Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G215600.1
Synonym Sb09g027100
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YUW0
Pfam -
Panther DB PTHR34467 PTHR34467:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g46470.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G141100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.008G163200 OsSCP9 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
3 Sobic.004G038300 cycloartenol synthase, putative, expressed -
4 Sobic.002G209800 ZOS9-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
5 Sobic.002G416950 - -
6 Sobic.004G300800 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
7 Sobic.004G060700 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
8 Sobic.001G379300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
9 Sobic.002G415300 - -
10 Sobic.001G255300 Protein tyrosine decarboxylase 4 (OS)(PubMedID : 27208977)@decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
11 Sobic.009G119400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
12 Sobic.004G249400 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
13 Sobic.004G328900 expressed protein -
14 Sobic.007G170800 Fatty acyl CoA reductase 1 FAR1 (At)(PubMedID : 27208977)@male sterility protein 2, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
15 Sobic.003G068300 transferase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G238100 LTPL126 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.001G435600 - -
18 Sobic.007G009600 expressed protein -
19 Sobic.002G415400 - -
20 Sobic.003G317800 lysM domain containing protein, putative -


Gene co-expression network
sample Sobic009G215600 Sobic009G215600 Sobic002G141100 Sobic002G141100 Sobic009G215600--Sobic002G141100 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic009G215600--Sobic008G163200 Sobic004G038300 Sobic004G038300 Sobic009G215600--Sobic004G038300 Sobic002G209800 Sobic002G209800 Sobic009G215600--Sobic002G209800 Sobic002G416950 Sobic002G416950 Sobic009G215600--Sobic002G416950 Sobic004G300800 Sobic004G300800 Sobic009G215600--Sobic004G300800 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic009G215600--Sobic004G060700 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic009G215600--Sobic001G379300 Sobic002G415300 Sobic002G415300 Sobic009G215600--Sobic002G415300 Sobic001G541300 Sobic001G541300 Sobic002G141100--Sobic001G541300 Sobic005G200600 Sobic005G200600 Sobic002G141100--Sobic005G200600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic002G141100--Sobic007G170800 Sobic002G141100--Sobic004G060700 Sobic002G141100--Sobic002G416950 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic002G141100--Sobic006G238100 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic002G141100--Sobic007G009600 Sobic003G114200 Sobic003G114200 Sobic002G141100--Sobic003G114200 Sobic002G141100--Sobic001G379300 Sobic008G163200--Sobic002G415300 Sobic008G163200--Sobic004G060700 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic008G163200--Sobic002G415400 Sobic008G163200--Sobic002G416950 Sobic008G163200--Sobic007G170800 Sobic003G068300 Sobic003G068300 Sobic008G163200--Sobic003G068300 Sobic008G163200--Sobic001G379300 Sobic001G255300 Sobic001G255300 Sobic008G163200--Sobic001G255300 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic008G163200--Sobic001G435600 Sobic003G317800 Sobic003G317800 Sobic004G038300--Sobic003G317800 Sobic004G038300--Sobic001G255300 Sobic004G328900 Sobic004G328900 Sobic004G038300--Sobic004G328900 Sobic002G128600 Sobic002G128600 Sobic004G038300--Sobic002G128600 Sobic004G038300--Sobic001G379300 Sobic005G190800 Sobic005G190800 Sobic004G038300--Sobic005G190800 Sobic004G038300--Sobic006G238100 Sobic004G038300--Sobic002G209800 Sobic003G007800 Sobic003G007800 Sobic004G038300--Sobic003G007800 Sobic002G209800--Sobic004G038300 Sobic002G209800--Sobic006G238100 Sobic004G249400 Sobic004G249400 Sobic002G209800--Sobic004G249400 Sobic002G209800--Sobic009G215600 Sobic002G209800--Sobic001G255300 Sobic005G218600 Sobic005G218600 Sobic002G209800--Sobic005G218600 Sobic002G209800--Sobic005G200600 Sobic002G209800--Sobic001G379300 Sobic002G209800--Sobic002G141100 Sobic002G416950--Sobic004G060700 Sobic002G416950--Sobic001G379300 Sobic002G416950--Sobic002G415300 Sobic002G416950--Sobic006G238100 Sobic002G416950--Sobic007G009600 Sobic002G416950--Sobic001G435600 Sobic002G416950--Sobic008G163200 Sobic002G416950--Sobic007G170800 Sobic002G416950--Sobic002G415400 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic004G300800--Sobic009G059100 Sobic004G300800--Sobic009G215600 Sobic001G366500 Sobic001G366500 Sobic004G300800--Sobic001G366500 Sobic004G300800--Sobic004G249400 Sobic001G453200 Sobic001G453200 Sobic004G300800--Sobic001G453200 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic004G300800--Sobic006G172700 Sobic004G300800--Sobic005G200600 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic004G300800--Sobic002G020100 Sobic003G120500 Sobic003G120500 Sobic004G300800--Sobic003G120500 Sobic004G060700--Sobic002G416950 Sobic004G060700--Sobic002G415300 Sobic004G060700--Sobic007G170800 Sobic004G060700--Sobic007G009600 Sobic004G060700--Sobic008G163200 Sobic004G060700--Sobic002G415400 Sobic004G060700--Sobic001G435600 Sobic004G060700--Sobic006G238100 Sobic004G060700--Sobic001G379300 Sobic001G379300--Sobic006G238100 Sobic001G379300--Sobic002G416950 Sobic001G379300--Sobic001G255300 Sobic001G379300--Sobic004G328900 Sobic001G379300--Sobic003G317800 Sobic001G379300--Sobic004G060700 Sobic001G379300--Sobic007G009600 Sobic001G379300--Sobic008G163200 Sobic007G069500 Sobic007G069500 Sobic001G379300--Sobic007G069500 Sobic002G415300--Sobic002G415400 Sobic002G415300--Sobic004G060700 Sobic002G415300--Sobic008G163200 Sobic002G415300--Sobic001G435600 Sobic002G415300--Sobic003G068300 Sobic002G415300--Sobic002G416950 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic002G415300--Sobic009G115050 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic002G415300--Sobic002G329500 Sobic002G415300--Sobic007G170800
Octagon: transcription factors


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