Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G121500.1
Synonym ATHEXPALPHA1.14, ATEXP11, EXP11, ATEXPA11, EXPA11
Functional annotation expansin precursor, putative, expressed
UniProt A0A194YP46
Pfam PF03330
Panther DB PTHR31867 PTHR31867:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20190 : expansin 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g16839.1 : expansin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G051600 , TraesCS3A02G031700 , TraesCS3D02G029900 , TraesCS3B02G051400 , TraesCS3B02G051800 , TraesCS3B02G051200 , TraesCS3B02G051000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.004G171350 - -
20 Sobic.003G384650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic004G121500--Sobic002G417101 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic004G121500--Sobic005G062300 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic005G077666 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic004G121500--Sobic003G095301 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic004G121500--Sobic001G328850 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic004G121500--Sobic007G181801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic004G121500--Sobic004G123801 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic004G121500--Sobic002G175000 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic004G121500--Sobic009G219601 Sobic002G417101--Sobic004G121500 Sobic002G417101--Sobic003G095301 Sobic002G417101--Sobic005G062300 Sobic010G253250 Sobic010G253250 Sobic002G417101--Sobic010G253250 Sobic002G417101--Sobic005G077666 Sobic002G417101--Sobic001G328850 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic002G417101--Sobic002G099500 Sobic002G417101--Sobic007G181801 Sobic002G417101--Sobic004G123801 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic005G062300--Sobic006G075650 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic005G062300--Sobic001G211101 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic005G062300--Sobic001G218300 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic005G062300--Sobic003G178101 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic002G099500 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G062300--Sobic003G384650 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic005G077666 Sobic005G077666--Sobic007G181801 Sobic005G077666--Sobic004G123801 Sobic005G077666--Sobic009G219601 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic005G077666--Sobic010G090550 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic005G077666--Sobic001G338200 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic005G077666--Sobic008G146801 Sobic005G077666--Sobic001G211101 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic005G077666--Sobic001G018700 Sobic003G095301--Sobic007G181801 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic003G095301--Sobic009G196500 Sobic003G095301--Sobic009G219601 Sobic003G095301--Sobic004G123801 Sobic003G095301--Sobic008G146801 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G095301--Sobic005G193900 Sobic003G095301--Sobic003G384650 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G095301--Sobic001G030800 Sobic003G095301--Sobic001G018700 Sobic001G328850--Sobic005G120466 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic001G328850--Sobic001G185700 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic001G328850--Sobic004G171350 Sobic001G328850--Sobic009G219601 Sobic001G328850--Sobic004G123801 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic001G328850--Sobic006G204850 Sobic001G328850--Sobic007G181801 Sobic001G328850--Sobic003G384650 Sobic001G328850--Sobic003G178101 Sobic007G181801--Sobic009G219601 Sobic007G181801--Sobic008G146801 Sobic007G181801--Sobic004G123801 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic007G181801--Sobic004G246950 Sobic007G181801--Sobic001G018700 Sobic004G123801--Sobic003G178101 Sobic004G123801--Sobic001G030800 Sobic004G123801--Sobic003G384650 Sobic004G123801--Sobic001G018700 Sobic001G371500 Sobic001G371500 Sobic002G175000--Sobic001G371500 Sobic003G089400 Sobic003G089400 Sobic002G175000--Sobic003G089400 Sobic002G175000--Sobic007G181801 Sobic007G054300 Sobic007G054300 Sobic002G175000--Sobic007G054300 Sobic008G048000 Sobic008G048000 Sobic002G175000--Sobic008G048000 Sobic002G175000--Sobic005G077666 Sobic002G175000--Sobic003G095301 Sobic002G175000--Sobic009G219601 Sobic002G175000--Sobic008G146801 Sobic009G219601--Sobic008G146801 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic009G219601--Sobic010G158300 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic009G219601--Sobic002G218350 Sobic009G219601--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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