Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G021200.1
Synonym Sb06g001980
Functional annotation xa1, putative, expressed
UniProt C5YCM0
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF586
NCBI CDD KOG1947; Leucine rich repeat proteins, some proteins contain F-box
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g16270.2 : xa1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G021250 - -
2 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
3 Sobic.006G209850 - -
4 Sobic.007G178700 - -
5 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G173000 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
7 Sobic.001G270500 - -
8 Sobic.002G161900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G090401 - -
10 Sobic.002G154551 - -
11 Sobic.008G015500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13093: HIV Tat-specific factor 1
12 Sobic.002G243900 - -
13 Sobic.004G007100 - -
14 Sobic.008G024600 expressed protein -
15 Sobic.007G072000 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
16 Sobic.009G221000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G020500 expressed protein K15198: BDP1, transcription factor TFIIIB component B''
18 Sobic.002G343800 - -
19 Sobic.003G438400 expressed protein -
20 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10


Gene co-expression network
sample Sobic006G021200 Sobic006G021200 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic006G021200--Sobic006G021250 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic006G021200--Sobic005G032800 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic006G021200--Sobic006G209850 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic006G021200--Sobic007G178700 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic006G021200--Sobic003G113200 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic006G021200--Sobic002G173000 Sobic001G270500 Sobic001G270500 Sobic006G021200--Sobic001G270500 Sobic002G161900 Sobic002G161900 Sobic006G021200--Sobic002G161900 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic006G021200--Sobic005G090401 Sobic006G021250--Sobic006G209850 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic006G021250--Sobic003G280800 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic006G021250--Sobic008G024600 Sobic006G021250--Sobic002G173000 Sobic006G021250--Sobic003G113200 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic006G021250--Sobic005G079025 Sobic006G021250--Sobic005G032800 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic006G021250--Sobic006G128900 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic006G021250--Sobic005G077466 Sobic005G032800--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic005G032800--Sobic001G474600 Sobic005G032800--Sobic002G173000 Sobic005G032800--Sobic006G021250 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G032800--Sobic002G134200 Sobic002G169633 Sobic002G169633 Sobic005G032800--Sobic002G169633 Sobic001G498600 Sobic001G498600 Sobic005G032800--Sobic001G498600 Sobic010G112000 Sobic010G112000 Sobic005G032800--Sobic010G112000 Sobic001G292200 Sobic001G292200 Sobic005G032800--Sobic001G292200 Sobic006G209850--Sobic006G128900 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic003G280800 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic006G209850--Sobic010G277500 Sobic006G209850--Sobic008G024600 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic006G209850--Sobic002G053000 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic006G209850--Sobic010G129200 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic006G209850--Sobic004G145500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic006G209850--Sobic002G243900 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic003G113200--Sobic006G128900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic006G021250 Sobic003G113200--Sobic003G280800 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic003G113200--Sobic005G039500 Sobic003G113200--Sobic007G178700 Sobic003G113200--Sobic006G209850 Sobic003G113200--Sobic008G024600 Sobic003G113200--Sobic005G032800 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic002G173000--Sobic006G182900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic002G173000--Sobic001G214300 Sobic002G173000--Sobic005G032800 Sobic002G173000--Sobic006G021250 Sobic010G248700 Sobic010G248700 Sobic002G173000--Sobic010G248700 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic002G173000--Sobic008G027000 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic002G173000--Sobic001G287201 Sobic001G318432 Sobic001G318432 Sobic002G173000--Sobic001G318432 Sobic002G173000--Sobic001G474600 Sobic001G270500--Sobic007G178700 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic001G270500--Sobic010G225226 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G270500--Sobic005G110427 Sobic001G270500--Sobic003G087400 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic001G270500--Sobic010G057700 Sobic001G270500--Sobic009G127900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G270500--Sobic006G009400 Sobic001G270500--Sobic005G077466 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic001G270500--Sobic001G272532 Sobic005G019600 Sobic005G019600 Sobic002G161900--Sobic005G019600 Sobic002G161900--Sobic010G112000 Sobic002G161900--Sobic002G173000 Sobic002G161900--Sobic005G032800 Sobic002G161900--Sobic001G474600 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic002G161900--Sobic009G221000 Sobic008G016300 Sobic008G016300 Sobic002G161900--Sobic008G016300 Sobic001G280900 Sobic001G280900 Sobic002G161900--Sobic001G280900 Sobic007G020500 Sobic007G020500 Sobic002G161900--Sobic007G020500 Sobic005G090401--Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic006G182900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G090401--Sobic006G048500 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic002G173000 Sobic005G090401--Sobic002G243900 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic005G090401--Sobic005G110200 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic005G032800
Octagon: transcription factors


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