Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G024166.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R0H6
Pfam -
Panther DB PTHR25952 PTHR25952:SF206
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g46610.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G257250 - -
2 Sobic.004G056350 - -
3 Sobic.004G311550 - -
4 Sobic.008G028850 - -
5 Sobic.003G090100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G113700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G207900 zinc knuckle family protein, expressed -
8 Sobic.003G042000 - -
9 Sobic.006G011700 dirigent, putative -
10 Sobic.007G007250 - -
11 Sobic.004G224350 - -
12 Sobic.004G127500 - -
13 Sobic.007G082700 expressed protein -
14 Sobic.009G013850 - -
15 Sobic.001G236950 - -
16 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
17 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
18 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic009G024166--Sobic006G257250 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic009G024166--Sobic004G056350 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic009G024166--Sobic004G311550 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic009G024166--Sobic008G028850 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic009G024166--Sobic003G090100 Sobic006G113700 Sobic006G113700 Sobic009G024166--Sobic006G113700 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic009G024166--Sobic005G207900 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic009G024166--Sobic003G042000 Sobic006G011700 Sobic006G011700 Sobic009G024166--Sobic006G011700 Sobic006G257250--Sobic004G056350 Sobic006G257250--Sobic004G311550 Sobic006G257250--Sobic009G024166 Sobic006G257250--Sobic003G042000 Sobic006G257250--Sobic008G028850 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic006G257250--Sobic007G082700 Sobic006G257250--Sobic006G113700 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic006G257250--Sobic009G013850 Sobic006G257250--Sobic006G011700 Sobic004G056350--Sobic006G257250 Sobic004G056350--Sobic004G311550 Sobic004G056350--Sobic009G024166 Sobic004G056350--Sobic003G042000 Sobic004G056350--Sobic008G028850 Sobic004G056350--Sobic007G082700 Sobic004G056350--Sobic006G113700 Sobic004G056350--Sobic009G013850 Sobic004G056350--Sobic006G011700 Sobic004G311550--Sobic004G056350 Sobic004G311550--Sobic006G257250 Sobic004G311550--Sobic009G024166 Sobic004G311550--Sobic003G042000 Sobic004G311550--Sobic008G028850 Sobic004G311550--Sobic007G082700 Sobic004G311550--Sobic006G113700 Sobic004G311550--Sobic009G013850 Sobic004G311550--Sobic006G011700 Sobic008G028850--Sobic009G024166 Sobic008G028850--Sobic003G090100 Sobic008G028850--Sobic006G011700 Sobic008G028850--Sobic006G257250 Sobic008G028850--Sobic004G056350 Sobic008G028850--Sobic004G311550 Sobic008G028850--Sobic005G207900 Sobic008G028850--Sobic006G113700 Sobic007G007250 Sobic007G007250 Sobic008G028850--Sobic007G007250 Sobic003G090100--Sobic005G207900 Sobic003G090100--Sobic007G007250 Sobic003G090100--Sobic008G028850 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G090100--Sobic001G018700 Sobic006G113700--Sobic009G024166 Sobic006G113700--Sobic006G257250 Sobic006G113700--Sobic004G056350 Sobic006G113700--Sobic004G311550 Sobic006G113700--Sobic008G028850 Sobic006G113700--Sobic003G090100 Sobic006G113700--Sobic005G207900 Sobic006G113700--Sobic003G042000 Sobic006G113700--Sobic007G007250 Sobic005G207900--Sobic003G090100 Sobic005G207900--Sobic001G018700 Sobic003G042000--Sobic004G311550 Sobic003G042000--Sobic004G056350 Sobic003G042000--Sobic006G257250 Sobic003G042000--Sobic009G024166 Sobic003G042000--Sobic007G082700 Sobic003G042000--Sobic009G013850 Sobic003G042000--Sobic008G028850 Sobic003G042000--Sobic006G113700 Sobic003G042000--Sobic006G011700 Sobic006G011700--Sobic008G028850 Sobic006G011700--Sobic006G257250 Sobic006G011700--Sobic004G056350 Sobic006G011700--Sobic004G311550 Sobic006G011700--Sobic009G024166 Sobic006G011700--Sobic003G042000 Sobic006G011700--Sobic003G090100 Sobic004G127500 Sobic004G127500 Sobic006G011700--Sobic004G127500 Sobic006G011700--Sobic006G113700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.