Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G094201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKZ6
Pfam PF00161
Panther DB PTHR23160 PTHR23160:SF3
NCBI CDD KOG0978; E3 ubiquitin ligase involved in syntaxin degradation
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0017148; negative regulation of translation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G22260 : Myosin heavy chain-related protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g37960.1 : synaptonemal complex protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056186
Brachypodium KQJ82914 , KQJ82913
Barley -
Wheat TraesCS2D02G318100 , TraesCS2D02G318100 , TraesCS2D02G318100 , TraesCS2D02G318100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G137500 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
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3 Sobic.007G175500 expressed protein -
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5 Sobic.007G203600 transferase family protein, putative, expressed -
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13 Sobic.003G268500 - -
14 Sobic.003G254400 expressed protein -
15 Sobic.005G080075 - -
16 Sobic.001G355850 - -
17 Sobic.001G100650 - -
18 Sobic.010G064050 - -
19 Sobic.003G318600 - -
20 Sobic.003G360500 glycosyl transferase, putative, expressed K00750: GYG1, glycogenin


Gene co-expression network
sample Sobic006G094201 Sobic006G094201 Sobic010G137500 Sobic010G137500 Sobic006G094201--Sobic010G137500 Sobic001G250150 Sobic001G250150 Sobic006G094201--Sobic001G250150 Sobic007G175500 Sobic007G175500 Sobic006G094201--Sobic007G175500 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic006G094201--Sobic001G369550 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic006G094201--Sobic007G203600 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic006G094201--Sobic009G028650 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic006G094201--Sobic001G461101 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic006G094201--Sobic010G263151 Sobic006G146150 Sobic006G146150 Sobic006G094201--Sobic006G146150 Sobic010G137500--Sobic001G250150 Sobic010G137500--Sobic007G175500 Sobic010G079150 Sobic010G079150 Sobic010G137500--Sobic010G079150 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic010G137500--Sobic010G165925 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic010G137500--Sobic005G107250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic010G137500--Sobic001G369701 Sobic007G003250 Sobic007G003250 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Octagon: transcription factors


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