Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G040300.2
Synonym Sb10g003570
Functional annotation conserved hypothetical protein
UniProt A0A1W0VRD8
Pfam -
Panther DB PTHR33889 PTHR33889:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g24840.1 : conserved hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G180300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G024101 - -
3 Sobic.003G294550 - -
4 Sobic.006G185150 - -
5 Sobic.005G019650 - -
6 Sobic.004G300400 - -
7 Sobic.008G135401 - -
8 Sobic.005G107250 - -
9 Sobic.010G263051 - -
10 Sobic.002G146701 - -
11 Sobic.001G115200 - -
12 Sobic.004G217400 expressed protein -
13 Sobic.004G337132 - -
14 Sobic.010G116200 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G142550 - -
16 Sobic.001G013701 - -
17 Sobic.007G151900 expressed protein -
18 Sobic.003G025500 ZOS8-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.004G007550 - -
20 Sobic.006G244900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G040300 Sobic010G040300 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic010G040300--Sobic010G180300 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic010G040300--Sobic006G024101 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic010G040300--Sobic003G294550 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic010G040300--Sobic006G185150 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic010G040300--Sobic005G019650 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic010G040300--Sobic004G300400 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic010G040300--Sobic008G135401 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic010G040300--Sobic005G107250 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic010G040300--Sobic010G263051 Sobic010G180300--Sobic005G019650 Sobic010G180300--Sobic005G107250 Sobic010G180300--Sobic006G024101 Sobic010G180300--Sobic006G185150 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic010G180300--Sobic001G115200 Sobic010G180300--Sobic003G294550 Sobic010G180300--Sobic008G135401 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic010G180300--Sobic002G142550 Sobic010G180300--Sobic010G263051 Sobic006G024101--Sobic006G185150 Sobic006G024101--Sobic005G019650 Sobic006G024101--Sobic010G180300 Sobic006G024101--Sobic003G294550 Sobic002G146701 Sobic002G146701 Sobic006G024101--Sobic002G146701 Sobic006G024101--Sobic004G300400 Sobic006G024101--Sobic001G115200 Sobic006G024101--Sobic005G107250 Sobic006G024101--Sobic008G135401 Sobic003G294550--Sobic006G185150 Sobic003G294550--Sobic006G024101 Sobic003G294550--Sobic005G019650 Sobic003G294550--Sobic004G300400 Sobic003G294550--Sobic010G180300 Sobic003G294550--Sobic002G146701 Sobic003G294550--Sobic008G135401 Sobic003G294550--Sobic010G263051 Sobic001G013701 Sobic001G013701 Sobic003G294550--Sobic001G013701 Sobic006G185150--Sobic005G019650 Sobic006G185150--Sobic006G024101 Sobic006G185150--Sobic003G294550 Sobic006G185150--Sobic010G180300 Sobic006G185150--Sobic004G300400 Sobic006G185150--Sobic001G115200 Sobic006G185150--Sobic010G263051 Sobic006G185150--Sobic005G107250 Sobic006G185150--Sobic008G135401 Sobic005G019650--Sobic006G185150 Sobic005G019650--Sobic006G024101 Sobic005G019650--Sobic010G180300 Sobic005G019650--Sobic005G107250 Sobic005G019650--Sobic003G294550 Sobic005G019650--Sobic001G115200 Sobic005G019650--Sobic010G263051 Sobic005G019650--Sobic008G135401 Sobic005G019650--Sobic004G300400 Sobic007G151900 Sobic007G151900 Sobic004G300400--Sobic007G151900 Sobic004G300400--Sobic003G294550 Sobic004G337132 Sobic004G337132 Sobic004G300400--Sobic004G337132 Sobic004G300400--Sobic006G185150 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic004G300400--Sobic004G007550 Sobic004G217400 Sobic004G217400 Sobic004G300400--Sobic004G217400 Sobic004G300400--Sobic006G024101 Sobic004G300400--Sobic002G146701 Sobic006G244900 Sobic006G244900 Sobic004G300400--Sobic006G244900 Sobic008G135401--Sobic006G185150 Sobic008G135401--Sobic005G019650 Sobic008G135401--Sobic006G024101 Sobic008G135401--Sobic010G180300 Sobic008G135401--Sobic003G294550 Sobic008G135401--Sobic002G146701 Sobic008G135401--Sobic005G107250 Sobic008G135401--Sobic001G115200 Sobic008G135401--Sobic010G263051 Sobic005G107250--Sobic002G142550 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic005G107250--Sobic010G165925 Sobic005G107250--Sobic010G180300 Sobic005G107250--Sobic001G115200 Sobic005G107250--Sobic005G019650 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic005G107250--Sobic001G369701 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic005G107250--Sobic007G003250 Sobic005G107250--Sobic006G185150 Sobic005G107250--Sobic006G024101 Sobic010G263051--Sobic006G185150 Sobic010G263051--Sobic005G019650 Sobic010G263051--Sobic006G024101 Sobic010G263051--Sobic010G180300 Sobic010G263051--Sobic003G294550 Sobic010G263051--Sobic001G115200 Sobic010G263051--Sobic005G107250 Sobic010G263051--Sobic004G300400 Sobic010G263051--Sobic008G135401
Octagon: transcription factors


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