Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G242701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RFC7
Pfam -
Panther DB PTHR33191 PTHR33191:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g42450.1 : RIPER1 - Ripening-related family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009514 , Zm00025a057224 , Zm00025a009513
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G003410.2 , HORVU6Hr1G003410.1
Wheat TraesCS1B02G183900 , TraesCS6A02G018800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G185300 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
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3 Sobic.005G049100 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
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12 Sobic.003G148950 - -
13 Sobic.002G018800 expressed protein -
14 Sobic.005G161750 - -
15 Sobic.006G060400 expressed protein -
16 Sobic.006G250350 - -
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18 Sobic.002G000900 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
19 Sobic.009G158200 - -
20 Sobic.010G266400 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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