Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G123800.1
Synonym Sb03g010480
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XGJ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g16140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035264
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G005000 cysteine-rich receptor-like protein kinase 7 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G120466 - -
4 Sobic.001G002900 - -
5 Sobic.003G277850 - -
6 Sobic.006G209200 transferase family domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G185700 expressed protein -
8 Sobic.001G328850 - -
9 Sobic.008G031800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G175100 genetic modifier, putative, expressed -
11 Sobic.004G171350 - -
12 Sobic.003G437900 decarboxylase, putative, expressed K01590: hdc, histidine decarboxylase
13 Sobic.007G034650 - -
14 Sobic.009G185601 - -
15 Sobic.001G013701 - -
16 Sobic.003G095301 - -
17 Sobic.010G197632 - -
18 Sobic.001G476201 - -
19 Sobic.001G097300 CHCH domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G173251 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic003G123800--Sobic009G005000 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic003G123800--Sobic004G093300 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic003G123800--Sobic005G120466 Sobic001G002900 Sobic001G002900 Sobic003G123800--Sobic001G002900 Sobic003G277850 Sobic003G277850 Sobic003G123800--Sobic003G277850 Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic003G123800--Sobic006G209200 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic003G123800--Sobic001G185700 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic003G123800--Sobic001G328850 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic003G123800--Sobic008G031800 Sobic009G005000--Sobic003G123800 Sobic009G005000--Sobic004G093300 Sobic009G005000--Sobic005G120466 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic009G005000--Sobic009G185601 Sobic009G005000--Sobic006G209200 Sobic003G437900 Sobic003G437900 Sobic009G005000--Sobic003G437900 Sobic009G005000--Sobic001G328850 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic009G005000--Sobic003G095301 Sobic009G005000--Sobic001G185700 Sobic004G093300--Sobic009G185601 Sobic004G093300--Sobic005G120466 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic004G093300--Sobic007G086400 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic004G093300--Sobic001G097300 Sobic004G093300--Sobic003G095301 Sobic004G093300--Sobic003G437900 Sobic007G002400 Sobic007G002400 Sobic004G093300--Sobic007G002400 Sobic004G093300--Sobic003G123800 Sobic004G093300--Sobic009G005000 Sobic005G120466--Sobic001G328850 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic005G120466--Sobic003G178101 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G120466--Sobic003G384650 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic005G120466--Sobic001G211101 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic005G120466--Sobic006G075650 Sobic005G120466--Sobic001G185700 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic005G120466--Sobic003G405400 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic005G120466--Sobic001G018700 Sobic001G002900--Sobic003G123800 Sobic001G183800 Sobic001G183800 Sobic001G002900--Sobic001G183800 Sobic001G002900--Sobic001G185700 Sobic007G034650 Sobic007G034650 Sobic001G002900--Sobic007G034650 Sobic006G155150 Sobic006G155150 Sobic001G002900--Sobic006G155150 Sobic001G002900--Sobic008G031800 Sobic001G002900--Sobic001G328850 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic001G002900--Sobic004G171350 Sobic001G002900--Sobic005G120466 Sobic003G277850--Sobic003G123800 Sobic003G277850--Sobic004G093300 Sobic003G277850--Sobic009G005000 Sobic003G277850--Sobic006G209200 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic003G277850--Sobic001G173251 Sobic007G079500 Sobic007G079500 Sobic003G277850--Sobic007G079500 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic003G277850--Sobic004G022700 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic003G277850--Sobic005G144900 Sobic006G175100 Sobic006G175100 Sobic003G277850--Sobic006G175100 Sobic006G209200--Sobic001G173251 Sobic006G209200--Sobic004G093300 Sobic006G209200--Sobic003G095301 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic006G209200--Sobic002G363466 Sobic001G476201 Sobic001G476201 Sobic006G209200--Sobic001G476201 Sobic006G209200--Sobic003G123800 Sobic006G209200--Sobic005G120466 Sobic006G209200--Sobic001G328850 Sobic006G209200--Sobic009G185601 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic001G185700--Sobic003G066200 Sobic001G185700--Sobic001G328850 Sobic001G185700--Sobic001G018700 Sobic001G328850--Sobic005G120466 Sobic001G328850--Sobic001G185700 Sobic001G328850--Sobic004G171350 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic001G328850--Sobic009G219601 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic001G328850--Sobic004G123801 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic001G328850--Sobic006G204850 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic001G328850--Sobic007G181801 Sobic001G328850--Sobic003G384650 Sobic001G328850--Sobic003G178101 Sobic008G031800--Sobic001G185700 Sobic010G123750 Sobic010G123750 Sobic008G031800--Sobic010G123750 Sobic004G236901 Sobic004G236901 Sobic008G031800--Sobic004G236901 Sobic008G031800--Sobic001G328850 Sobic005G071000 Sobic005G071000 Sobic008G031800--Sobic005G071000 Sobic009G220400 Sobic009G220400 Sobic008G031800--Sobic009G220400 Sobic001G056000 Sobic001G056000 Sobic008G031800--Sobic001G056000 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic008G031800--Sobic009G062150 Sobic008G031800--Sobic006G204850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.