Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G019400.1
Synonym RKP
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PJI7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G22010 : related to KPC1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g43380.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048826
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G197500 - -
2 Sobic.001G192750 - -
3 Sobic.008G020400 - -
4 Sobic.001G267400 - -
5 Sobic.009G066850 - -
6 Sobic.008G085600 - -
7 Sobic.001G543000 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
8 Sobic.002G231700 - -
9 Sobic.007G006350 - -
10 Sobic.004G067850 - -
11 Sobic.008G032850 - -
12 Sobic.010G158601 - -
13 Sobic.001G255500 - -
14 Sobic.009G168700 ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
15 Sobic.002G302400 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.010G062950 - -
17 Sobic.007G154901 - K01674: carbonic anhydrase
18 Sobic.001G084200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G082200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed -
20 Sobic.002G057550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G019400 Sobic006G019400 Sobic009G197500 Sobic009G197500 Sobic006G019400--Sobic009G197500 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic006G019400--Sobic001G192750 Sobic008G020400 Sobic008G020400 Sobic006G019400--Sobic008G020400 Sobic001G267400 Sobic001G267400 Sobic006G019400--Sobic001G267400 Sobic009G066850 Sobic009G066850 Sobic006G019400--Sobic009G066850 Sobic008G085600 Sobic008G085600 Sobic006G019400--Sobic008G085600 Sobic001G543000 Sobic001G543000 Sobic006G019400--Sobic001G543000 Sobic002G231700 Sobic002G231700 Sobic006G019400--Sobic002G231700 Sobic007G006350 Sobic007G006350 Sobic006G019400--Sobic007G006350 Sobic009G197500--Sobic001G192750 Sobic009G197500--Sobic006G019400 Sobic009G197500--Sobic007G006350 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic009G197500--Sobic009G168700 Sobic010G043500 Sobic010G043500 Sobic009G197500--Sobic010G043500 Sobic009G197500--Sobic009G066850 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic009G197500--Sobic001G084200 Sobic009G197500--Sobic008G085600 Sobic004G067850 Sobic004G067850 Sobic009G197500--Sobic004G067850 Sobic001G192750--Sobic009G066850 Sobic001G192750--Sobic004G067850 Sobic008G032850 Sobic008G032850 Sobic001G192750--Sobic008G032850 Sobic001G192750--Sobic001G084200 Sobic001G192750--Sobic009G168700 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic001G192750--Sobic006G138966 Sobic002G302400 Sobic002G302400 Sobic001G192750--Sobic002G302400 Sobic008G192100 Sobic008G192100 Sobic001G192750--Sobic008G192100 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic001G192750--Sobic001G272300 Sobic003G051300 Sobic003G051300 Sobic008G020400--Sobic003G051300 Sobic008G020400--Sobic001G267400 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic008G020400--Sobic003G291050 Sobic008G020400--Sobic008G085600 Sobic004G082200 Sobic004G082200 Sobic008G020400--Sobic004G082200 Sobic007G053000 Sobic007G053000 Sobic008G020400--Sobic007G053000 Sobic007G154901 Sobic007G154901 Sobic008G020400--Sobic007G154901 Sobic008G020400--Sobic009G066850 Sobic002G057550 Sobic002G057550 Sobic008G020400--Sobic002G057550 Sobic001G267400--Sobic007G006350 Sobic001G267400--Sobic004G082200 Sobic001G267400--Sobic007G154901 Sobic001G255500 Sobic001G255500 Sobic001G267400--Sobic001G255500 Sobic001G267400--Sobic001G272300 Sobic009G066850--Sobic002G057550 Sobic009G066850--Sobic002G302400 Sobic009G066850--Sobic008G192100 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic009G066850--Sobic007G100275 Sobic009G147100 Sobic009G147100 Sobic009G066850--Sobic009G147100 Sobic009G066850--Sobic009G168700 Sobic009G150100 Sobic009G150100 Sobic009G066850--Sobic009G150100 SobicK042700 SobicK042700 Sobic009G066850--SobicK042700 Sobic003G091100 Sobic003G091100 Sobic009G066850--Sobic003G091100 Sobic002G342200 Sobic002G342200 Sobic008G085600--Sobic002G342200 Sobic008G085600--Sobic009G066850 Sobic008G085600--Sobic009G147100 Sobic004G048600 Sobic004G048600 Sobic008G085600--Sobic004G048600 Sobic008G085600--Sobic003G291050 Sobic008G085600--Sobic002G302400 Sobic010G158601 Sobic010G158601 Sobic008G085600--Sobic010G158601 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic008G085600--Sobic010G262650 Sobic008G085600--Sobic007G100275 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic001G543000--Sobic008G192200 Sobic001G543000--Sobic001G272300 Sobic002G231700--Sobic001G543000 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic002G231700--Sobic004G026900 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G231700--Sobic001G025201 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic002G231700--Sobic003G286650 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic002G231700--Sobic003G353050 Sobic002G231700--Sobic004G082200 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic002G231700--Sobic003G318400 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic002G231700--Sobic004G061300 Sobic009G235801 Sobic009G235801 Sobic002G231700--Sobic009G235801 Sobic007G006350--Sobic001G267400 Sobic007G006350--Sobic001G272300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.