Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G227700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PNE0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G301250 - -
2 Sobic.003G192500 - -
3 Sobic.001G314350 - -
4 Sobic.009G102550 - -
5 Sobic.010G246800 - -
6 Sobic.004G303466 - K02256: cytochrome c oxidase subunit 1
7 Sobic.010G120900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G073232 - -
9 Sobic.002G190600 - -
10 Sobic.003G123900 expressed protein -
11 Sobic.002G087700 - -
12 Sobic.001G152150 - -
13 Sobic.004G206050 - -
14 Sobic.007G202360 - -
15 Sobic.006G210266 - -
16 Sobic.001G505066 - -
17 Sobic.001G143850 - -
18 Sobic.008G040201 - K13100: pre-mRNA-splicing factor CWC22
19 Sobic.005G119250 - -
20 Sobic.005G122000 LGC1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G227700 Sobic006G227700 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic006G227700--Sobic004G301250 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic006G227700--Sobic003G192500 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic006G227700--Sobic001G314350 Sobic009G102550 Sobic009G102550 Sobic006G227700--Sobic009G102550 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic006G227700--Sobic010G246800 Sobic004G303466 Sobic004G303466 Sobic006G227700--Sobic004G303466 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic006G227700--Sobic010G120900 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic006G227700--Sobic004G073232 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic006G227700--Sobic002G190600 Sobic004G301250--Sobic003G192500 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic004G301250--Sobic003G123900 Sobic004G301250--Sobic009G102550 Sobic004G301250--Sobic002G190600 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic004G301250--Sobic007G202360 Sobic004G301250--Sobic004G073232 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic004G301250--Sobic006G202900 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic004G301250--Sobic005G119250 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic004G301250--Sobic005G065050 Sobic003G192500--Sobic002G190600 Sobic003G192500--Sobic007G202360 Sobic003G192500--Sobic004G301250 Sobic003G192500--Sobic010G120900 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic003G192500--Sobic002G087700 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic003G192500--Sobic001G505066 Sobic003G192500--Sobic003G123900 Sobic003G192500--Sobic006G202900 Sobic003G192500--Sobic004G073232 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic001G314350--Sobic003G116200 Sobic001G314350--Sobic004G073232 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic001G314350--Sobic006G210266 Sobic001G314350--Sobic010G246800 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic001G314350--Sobic002G312550 Sobic002G104450 Sobic002G104450 Sobic001G314350--Sobic002G104450 Sobic001G314350--Sobic010G120900 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic001G314350--Sobic006G243300 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic001G314350--Sobic001G152150 Sobic009G102550--Sobic001G152150 Sobic009G102550--Sobic004G073232 Sobic009G102550--Sobic004G301250 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic009G102550--Sobic008G040201 Sobic009G217450 Sobic009G217450 Sobic009G102550--Sobic009G217450 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic009G102550--Sobic004G103450 Sobic009G102550--Sobic001G314350 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic009G102550--Sobic001G291701 Sobic009G102550--Sobic003G123900 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic010G246800--Sobic009G178650 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic010G246800--Sobic009G077901 Sobic010G246800--Sobic003G116200 Sobic010G246800--Sobic001G314350 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic010G246800--Sobic001G308350 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic010G246800--Sobic001G143850 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic010G246800--Sobic009G053700 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic010G246800--Sobic010G214150 Sobic010G246800--Sobic002G312550 Sobic005G065800 Sobic005G065800 Sobic004G303466--Sobic005G065800 Sobic004G303466--Sobic010G214150 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic004G303466--Sobic008G040501 Sobic004G303466--Sobic002G312550 Sobic004G206050 Sobic004G206050 Sobic004G303466--Sobic004G206050 Sobic004G303466--Sobic004G073232 Sobic004G303466--Sobic001G314350 Sobic004G303466--Sobic010G246800 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic004G303466--Sobic004G126050 Sobic010G120900--Sobic001G505066 Sobic010G120900--Sobic003G192500 Sobic010G120900--Sobic003G116200 Sobic010G120900--Sobic002G190600 Sobic010G120900--Sobic007G202360 Sobic010G120900--Sobic001G314350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic010G120900--Sobic005G122000 Sobic010G120900--Sobic010G246800 Sobic010G120900--Sobic003G123900 Sobic004G073232--Sobic004G103450 Sobic004G073232--Sobic001G314350 Sobic004G073232--Sobic009G102550 Sobic004G073232--Sobic001G152150 Sobic004G073232--Sobic003G192500 Sobic004G073232--Sobic001G291701 Sobic004G073232--Sobic008G040201 Sobic004G073232--Sobic004G301250 Sobic004G073232--Sobic009G217450 Sobic002G190600--Sobic003G192500 Sobic002G190600--Sobic005G065050 Sobic002G190600--Sobic001G505066 Sobic002G190600--Sobic005G119250 Sobic002G190600--Sobic007G202360 Sobic002G190600--Sobic006G202900 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic002G190600--Sobic008G007500 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic002G190600--Sobic010G193100 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic002G190600--Sobic001G423666
Octagon: transcription factors


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