Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G083700.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt -
Pfam -
Panther DB PTHR24177 PTHR24177:SF38
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G15500 : Ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g14570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G218600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G218201 - -
3 Sobic.003G317800 lysM domain containing protein, putative -
4 Sobic.004G038300 cycloartenol synthase, putative, expressed -
5 Sobic.008G163200 OsSCP9 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
6 Sobic.003G068300 transferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G415300 - -
8 Sobic.004G328900 expressed protein -
9 Sobic.005G218400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G060700 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
11 Sobic.002G415400 - -
12 Sobic.002G416950 - -
13 Sobic.001G379300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.001G255300 Protein tyrosine decarboxylase 4 (OS)(PubMedID : 27208977)@decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
15 Sobic.001G435600 - -
16 Sobic.009G215600 expressed protein -
17 Sobic.002G128600 lecithin:cholesterol acyltransferase, putative, expressed K06129: lysophospholipase III
18 Sobic.005G190800 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed K05928: tocopherol O-methyltransferase
19 Sobic.004G019300 terpene synthase, putative, expressed K15086: (3S)-linalool synthase
20 Sobic.006G238100 LTPL126 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G083700 Sobic005G083700 Sobic005G218600 Sobic005G218600 Sobic005G083700--Sobic005G218600 Sobic005G218201 Sobic005G218201 Sobic005G083700--Sobic005G218201 Sobic003G317800 Sobic003G317800 Sobic005G083700--Sobic003G317800 Sobic004G038300 Sobic004G038300 Sobic005G083700--Sobic004G038300 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic005G083700--Sobic008G163200 Sobic003G068300 Sobic003G068300 Sobic005G083700--Sobic003G068300 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic005G083700--Sobic002G415300 Sobic004G328900 Sobic004G328900 Sobic005G083700--Sobic004G328900 Sobic005G218400 Sobic005G218400 Sobic005G083700--Sobic005G218400 Sobic005G218600--Sobic005G218201 Sobic005G218600--Sobic004G038300 Sobic001G255300 Sobic001G255300 Sobic005G218600--Sobic001G255300 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic005G218600--Sobic001G379300 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic005G218600--Sobic006G238100 Sobic004G044200 Sobic004G044200 Sobic005G218600--Sobic004G044200 Sobic002G209800 Sobic002G209800 Sobic005G218600--Sobic002G209800 Sobic005G218600--Sobic008G163200 Sobic005G218600--Sobic003G068300 Sobic005G218201--Sobic005G218600 Sobic005G218201--Sobic004G044200 Sobic005G218201--Sobic002G209800 Sobic005G218201--Sobic004G038300 Sobic003G120500 Sobic003G120500 Sobic005G218201--Sobic003G120500 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic005G218201--Sobic005G200600 Sobic005G218201--Sobic006G238100 Sobic001G541300 Sobic001G541300 Sobic005G218201--Sobic001G541300 Sobic005G218201--Sobic001G255300 Sobic003G317800--Sobic004G328900 Sobic002G128600 Sobic002G128600 Sobic003G317800--Sobic002G128600 Sobic003G317800--Sobic001G379300 Sobic003G317800--Sobic001G255300 Sobic003G317800--Sobic008G163200 Sobic003G317800--Sobic004G038300 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic003G317800--Sobic002G416950 Sobic003G007800 Sobic003G007800 Sobic003G317800--Sobic003G007800 Sobic007G069500 Sobic007G069500 Sobic003G317800--Sobic007G069500 Sobic004G038300--Sobic003G317800 Sobic004G038300--Sobic001G255300 Sobic004G038300--Sobic004G328900 Sobic004G038300--Sobic002G128600 Sobic004G038300--Sobic001G379300 Sobic005G190800 Sobic005G190800 Sobic004G038300--Sobic005G190800 Sobic004G038300--Sobic006G238100 Sobic004G038300--Sobic002G209800 Sobic004G038300--Sobic003G007800 Sobic008G163200--Sobic002G415300 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic008G163200--Sobic004G060700 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic008G163200--Sobic002G415400 Sobic008G163200--Sobic002G416950 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic008G163200--Sobic007G170800 Sobic008G163200--Sobic003G068300 Sobic008G163200--Sobic001G379300 Sobic008G163200--Sobic001G255300 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic008G163200--Sobic001G435600 Sobic003G068300--Sobic002G415300 Sobic003G068300--Sobic002G415400 Sobic003G068300--Sobic008G163200 Sobic003G068300--Sobic001G255300 Sobic009G206000 Sobic009G206000 Sobic003G068300--Sobic009G206000 Sobic003G068300--Sobic004G060700 Sobic003G068300--Sobic006G238100 Sobic003G068300--Sobic002G416950 Sobic003G068300--Sobic004G328900 Sobic002G415300--Sobic002G415400 Sobic002G415300--Sobic004G060700 Sobic002G415300--Sobic008G163200 Sobic002G415300--Sobic001G435600 Sobic002G415300--Sobic003G068300 Sobic002G415300--Sobic002G416950 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic002G415300--Sobic009G115050 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic002G415300--Sobic002G329500 Sobic002G415300--Sobic007G170800 Sobic004G328900--Sobic003G317800 Sobic004G328900--Sobic001G255300 Sobic004G328900--Sobic001G379300 Sobic004G328900--Sobic008G163200 Sobic004G328900--Sobic002G416950 Sobic004G328900--Sobic002G128600 Sobic004G328900--Sobic006G238100 Sobic004G328900--Sobic003G007800 Sobic004G328900--Sobic003G068300 Sobic005G218400--Sobic005G218201 Sobic006G263800 Sobic006G263800 Sobic005G218400--Sobic006G263800 Sobic005G141000 Sobic005G141000 Sobic005G218400--Sobic005G141000 Sobic002G065400 Sobic002G065400 Sobic005G218400--Sobic002G065400 Sobic005G218400--Sobic005G218600 Sobic008G130700 Sobic008G130700 Sobic005G218400--Sobic008G130700 Sobic004G253800 Sobic004G253800 Sobic005G218400--Sobic004G253800 Sobic002G190100 Sobic002G190100 Sobic005G218400--Sobic002G190100 Sobic006G281066 Sobic006G281066 Sobic005G218400--Sobic006G281066
Octagon: transcription factors


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