Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G185300.1
Synonym Sb04g023420
Functional annotation membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XVJ8
Pfam PF04535
Panther DB PTHR33573 PTHR33573:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39530 : Uncharacterised protein family (UPF0497)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g34730.1 : membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020747
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G049100 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
2 Sobic.004G358800 protein kinase, putative, expressed -
3 Sobic.003G406180 - -
4 Sobic.006G242701 - -
5 Sobic.007G050750 - -
6 Sobic.009G158200 - -
7 Sobic.001G060600 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
8 Sobic.006G087600 - -
9 Sobic.001G112550 - -
10 Sobic.006G113301 - -
11 Sobic.003G148950 - -
12 Sobic.007G050650 - -
13 Sobic.001G324300 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G108050 - -
15 Sobic.006G140050 - -
16 Sobic.003G185800 - -
17 Sobic.009G230300 - -
18 Sobic.002G000900 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
19 Sobic.010G230100 - -
20 Sobic.008G142450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G185300 Sobic004G185300 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic004G185300--Sobic005G049100 Sobic004G358800 Sobic004G358800 Sobic004G185300--Sobic004G358800 Sobic003G406180 Sobic003G406180 Sobic004G185300--Sobic003G406180 Sobic006G242701 Sobic006G242701 Sobic004G185300--Sobic006G242701 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic004G185300--Sobic007G050750 Sobic009G158200 Sobic009G158200 Sobic004G185300--Sobic009G158200 Sobic001G060600 Sobic001G060600 Sobic004G185300--Sobic001G060600 Sobic006G087600 Sobic006G087600 Sobic004G185300--Sobic006G087600 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic004G185300--Sobic001G112550 Sobic005G049100--Sobic004G358800 Sobic005G049100--Sobic003G406180 Sobic005G049100--Sobic004G185300 Sobic005G049100--Sobic007G050750 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic005G049100--Sobic006G113301 Sobic005G049100--Sobic001G112550 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic005G049100--Sobic007G050650 Sobic005G049100--Sobic006G087600 Sobic003G148950 Sobic003G148950 Sobic005G049100--Sobic003G148950 Sobic004G358800--Sobic005G049100 Sobic004G358800--Sobic003G406180 Sobic004G358800--Sobic004G185300 Sobic004G358800--Sobic007G050750 Sobic004G358800--Sobic006G087600 Sobic004G358800--Sobic001G112550 Sobic004G358800--Sobic003G148950 Sobic004G358800--Sobic006G113301 Sobic004G358800--Sobic007G050650 Sobic003G406180--Sobic005G049100 Sobic003G406180--Sobic004G358800 Sobic003G406180--Sobic004G185300 Sobic003G406180--Sobic006G087600 Sobic003G406180--Sobic009G158200 Sobic003G108050 Sobic003G108050 Sobic003G406180--Sobic003G108050 Sobic009G230300 Sobic009G230300 Sobic003G406180--Sobic009G230300 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic003G406180--Sobic010G230100 Sobic004G342800 Sobic004G342800 Sobic003G406180--Sobic004G342800 Sobic006G242701--Sobic004G185300 Sobic006G242701--Sobic007G050750 Sobic006G242701--Sobic005G049100 Sobic006G242701--Sobic001G112550 Sobic006G242701--Sobic001G060600 Sobic006G140050 Sobic006G140050 Sobic006G242701--Sobic006G140050 Sobic006G242701--Sobic006G113301 Sobic006G242701--Sobic004G358800 Sobic006G242701--Sobic003G406180 Sobic007G050750--Sobic001G112550 Sobic005G161750 Sobic005G161750 Sobic007G050750--Sobic005G161750 Sobic007G050750--Sobic006G113301 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic007G050750--Sobic002G018800 Sobic007G050750--Sobic007G050650 Sobic006G060400 Sobic006G060400 Sobic007G050750--Sobic006G060400 Sobic007G050750--Sobic005G049100 Sobic007G050750--Sobic006G242701 Sobic007G050750--Sobic003G148950 Sobic009G158200--Sobic003G406180 Sobic009G158200--Sobic004G185300 Sobic009G158200--Sobic009G230300 Sobic009G158200--Sobic001G060600 Sobic009G158200--Sobic005G049100 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic009G158200--Sobic003G095301 Sobic009G158200--Sobic004G358800 Sobic009G158200--Sobic010G230100 Sobic009G158200--Sobic004G342800 Sobic001G060600--Sobic006G242701 Sobic001G060600--Sobic004G185300 Sobic001G060600--Sobic005G049100 Sobic001G060600--Sobic009G158200 Sobic001G060600--Sobic003G406180 Sobic001G060600--Sobic004G358800 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic001G060600--Sobic001G042100 Sobic001G060600--Sobic007G050750 Sobic010G234100 Sobic010G234100 Sobic001G060600--Sobic010G234100 Sobic006G087600--Sobic003G406180 Sobic006G087600--Sobic005G049100 Sobic006G087600--Sobic004G358800 Sobic006G087600--Sobic004G185300 Sobic006G087600--Sobic009G230300 Sobic006G087600--Sobic010G230100 Sobic006G087600--Sobic004G342800 Sobic006G087600--Sobic003G108050 Sobic001G369101 Sobic001G369101 Sobic006G087600--Sobic001G369101 Sobic001G112550--Sobic007G050750 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic001G112550--Sobic010G003800 Sobic001G112550--Sobic002G018800 Sobic001G112550--Sobic003G148950 Sobic001G112550--Sobic006G113301 Sobic001G112550--Sobic007G050650 Sobic001G112550--Sobic005G161750 Sobic001G112550--Sobic001G042100 Sobic001G112550--Sobic006G060400
Octagon: transcription factors


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