Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G198900.1
Synonym Sb06g027100
Functional annotation PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YF16
Pfam PF01535
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF562
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03560 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20354.1 : PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056902
Brachypodium KQJ83160
Barley HORVU1Hr1G010220.3 , HORVU1Hr1G010220.1 , HORVU1Hr1G010220.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.010G165925 - -
20 Sobic.009G200750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G198900 Sobic006G198900 Sobic004G012250 Sobic004G012250 Sobic006G198900--Sobic004G012250 Sobic010G040300 Sobic010G040300 Sobic006G198900--Sobic010G040300 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic006G198900--Sobic005G019650 Sobic003G324900 Sobic003G324900 Sobic006G198900--Sobic003G324900 Sobic008G112700 Sobic008G112700 Sobic006G198900--Sobic008G112700 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic006G198900--Sobic010G180300 Sobic010G116200 Sobic010G116200 Sobic006G198900--Sobic010G116200 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic006G198900--Sobic003G294550 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic006G198900--Sobic006G185150 Sobic002G146701 Sobic002G146701 Sobic004G012250--Sobic002G146701 Sobic004G012250--Sobic010G040300 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic004G012250--Sobic008G135401 Sobic009G248700 Sobic009G248700 Sobic004G012250--Sobic009G248700 Sobic004G012250--Sobic006G185150 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic004G012250--Sobic004G300400 Sobic004G012250--Sobic005G019650 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic004G012250--Sobic006G024101 Sobic004G012250--Sobic003G294550 Sobic010G040300--Sobic010G180300 Sobic010G040300--Sobic006G024101 Sobic010G040300--Sobic003G294550 Sobic010G040300--Sobic006G185150 Sobic010G040300--Sobic005G019650 Sobic010G040300--Sobic004G300400 Sobic010G040300--Sobic008G135401 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic010G040300--Sobic005G107250 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic010G040300--Sobic010G263051 Sobic005G019650--Sobic006G185150 Sobic005G019650--Sobic006G024101 Sobic005G019650--Sobic010G180300 Sobic005G019650--Sobic005G107250 Sobic005G019650--Sobic003G294550 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic005G019650--Sobic001G115200 Sobic005G019650--Sobic010G263051 Sobic005G019650--Sobic008G135401 Sobic005G019650--Sobic004G300400 Sobic001G476201 Sobic001G476201 Sobic003G324900--Sobic001G476201 Sobic003G324900--Sobic006G024101 Sobic003G324900--Sobic005G019650 Sobic003G324900--Sobic006G185150 Sobic003G324900--Sobic010G263051 Sobic003G324900--Sobic004G300400 Sobic003G324900--Sobic010G180300 Sobic003G324900--Sobic003G294550 Sobic003G324900--Sobic008G135401 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic008G112700--Sobic010G165925 Sobic008G112700--Sobic005G107250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic008G112700--Sobic001G369701 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic008G112700--Sobic007G003250 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic008G112700--Sobic002G142550 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic008G112700--Sobic006G196800 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic008G112700--Sobic003G025500 Sobic003G199650 Sobic003G199650 Sobic008G112700--Sobic003G199650 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic008G112700--Sobic010G263151 Sobic010G180300--Sobic005G019650 Sobic010G180300--Sobic005G107250 Sobic010G180300--Sobic006G024101 Sobic010G180300--Sobic006G185150 Sobic010G180300--Sobic001G115200 Sobic010G180300--Sobic003G294550 Sobic010G180300--Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic002G142550 Sobic010G180300--Sobic010G263051 Sobic010G116200--Sobic010G180300 Sobic010G116200--Sobic005G019650 Sobic010G116200--Sobic006G024101 Sobic010G116200--Sobic006G185150 Sobic010G116200--Sobic002G142550 Sobic010G116200--Sobic003G294550 Sobic010G116200--Sobic005G107250 Sobic010G116200--Sobic008G135401 Sobic001G310400 Sobic001G310400 Sobic010G116200--Sobic001G310400 Sobic003G294550--Sobic006G185150 Sobic003G294550--Sobic006G024101 Sobic003G294550--Sobic005G019650 Sobic003G294550--Sobic004G300400 Sobic003G294550--Sobic010G180300 Sobic003G294550--Sobic002G146701 Sobic003G294550--Sobic008G135401 Sobic003G294550--Sobic010G263051 Sobic001G013701 Sobic001G013701 Sobic003G294550--Sobic001G013701 Sobic006G185150--Sobic005G019650 Sobic006G185150--Sobic006G024101 Sobic006G185150--Sobic003G294550 Sobic006G185150--Sobic010G180300 Sobic006G185150--Sobic004G300400 Sobic006G185150--Sobic001G115200 Sobic006G185150--Sobic010G263051 Sobic006G185150--Sobic005G107250 Sobic006G185150--Sobic008G135401
Octagon: transcription factors


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