Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G158200.1
Synonym Sb09g022140
Functional annotation -
UniProt C5YYW2
Pfam PF06521
Panther DB PTHR33649 PTHR33649:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54040 : PAR1 protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043871
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G406180 - -
2 Sobic.004G185300 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G230300 - -
4 Sobic.001G060600 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
5 Sobic.005G049100 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
6 Sobic.003G095301 - -
7 Sobic.004G358800 protein kinase, putative, expressed -
8 Sobic.010G230100 - -
9 Sobic.004G342800 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
10 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G363466 - -
12 Sobic.009G185601 - -
13 Sobic.003G108050 - -
14 Sobic.001G196950 - -
15 Sobic.001G369101 - -
16 Sobic.004G171350 - -
17 Sobic.001G173251 - -
18 Sobic.001G328850 - -
19 Sobic.006G087600 - -
20 Sobic.007G181801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G158200 Sobic009G158200 Sobic003G406180 Sobic003G406180 Sobic009G158200--Sobic003G406180 Sobic004G185300 Sobic004G185300 Sobic009G158200--Sobic004G185300 Sobic009G230300 Sobic009G230300 Sobic009G158200--Sobic009G230300 Sobic001G060600 Sobic001G060600 Sobic009G158200--Sobic001G060600 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic009G158200--Sobic005G049100 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic009G158200--Sobic003G095301 Sobic004G358800 Sobic004G358800 Sobic009G158200--Sobic004G358800 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic009G158200--Sobic010G230100 Sobic004G342800 Sobic004G342800 Sobic009G158200--Sobic004G342800 Sobic003G406180--Sobic005G049100 Sobic003G406180--Sobic004G358800 Sobic003G406180--Sobic004G185300 Sobic006G087600 Sobic006G087600 Sobic003G406180--Sobic006G087600 Sobic003G406180--Sobic009G158200 Sobic003G108050 Sobic003G108050 Sobic003G406180--Sobic003G108050 Sobic003G406180--Sobic009G230300 Sobic003G406180--Sobic010G230100 Sobic003G406180--Sobic004G342800 Sobic004G185300--Sobic005G049100 Sobic004G185300--Sobic004G358800 Sobic004G185300--Sobic003G406180 Sobic006G242701 Sobic006G242701 Sobic004G185300--Sobic006G242701 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic004G185300--Sobic007G050750 Sobic004G185300--Sobic009G158200 Sobic004G185300--Sobic001G060600 Sobic004G185300--Sobic006G087600 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic004G185300--Sobic001G112550 Sobic009G230300--Sobic010G230100 Sobic009G230300--Sobic004G342800 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G230300--Sobic001G018700 Sobic001G060600--Sobic006G242701 Sobic001G060600--Sobic004G185300 Sobic001G060600--Sobic005G049100 Sobic001G060600--Sobic009G158200 Sobic001G060600--Sobic003G406180 Sobic001G060600--Sobic004G358800 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic001G060600--Sobic001G042100 Sobic001G060600--Sobic007G050750 Sobic010G234100 Sobic010G234100 Sobic001G060600--Sobic010G234100 Sobic005G049100--Sobic004G358800 Sobic005G049100--Sobic003G406180 Sobic005G049100--Sobic004G185300 Sobic005G049100--Sobic007G050750 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic005G049100--Sobic006G113301 Sobic005G049100--Sobic001G112550 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic005G049100--Sobic007G050650 Sobic005G049100--Sobic006G087600 Sobic003G148950 Sobic003G148950 Sobic005G049100--Sobic003G148950 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic003G095301--Sobic007G181801 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic003G095301--Sobic009G196500 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic009G219601 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic003G095301--Sobic004G123801 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic003G095301--Sobic008G146801 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G095301--Sobic005G193900 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G095301--Sobic003G384650 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G095301--Sobic001G030800 Sobic003G095301--Sobic001G018700 Sobic004G358800--Sobic005G049100 Sobic004G358800--Sobic003G406180 Sobic004G358800--Sobic004G185300 Sobic004G358800--Sobic007G050750 Sobic004G358800--Sobic006G087600 Sobic004G358800--Sobic001G112550 Sobic004G358800--Sobic003G148950 Sobic004G358800--Sobic006G113301 Sobic004G358800--Sobic007G050650 Sobic010G230100--Sobic009G230300 Sobic003G329100 Sobic003G329100 Sobic010G230100--Sobic003G329100 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic010G230100--Sobic004G007550 Sobic006G244900 Sobic006G244900 Sobic010G230100--Sobic006G244900 Sobic009G116832 Sobic009G116832 Sobic010G230100--Sobic009G116832 Sobic010G230100--Sobic001G018700 Sobic004G342800--Sobic009G230300 Sobic010G172600 Sobic010G172600 Sobic004G342800--Sobic010G172600 Sobic004G342800--Sobic010G230100 Sobic004G342800--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.