RNase P 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g73690.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025855
Brachypodium PNT73660
Barley -
Wheat TraesCS3A02G518500 , TraesCS3A02G518500 , TraesCS3B02G585700 , TraesCS3D02G525800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G270650 - -
2 Sobic.008G138850 - -
3 Sobic.010G061400 expressed protein -
4 Sobic.010G055900 - -
5 Sobic.009G255400 expressed protein -
6 Sobic.001G065150 - -
7 Sobic.004G278800 - -
8 Sobic.005G024500 expressed protein -
9 Sobic.005G019300 receptor kinase, putative, expressed -
10 Sobic.002G094000 expressed protein -
11 Sobic.001G325100 DUF623 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
13 Sobic.010G033750 - -
14 Sobic.009G078401 - -
15 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G527550 - -
17 Sobic.001G279800 lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.009G078300 expressed protein -
19 Sobic.008G053500 bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed K03453: bile acid:Na+ symporter, BASS family
20 Sobic.002G075400 receptor kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G441301 Sobic003G441301 Sobic003G270650 Sobic003G270650 Sobic003G441301--Sobic003G270650 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic003G441301--Sobic008G138850 Sobic010G061400 Sobic010G061400 Sobic003G441301--Sobic010G061400 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic003G441301--Sobic010G055900 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic003G441301--Sobic009G255400 Sobic001G065150 Sobic001G065150 Sobic003G441301--Sobic001G065150 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic003G441301--Sobic004G278800 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic003G441301--Sobic005G024500 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic003G441301--Sobic005G019300 Sobic003G270650--Sobic003G441301 Sobic003G270650--Sobic010G055900 Sobic003G270650--Sobic010G061400 Sobic003G270650--Sobic004G278800 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic003G270650--Sobic003G142500 Sobic003G270650--Sobic008G138850 Sobic003G270650--Sobic001G065150 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic003G270650--Sobic002G094100 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic003G270650--Sobic002G094000 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic008G138850--Sobic009G078401 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic008G138850--Sobic009G078300 Sobic008G138850--Sobic009G255400 Sobic008G138850--Sobic005G024500 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic008G138850--Sobic001G325100 Sobic008G138850--Sobic004G278800 Sobic008G138850--Sobic005G019300 Sobic002G075400 Sobic002G075400 Sobic008G138850--Sobic002G075400 Sobic008G138850--Sobic003G441301 Sobic010G061400--Sobic005G024500 Sobic010G061400--Sobic003G441301 Sobic010G061400--Sobic002G094000 Sobic010G061400--Sobic005G019300 Sobic010G061400--Sobic002G094100 Sobic010G061400--Sobic003G142500 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic010G061400--Sobic010G124100 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G061400--Sobic009G025750 Sobic010G061400--Sobic008G138850 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic010G055900--Sobic006G199601 Sobic010G055900--Sobic003G441301 Sobic010G055900--Sobic001G325100 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic010G055900--Sobic008G053500 Sobic010G055900--Sobic008G138850 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic010G055900--Sobic001G288500 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic010G055900--Sobic001G279800 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic010G055900--Sobic003G068200 Sobic010G055900--Sobic003G270650 Sobic009G255400--Sobic008G138850 Sobic009G255400--Sobic001G325100 Sobic009G255400--Sobic003G441301 Sobic009G255400--Sobic009G078401 Sobic009G255400--Sobic002G075400 Sobic009G255400--Sobic001G065150 Sobic009G255400--Sobic010G055900 Sobic009G255400--Sobic005G024500 Sobic009G255400--Sobic010G061400 Sobic001G065150--Sobic008G138850 Sobic001G065150--Sobic003G441301 Sobic001G065150--Sobic010G061400 Sobic001G065150--Sobic002G094000 Sobic010G033750 Sobic010G033750 Sobic001G065150--Sobic010G033750 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic001G065150--Sobic001G527550 Sobic001G065150--Sobic009G255400 Sobic001G065150--Sobic005G019300 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic001G065150--Sobic005G116800 Sobic004G278800--Sobic002G094000 Sobic004G278800--Sobic009G078401 Sobic004G278800--Sobic010G033750 Sobic004G278800--Sobic002G094100 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic004G278800--Sobic001G422001 Sobic004G278800--Sobic008G138850 Sobic004G278800--Sobic003G142500 Sobic004G278800--Sobic005G019300 Sobic004G278800--Sobic009G078300 Sobic005G024500--Sobic002G094000 Sobic005G024500--Sobic005G019300 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic005G024500--Sobic003G172000 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic005G024500--Sobic002G073000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic005G024500--Sobic002G121050 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic005G024500--Sobic006G094900 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic005G024500--Sobic004G334501 Sobic005G024500--Sobic002G094100 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic005G024500--Sobic009G097500 Sobic005G019300--Sobic002G094000 Sobic005G019300--Sobic005G024500 Sobic005G019300--Sobic006G094900 Sobic005G019300--Sobic003G172000 Sobic005G019300--Sobic002G121050 Sobic005G019300--Sobic002G073000 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G019300--Sobic009G213150 Sobic005G019300--Sobic004G278800 Sobic005G019300--Sobic002G094100
Octagon: transcription factors


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