Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G326300.1
Synonym Sb04g035585, ATAMPD, FAC1
Functional annotation AMP deaminase, putative, expressed
UniProt A0A194YSN7
Pfam -
Panther DB PTHR11359 PTHR11359:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003876; AMP deaminase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38280 : AMP deaminase, putative / myoadenylate deaminase, putative
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49270.1 : AMP deaminase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G361600 - -
2 Sobic.004G358301 - -
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9 Sobic.002G100100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.002G026150 - -
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12 Sobic.010G147300 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
13 Sobic.003G126750 - -
14 Sobic.006G021200 xa1, putative, expressed -
15 Sobic.002G397650 - -
16 Sobic.001G406500 MBTB57 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.002G175700 STE_MEK_ste7_MAP2K.3 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K04368: MAP2K1, mitogen-activated protein kinase kinase 1
18 Sobic.007G064000 expressed protein -
19 Sobic.007G048400 berberine and berberine like domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G418800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G326300 Sobic004G326300 Sobic003G361600 Sobic003G361600 Sobic004G326300--Sobic003G361600 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic004G326300--Sobic004G358301 Sobic008G170700 Sobic008G170700 Sobic004G326300--Sobic008G170700 Sobic002G148232 Sobic002G148232 Sobic004G326300--Sobic002G148232 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic004G326300--Sobic006G109600 Sobic002G183000 Sobic002G183000 Sobic004G326300--Sobic002G183000 Sobic002G153900 Sobic002G153900 Sobic004G326300--Sobic002G153900 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic004G326300--Sobic005G031901 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic004G326300--Sobic002G100100 Sobic007G106800 Sobic007G106800 Sobic003G361600--Sobic007G106800 Sobic004G306500 Sobic004G306500 Sobic003G361600--Sobic004G306500 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic003G361600--Sobic004G174200 Sobic001G534700 Sobic001G534700 Sobic003G361600--Sobic001G534700 Sobic003G198800 Sobic003G198800 Sobic003G361600--Sobic003G198800 Sobic002G411600 Sobic002G411600 Sobic003G361600--Sobic002G411600 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic003G361600--Sobic004G091100 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic003G361600--Sobic010G206900 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic003G361600--Sobic009G165700 Sobic004G358301--Sobic005G031901 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic004G358301--Sobic010G147300 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic004G358301--Sobic003G126750 Sobic004G358301--Sobic006G109600 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic004G358301--Sobic001G261464 Sobic004G358301--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic004G358301--Sobic002G026150 Sobic004G358301--Sobic002G153900 Sobic004G243700 Sobic004G243700 Sobic004G358301--Sobic004G243700 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic008G170700--Sobic007G064000 Sobic008G170700--Sobic004G358301 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic008G170700--Sobic007G007600 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic008G170700--Sobic002G175700 Sobic003G281700 Sobic003G281700 Sobic008G170700--Sobic003G281700 Sobic008G170700--Sobic010G147300 Sobic008G170700--Sobic002G026150 Sobic008G170700--Sobic005G031901 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic008G170700--Sobic002G036500 Sobic008G015500 Sobic008G015500 Sobic002G148232--Sobic008G015500 Sobic008G192600 Sobic008G192600 Sobic002G148232--Sobic008G192600 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic002G148232--Sobic001G274200 Sobic007G126600 Sobic007G126600 Sobic002G148232--Sobic007G126600 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic002G148232--Sobic004G208900 Sobic009G138800 Sobic009G138800 Sobic002G148232--Sobic009G138800 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic002G148232--Sobic007G161000 Sobic001G035900 Sobic001G035900 Sobic002G148232--Sobic001G035900 Sobic002G154551 Sobic002G154551 Sobic002G148232--Sobic002G154551 Sobic006G109600--Sobic003G126750 Sobic006G109600--Sobic005G031901 Sobic006G109600--Sobic010G147300 Sobic006G109600--Sobic001G261464 Sobic006G109600--Sobic002G100100 Sobic006G109600--Sobic002G026150 Sobic006G109600--Sobic002G175700 Sobic006G109600--Sobic004G358301 Sobic006G109600--Sobic004G243700 Sobic001G018350 Sobic001G018350 Sobic002G183000--Sobic001G018350 Sobic001G165301 Sobic001G165301 Sobic002G183000--Sobic001G165301 Sobic002G183000--Sobic004G358301 Sobic002G183000--Sobic002G100100 Sobic002G183000--Sobic010G147300 Sobic002G183000--Sobic005G031901 Sobic002G183000--Sobic004G326300 Sobic002G183000--Sobic003G126750 Sobic002G183000--Sobic003G281700 Sobic002G153900--Sobic003G126750 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic002G153900--Sobic004G358200 Sobic002G153900--Sobic001G261464 Sobic002G153900--Sobic002G026150 Sobic006G026300 Sobic006G026300 Sobic002G153900--Sobic006G026300 Sobic002G153900--Sobic006G109600 Sobic002G153900--Sobic005G031901 Sobic002G153900--Sobic004G358301 Sobic002G153900--Sobic002G100100 Sobic005G031901--Sobic010G147300 Sobic005G031901--Sobic006G109600 Sobic005G031901--Sobic003G126750 Sobic005G031901--Sobic001G261464 Sobic005G031901--Sobic004G358301 Sobic005G031901--Sobic002G100100 Sobic005G031901--Sobic002G026150 Sobic005G031901--Sobic002G175700 Sobic005G031901--Sobic007G064000 Sobic002G100100--Sobic005G031901 Sobic002G100100--Sobic001G261464 Sobic002G100100--Sobic006G109600 Sobic002G100100--Sobic003G126750 Sobic002G100100--Sobic010G147300 Sobic002G100100--Sobic006G026300 Sobic002G100100--Sobic004G358301 Sobic002G100100--Sobic004G243700 Sobic002G100100--Sobic002G026150
Octagon: transcription factors


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