Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G127500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPC4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.004G127500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G090100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G028850 - -
3 Sobic.005G207900 zinc knuckle family protein, expressed -
4 Sobic.004G224350 - -
5 Sobic.007G007250 - -
6 Sobic.009G024166 - -
7 Sobic.006G011700 dirigent, putative -
8 Sobic.003G066200 expressed protein -
9 Sobic.003G094850 - -
10 Sobic.001G371500 - -
11 Sobic.001G030800 RD26, putative, expressed -
12 Sobic.005G102750 - -
13 Sobic.003G178101 - K09490: HSPA5, endoplasmic reticulum chaperone BiP
14 Sobic.003G384650 - -
15 Sobic.010G090550 - -
16 Sobic.003G072100 D-mannose binding lectin family protein, expressed -
17 Sobic.004G246950 - -
18 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G127500 Sobic004G127500 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic004G127500--Sobic003G090100 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic004G127500--Sobic008G028850 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic004G127500--Sobic005G207900 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic004G127500--Sobic004G224350 Sobic007G007250 Sobic007G007250 Sobic004G127500--Sobic007G007250 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic004G127500--Sobic009G024166 Sobic006G011700 Sobic006G011700 Sobic004G127500--Sobic006G011700 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic004G127500--Sobic003G066200 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic004G127500--Sobic003G094850 Sobic003G090100--Sobic005G207900 Sobic003G090100--Sobic007G007250 Sobic003G090100--Sobic008G028850 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G090100--Sobic001G018700 Sobic008G028850--Sobic009G024166 Sobic008G028850--Sobic003G090100 Sobic008G028850--Sobic006G011700 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic008G028850--Sobic006G257250 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic008G028850--Sobic004G056350 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic008G028850--Sobic004G311550 Sobic008G028850--Sobic005G207900 Sobic006G113700 Sobic006G113700 Sobic008G028850--Sobic006G113700 Sobic008G028850--Sobic007G007250 Sobic005G207900--Sobic003G090100 Sobic005G207900--Sobic001G018700 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G224350--Sobic001G183900 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic004G224350--Sobic002G032033 Sobic004G224350--Sobic003G090100 Sobic004G224350--Sobic005G207900 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic004G224350--Sobic005G216866 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic004G224350--Sobic004G246950 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic004G224350--Sobic003G072100 Sobic004G224350--Sobic001G018700 Sobic007G007250--Sobic005G207900 Sobic007G007250--Sobic003G090100 Sobic001G273600 Sobic001G273600 Sobic007G007250--Sobic001G273600 Sobic007G007250--Sobic001G018700 Sobic009G024166--Sobic006G257250 Sobic009G024166--Sobic004G056350 Sobic009G024166--Sobic004G311550 Sobic009G024166--Sobic008G028850 Sobic009G024166--Sobic003G090100 Sobic009G024166--Sobic006G113700 Sobic009G024166--Sobic005G207900 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic009G024166--Sobic003G042000 Sobic009G024166--Sobic006G011700 Sobic006G011700--Sobic008G028850 Sobic006G011700--Sobic006G257250 Sobic006G011700--Sobic004G056350 Sobic006G011700--Sobic004G311550 Sobic006G011700--Sobic009G024166 Sobic006G011700--Sobic003G042000 Sobic006G011700--Sobic003G090100 Sobic006G011700--Sobic004G127500 Sobic006G011700--Sobic006G113700 Sobic003G066200--Sobic001G018700 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic003G094850--Sobic005G102750 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic003G094850--Sobic005G190400 Sobic003G094850--Sobic003G066200 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G094850--Sobic005G193900 Sobic003G094850--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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