Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G052900.1
Synonym Sb05g004280
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQ97
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g27590.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G147300 MYND finger family protein, expressed -
2 Sobic.005G035400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G209000 secretory protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G047200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G163950 - -
6 Sobic.003G188700 expressed protein -
7 Sobic.005G230800 SCARECROW, putative, expressed -
8 Sobic.010G043350 - -
9 Sobic.007G003250 - -
10 Sobic.010G263151 - -
11 Sobic.008G112700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G165925 - -
13 Sobic.003G360500 glycosyl transferase, putative, expressed K00750: GYG1, glycogenin
14 Sobic.010G272700 exo70 exocyst complex subunit family protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G196800 OsFBX177 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G199650 - -
17 Sobic.001G369701 - -
18 Sobic.006G007700 CAS1 domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G142550 - -
20 Sobic.006G045800 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G052900 Sobic005G052900 Sobic004G147300 Sobic004G147300 Sobic005G052900--Sobic004G147300 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic005G052900--Sobic005G035400 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic005G052900--Sobic001G209000 Sobic007G047200 Sobic007G047200 Sobic005G052900--Sobic007G047200 Sobic002G163950 Sobic002G163950 Sobic005G052900--Sobic002G163950 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic005G052900--Sobic003G188700 Sobic005G230800 Sobic005G230800 Sobic005G052900--Sobic005G230800 Sobic010G043350 Sobic010G043350 Sobic005G052900--Sobic010G043350 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic005G052900--Sobic007G003250 Sobic004G147300--Sobic005G035400 Sobic007G191150 Sobic007G191150 Sobic004G147300--Sobic007G191150 Sobic002G028901 Sobic002G028901 Sobic004G147300--Sobic002G028901 Sobic004G147300--Sobic001G209000 Sobic004G147300--Sobic003G188700 Sobic008G110151 Sobic008G110151 Sobic004G147300--Sobic008G110151 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic004G147300--Sobic010G263151 Sobic003G267400 Sobic003G267400 Sobic004G147300--Sobic003G267400 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic004G147300--Sobic006G196800 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic005G035400--Sobic010G165925 Sobic005G035400--Sobic010G263151 Sobic005G035400--Sobic006G196800 Sobic005G035400--Sobic007G003250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic005G035400--Sobic001G369701 Sobic005G035400--Sobic003G188700 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic005G035400--Sobic002G142550 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic005G035400--Sobic005G107250 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic005G035400--Sobic006G007700 Sobic001G209000--Sobic010G263151 Sobic001G209000--Sobic003G267400 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic001G209000--Sobic001G355850 Sobic001G209000--Sobic006G196800 Sobic003G419100 Sobic003G419100 Sobic001G209000--Sobic003G419100 Sobic001G209000--Sobic003G188700 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic001G209000--Sobic003G008400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic001G209000--Sobic003G254400 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic001G209000--Sobic003G318600 Sobic009G240100 Sobic009G240100 Sobic007G047200--Sobic009G240100 Sobic006G252532 Sobic006G252532 Sobic007G047200--Sobic006G252532 Sobic003G124900 Sobic003G124900 Sobic007G047200--Sobic003G124900 Sobic003G380700 Sobic003G380700 Sobic007G047200--Sobic003G380700 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic007G047200--Sobic003G059600 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic007G047200--Sobic004G279900 Sobic006G130700 Sobic006G130700 Sobic007G047200--Sobic006G130700 Sobic007G047200--Sobic010G043350 Sobic003G199650 Sobic003G199650 Sobic007G047200--Sobic003G199650 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic002G163950--Sobic008G157400 Sobic002G163950--Sobic001G209000 Sobic002G163950--Sobic003G318600 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic002G163950--Sobic009G190100 Sobic002G163950--Sobic003G008400 Sobic002G163950--Sobic003G254400 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic002G163950--Sobic005G080075 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic002G163950--Sobic003G360500 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic002G163950--Sobic001G100650 Sobic003G188700--Sobic010G263151 Sobic003G188700--Sobic006G196800 Sobic003G188700--Sobic010G165925 Sobic003G188700--Sobic007G003250 Sobic003G188700--Sobic003G267400 Sobic003G188700--Sobic001G369701 Sobic003G188700--Sobic006G007700 Sobic003G188700--Sobic003G419100 Sobic003G188700--Sobic001G209000 Sobic005G230800--Sobic005G035400 Sobic005G230800--Sobic010G263151 Sobic005G230800--Sobic010G165925 Sobic005G230800--Sobic001G209000 Sobic005G230800--Sobic003G267400 Sobic005G230800--Sobic006G196800 Sobic005G230800--Sobic007G003250 Sobic005G230800--Sobic003G188700 Sobic005G230800--Sobic001G369701 Sobic010G043350--Sobic003G360500 Sobic010G043350--Sobic003G254400 Sobic005G057500 Sobic005G057500 Sobic010G043350--Sobic005G057500 Sobic010G043350--Sobic003G008400 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic010G043350--Sobic008G191800 Sobic010G043350--Sobic005G080075 Sobic010G043350--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic010G043350--Sobic010G064050 Sobic010G043350--Sobic003G188700 Sobic007G003250--Sobic010G165925 Sobic007G003250--Sobic001G369701 Sobic007G003250--Sobic005G107250 Sobic007G003250--Sobic002G142550 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic007G003250--Sobic003G025500 Sobic007G003250--Sobic006G196800 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic007G003250--Sobic001G115200 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic007G003250--Sobic010G180300 Sobic007G003250--Sobic010G263151
Octagon: transcription factors


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