Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G209200.1
Synonym
Functional annotation transferase family domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PN33
Pfam PF02458
Panther DB PTHR31642 PTHR31642:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G16410 : HXXXD-type acyl-transferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g51980.1 : transferase family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009852 , Zm00025a056986
Brachypodium KQJ84481
Barley HORVU2Hr1G100230.8 , HORVU2Hr1G100230.1 , HORVU2Hr1G100230.2 , HORVU2Hr1G100230.3 , HORVU2Hr1G100230.4 , HORVU2Hr1G100230.5 , HORVU2Hr1G100230.6 , HORVU2Hr1G100230.7 , HORVU2Hr1G100210.2 , HORVU2Hr1G100210.3 , HORVU2Hr1G100210.1 , HORVU2Hr1G100110.9 , HORVU2Hr1G100150.5 , HORVU2Hr1G100150.4 , HORVU2Hr1G100150.1 , HORVU2Hr1G100150.3 , HORVU2Hr1G100150.2 , HORVU2Hr1G100110.3 , HORVU2Hr1G100110.2 , HORVU2Hr1G100110.5 , HORVU2Hr1G100110.4 , HORVU2Hr1G100110.6 , HORVU2Hr1G100110.8
Wheat TraesCS2D02G427000 , TraesCS2B02G449600 , TraesCS2B02G449500 , TraesCS2A02G429000 , TraesCS2B02G449700 , TraesCS2D02G426800 , TraesCS2A02G429200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G173251 - -
2 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G095301 - -
4 Sobic.002G363466 - -
5 Sobic.001G476201 - -
6 Sobic.003G123800 expressed protein -
7 Sobic.005G120466 - -
8 Sobic.001G328850 - -
9 Sobic.009G185601 - -
10 Sobic.005G077666 - -
11 Sobic.007G181801 - -
12 Sobic.009G005000 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.001G013701 - -
14 Sobic.009G219601 - -
15 Sobic.004G171350 - -
16 Sobic.004G123801 - -
17 Sobic.008G146801 - -
18 Sobic.005G144900 expressed protein -
19 Sobic.004G121500 expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G437900 decarboxylase, putative, expressed K01590: hdc, histidine decarboxylase


Gene co-expression network
sample Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic006G209200--Sobic001G173251 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic006G209200--Sobic004G093300 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic006G209200--Sobic003G095301 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic006G209200--Sobic002G363466 Sobic001G476201 Sobic001G476201 Sobic006G209200--Sobic001G476201 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic006G209200--Sobic003G123800 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic006G209200--Sobic005G120466 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic006G209200--Sobic001G328850 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic006G209200--Sobic009G185601 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic001G173251--Sobic007G086400 Sobic001G173251--Sobic006G209200 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic001G173251--Sobic005G144900 Sobic001G173251--Sobic003G095301 Sobic006G113100 Sobic006G113100 Sobic001G173251--Sobic006G113100 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic001G173251--Sobic004G123801 Sobic001G173251--Sobic005G120466 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic001G173251--Sobic004G121500 Sobic001G173251--Sobic002G363466 Sobic004G093300--Sobic009G185601 Sobic004G093300--Sobic005G120466 Sobic004G093300--Sobic007G086400 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic004G093300--Sobic001G097300 Sobic004G093300--Sobic003G095301 Sobic003G437900 Sobic003G437900 Sobic004G093300--Sobic003G437900 Sobic007G002400 Sobic007G002400 Sobic004G093300--Sobic007G002400 Sobic004G093300--Sobic003G123800 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic004G093300--Sobic009G005000 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic003G095301--Sobic007G181801 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic003G095301--Sobic009G196500 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic004G123801 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic003G095301--Sobic008G146801 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G095301--Sobic005G193900 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G095301--Sobic003G384650 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G095301--Sobic001G030800 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G095301--Sobic001G018700 Sobic002G363466--Sobic006G209200 Sobic002G363466--Sobic001G173251 Sobic002G363466--Sobic003G095301 Sobic002G363466--Sobic004G093300 Sobic010G092550 Sobic010G092550 Sobic002G363466--Sobic010G092550 Sobic009G158200 Sobic009G158200 Sobic002G363466--Sobic009G158200 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic002G363466--Sobic002G175000 Sobic002G363466--Sobic004G121500 Sobic002G363466--Sobic007G181801 Sobic001G013701 Sobic001G013701 Sobic001G476201--Sobic001G013701 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic001G476201--Sobic004G300400 Sobic004G337132 Sobic004G337132 Sobic001G476201--Sobic004G337132 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic001G476201--Sobic004G007550 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic001G476201--Sobic003G294550 Sobic004G217400 Sobic004G217400 Sobic001G476201--Sobic004G217400 Sobic006G244900 Sobic006G244900 Sobic001G476201--Sobic006G244900 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic001G476201--Sobic006G024101 Sobic007G151900 Sobic007G151900 Sobic001G476201--Sobic007G151900 Sobic003G123800--Sobic009G005000 Sobic003G123800--Sobic004G093300 Sobic003G123800--Sobic005G120466 Sobic001G002900 Sobic001G002900 Sobic003G123800--Sobic001G002900 Sobic003G277850 Sobic003G277850 Sobic003G123800--Sobic003G277850 Sobic003G123800--Sobic006G209200 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic003G123800--Sobic001G185700 Sobic003G123800--Sobic001G328850 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic003G123800--Sobic008G031800 Sobic005G120466--Sobic001G328850 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic005G120466--Sobic003G178101 Sobic005G120466--Sobic003G384650 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic005G120466--Sobic001G211101 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic005G120466--Sobic006G075650 Sobic005G120466--Sobic001G185700 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic005G120466--Sobic003G405400 Sobic005G120466--Sobic001G018700 Sobic001G328850--Sobic005G120466 Sobic001G328850--Sobic001G185700 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic001G328850--Sobic004G171350 Sobic001G328850--Sobic009G219601 Sobic001G328850--Sobic004G123801 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic001G328850--Sobic006G204850 Sobic001G328850--Sobic007G181801 Sobic001G328850--Sobic003G384650 Sobic001G328850--Sobic003G178101 Sobic009G185601--Sobic001G097300 Sobic001G146450 Sobic001G146450 Sobic009G185601--Sobic001G146450 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic009G185601--Sobic001G374301 Sobic009G185601--Sobic005G120466 Sobic009G185601--Sobic007G086400 Sobic009G185601--Sobic004G093300 Sobic009G185601--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.