Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G144900.1
Synonym Sb05g020960
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RJ87
Pfam -
Panther DB PTHR34483 PTHR34483:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g04339.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G090100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G024166 - -
3 Sobic.008G028850 - -
4 Sobic.007G086400 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
5 Sobic.006G257250 - -
6 Sobic.004G056350 - -
7 Sobic.004G311550 - -
8 Sobic.005G207900 zinc knuckle family protein, expressed -
9 Sobic.004G123801 - -
10 Sobic.006G113700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G095301 - -
12 Sobic.004G171350 - -
13 Sobic.002G064450 - -
14 Sobic.009G185601 - -
15 Sobic.004G224350 - -
16 Sobic.004G127500 - -
17 Sobic.003G053001 - -
18 Sobic.001G374301 - -
19 Sobic.003G042000 - -
20 Sobic.007G007250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic005G144900--Sobic003G090100 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic005G144900--Sobic009G024166 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic005G144900--Sobic008G028850 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic005G144900--Sobic007G086400 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic005G144900--Sobic006G257250 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic005G144900--Sobic004G056350 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic005G144900--Sobic004G311550 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic005G144900--Sobic005G207900 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic005G144900--Sobic004G123801 Sobic003G090100--Sobic005G207900 Sobic007G007250 Sobic007G007250 Sobic003G090100--Sobic007G007250 Sobic003G090100--Sobic008G028850 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G090100--Sobic001G018700 Sobic009G024166--Sobic006G257250 Sobic009G024166--Sobic004G056350 Sobic009G024166--Sobic004G311550 Sobic009G024166--Sobic008G028850 Sobic009G024166--Sobic003G090100 Sobic006G113700 Sobic006G113700 Sobic009G024166--Sobic006G113700 Sobic009G024166--Sobic005G207900 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic009G024166--Sobic003G042000 Sobic006G011700 Sobic006G011700 Sobic009G024166--Sobic006G011700 Sobic008G028850--Sobic009G024166 Sobic008G028850--Sobic003G090100 Sobic008G028850--Sobic006G011700 Sobic008G028850--Sobic006G257250 Sobic008G028850--Sobic004G056350 Sobic008G028850--Sobic004G311550 Sobic008G028850--Sobic005G207900 Sobic008G028850--Sobic006G113700 Sobic008G028850--Sobic007G007250 Sobic006G113100 Sobic006G113100 Sobic007G086400--Sobic006G113100 Sobic002G064450 Sobic002G064450 Sobic007G086400--Sobic002G064450 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic007G086400--Sobic009G185601 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic007G086400--Sobic001G374301 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic007G086400--Sobic005G120466 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic007G086400--Sobic006G075650 Sobic003G053001 Sobic003G053001 Sobic007G086400--Sobic003G053001 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic007G086400--Sobic004G098650 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic007G086400--Sobic003G405400 Sobic006G257250--Sobic004G056350 Sobic006G257250--Sobic004G311550 Sobic006G257250--Sobic009G024166 Sobic006G257250--Sobic003G042000 Sobic006G257250--Sobic008G028850 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic006G257250--Sobic007G082700 Sobic006G257250--Sobic006G113700 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic006G257250--Sobic009G013850 Sobic006G257250--Sobic006G011700 Sobic004G056350--Sobic006G257250 Sobic004G056350--Sobic004G311550 Sobic004G056350--Sobic009G024166 Sobic004G056350--Sobic003G042000 Sobic004G056350--Sobic008G028850 Sobic004G056350--Sobic007G082700 Sobic004G056350--Sobic006G113700 Sobic004G056350--Sobic009G013850 Sobic004G056350--Sobic006G011700 Sobic004G311550--Sobic004G056350 Sobic004G311550--Sobic006G257250 Sobic004G311550--Sobic009G024166 Sobic004G311550--Sobic003G042000 Sobic004G311550--Sobic008G028850 Sobic004G311550--Sobic007G082700 Sobic004G311550--Sobic006G113700 Sobic004G311550--Sobic009G013850 Sobic004G311550--Sobic006G011700 Sobic005G207900--Sobic003G090100 Sobic005G207900--Sobic001G018700 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic004G123801--Sobic003G178101 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic004G123801--Sobic001G030800 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic004G123801--Sobic003G384650 Sobic004G123801--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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