Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G173251.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S637
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G086400 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
2 Sobic.006G209200 transferase family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G144900 expressed protein -
4 Sobic.003G095301 - -
5 Sobic.006G113100 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G123801 - -
7 Sobic.005G120466 - -
8 Sobic.004G121500 expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.002G363466 - -
10 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G328850 - -
12 Sobic.004G171350 - -
13 Sobic.003G053001 - -
14 Sobic.010G253250 - -
15 Sobic.004G098650 - -
16 Sobic.005G077666 - -
17 Sobic.005G062300 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.001G476201 - -
19 Sobic.009G185601 - -
20 Sobic.002G064450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic001G173251--Sobic007G086400 Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic001G173251--Sobic006G209200 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic001G173251--Sobic005G144900 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic001G173251--Sobic003G095301 Sobic006G113100 Sobic006G113100 Sobic001G173251--Sobic006G113100 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic001G173251--Sobic004G123801 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic001G173251--Sobic005G120466 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic001G173251--Sobic004G121500 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic001G173251--Sobic002G363466 Sobic007G086400--Sobic006G113100 Sobic002G064450 Sobic002G064450 Sobic007G086400--Sobic002G064450 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic007G086400--Sobic009G185601 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic007G086400--Sobic001G374301 Sobic007G086400--Sobic005G120466 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic007G086400--Sobic006G075650 Sobic003G053001 Sobic003G053001 Sobic007G086400--Sobic003G053001 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic007G086400--Sobic004G098650 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic007G086400--Sobic003G405400 Sobic006G209200--Sobic001G173251 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic006G209200--Sobic004G093300 Sobic006G209200--Sobic003G095301 Sobic006G209200--Sobic002G363466 Sobic001G476201 Sobic001G476201 Sobic006G209200--Sobic001G476201 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic006G209200--Sobic003G123800 Sobic006G209200--Sobic005G120466 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic006G209200--Sobic001G328850 Sobic006G209200--Sobic009G185601 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic005G144900--Sobic003G090100 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic005G144900--Sobic009G024166 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic005G144900--Sobic008G028850 Sobic005G144900--Sobic007G086400 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic005G144900--Sobic006G257250 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic005G144900--Sobic004G056350 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic005G144900--Sobic004G311550 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic005G144900--Sobic005G207900 Sobic005G144900--Sobic004G123801 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic003G095301--Sobic007G181801 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic003G095301--Sobic009G196500 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic004G123801 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic003G095301--Sobic008G146801 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G095301--Sobic005G193900 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G095301--Sobic003G384650 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G095301--Sobic001G030800 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G095301--Sobic001G018700 Sobic006G113100--Sobic007G086400 Sobic006G113100--Sobic001G374301 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic006G113100--Sobic001G236950 Sobic006G113100--Sobic002G064450 Sobic001G436850 Sobic001G436850 Sobic006G113100--Sobic001G436850 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic006G113100--Sobic001G097300 Sobic006G113100--Sobic004G123801 Sobic006G113100--Sobic003G405400 Sobic006G113100--Sobic004G098650 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic004G123801--Sobic003G178101 Sobic004G123801--Sobic001G030800 Sobic004G123801--Sobic003G384650 Sobic004G123801--Sobic001G018700 Sobic005G120466--Sobic001G328850 Sobic005G120466--Sobic003G178101 Sobic005G120466--Sobic003G384650 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic005G120466--Sobic001G211101 Sobic005G120466--Sobic006G075650 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic005G120466--Sobic001G185700 Sobic005G120466--Sobic003G405400 Sobic005G120466--Sobic001G018700 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic004G121500--Sobic002G417101 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic004G121500--Sobic005G062300 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic003G095301 Sobic004G121500--Sobic001G328850 Sobic004G121500--Sobic007G181801 Sobic004G121500--Sobic004G123801 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic004G121500--Sobic002G175000 Sobic004G121500--Sobic009G219601 Sobic002G363466--Sobic006G209200 Sobic002G363466--Sobic001G173251 Sobic002G363466--Sobic003G095301 Sobic002G363466--Sobic004G093300 Sobic010G092550 Sobic010G092550 Sobic002G363466--Sobic010G092550 Sobic009G158200 Sobic009G158200 Sobic002G363466--Sobic009G158200 Sobic002G363466--Sobic002G175000 Sobic002G363466--Sobic004G121500 Sobic002G363466--Sobic007G181801
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.