Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G270500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QLE1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.001G270500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G178700 - -
2 Sobic.010G225226 - -
3 Sobic.005G110427 - -
4 Sobic.003G087400 - -
5 Sobic.010G057700 - -
6 Sobic.009G127900 - -
7 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G077466 - -
9 Sobic.001G272532 - -
10 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
11 Sobic.002G243900 - -
12 Sobic.005G055150 - -
13 Sobic.006G262200 - -
14 Sobic.009G239250 - -
15 Sobic.001G111900 - -
16 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
17 Sobic.009G104201 - -
18 Sobic.008G054500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G159900 DTA2, putative, expressed -
20 Sobic.003G176400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G270500 Sobic001G270500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G270500--Sobic007G178700 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic001G270500--Sobic010G225226 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G270500--Sobic005G110427 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic001G270500--Sobic003G087400 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic001G270500--Sobic010G057700 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic001G270500--Sobic009G127900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G270500--Sobic006G009400 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G270500--Sobic005G077466 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic001G270500--Sobic001G272532 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic010G225226--Sobic001G272532 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic010G225226--Sobic009G104201 Sobic003G020000 Sobic003G020000 Sobic010G225226--Sobic003G020000 Sobic001G288301 Sobic001G288301 Sobic010G225226--Sobic001G288301 Sobic010G225226--Sobic007G178700 Sobic010G225226--Sobic003G087400 Sobic010G225226--Sobic004G007100 Sobic003G176400 Sobic003G176400 Sobic010G225226--Sobic003G176400 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic010G225226--Sobic002G144966 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic003G087400--Sobic007G178700 Sobic003G087400--Sobic004G007100 Sobic003G087400--Sobic009G104201 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic003G087400--Sobic006G048500 Sobic003G087400--Sobic009G127900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G087400--Sobic002G006900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic003G087400--Sobic003G176500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G087400--Sobic010G056000 Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic003G087400--Sobic001G205200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic010G057700--Sobic001G128800 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic010G057700--Sobic005G141801 Sobic001G271900 Sobic001G271900 Sobic010G057700--Sobic001G271900 Sobic010G057700--Sobic006G009400 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic010G057700--Sobic006G088580 Sobic010G057700--Sobic007G178700 Sobic009G156000 Sobic009G156000 Sobic010G057700--Sobic009G156000 Sobic010G057700--Sobic010G225226 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic010G057700--Sobic003G113200 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic005G077466--Sobic003G268300 Sobic005G077466--Sobic001G111900 Sobic005G077466--Sobic007G178700 Sobic005G077466--Sobic001G420200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic005G077466--Sobic001G094000 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G077466--Sobic006G128900 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic005G077466--Sobic006G209850 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic005G077466--Sobic006G145000 Sobic005G077466--Sobic008G173900 Sobic001G272532--Sobic010G225226 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic001G272532--Sobic008G027000 Sobic001G272532--Sobic001G288301 Sobic001G272532--Sobic003G020000 Sobic001G272532--Sobic005G141801 Sobic001G272532--Sobic009G104201 Sobic001G272532--Sobic006G088580 Sobic001G272532--Sobic010G057700 Sobic001G272532--Sobic007G178700
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