Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G082700.1
Synonym Sb07g006781
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PGF7
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G311550 - -
2 Sobic.004G056350 - -
3 Sobic.006G257250 - -
4 Sobic.009G013850 - -
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9 Sobic.009G034250 - -
10 Sobic.008G028850 - -
11 Sobic.004G195650 - -
12 Sobic.006G113700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G011700 dirigent, putative -
14 Sobic.004G198350 - -
15 Sobic.005G191400 MBTB63 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.004G224350 - -
17 Sobic.003G090100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G127500 - -
19 Sobic.005G207900 zinc knuckle family protein, expressed -
20 Sobic.005G144900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic007G082700--Sobic004G311550 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic007G082700--Sobic004G056350 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic007G082700--Sobic006G257250 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic007G082700--Sobic009G013850 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic007G082700--Sobic003G042000 Sobic002G157950 Sobic002G157950 Sobic007G082700--Sobic002G157950 Sobic006G029250 Sobic006G029250 Sobic007G082700--Sobic006G029250 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic007G082700--Sobic009G024166 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic007G082700--Sobic009G034250 Sobic004G311550--Sobic004G056350 Sobic004G311550--Sobic006G257250 Sobic004G311550--Sobic009G024166 Sobic004G311550--Sobic003G042000 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic004G311550--Sobic008G028850 Sobic004G311550--Sobic007G082700 Sobic006G113700 Sobic006G113700 Sobic004G311550--Sobic006G113700 Sobic004G311550--Sobic009G013850 Sobic006G011700 Sobic006G011700 Sobic004G311550--Sobic006G011700 Sobic004G056350--Sobic006G257250 Sobic004G056350--Sobic004G311550 Sobic004G056350--Sobic009G024166 Sobic004G056350--Sobic003G042000 Sobic004G056350--Sobic008G028850 Sobic004G056350--Sobic007G082700 Sobic004G056350--Sobic006G113700 Sobic004G056350--Sobic009G013850 Sobic004G056350--Sobic006G011700 Sobic006G257250--Sobic004G056350 Sobic006G257250--Sobic004G311550 Sobic006G257250--Sobic009G024166 Sobic006G257250--Sobic003G042000 Sobic006G257250--Sobic008G028850 Sobic006G257250--Sobic007G082700 Sobic006G257250--Sobic006G113700 Sobic006G257250--Sobic009G013850 Sobic006G257250--Sobic006G011700 Sobic009G013850--Sobic004G311550 Sobic009G013850--Sobic004G056350 Sobic009G013850--Sobic006G257250 Sobic009G013850--Sobic007G082700 Sobic009G013850--Sobic003G042000 Sobic009G013850--Sobic006G029250 Sobic009G013850--Sobic009G024166 Sobic009G013850--Sobic009G034250 Sobic004G195650 Sobic004G195650 Sobic009G013850--Sobic004G195650 Sobic003G042000--Sobic004G311550 Sobic003G042000--Sobic004G056350 Sobic003G042000--Sobic006G257250 Sobic003G042000--Sobic009G024166 Sobic003G042000--Sobic007G082700 Sobic003G042000--Sobic009G013850 Sobic003G042000--Sobic008G028850 Sobic003G042000--Sobic006G113700 Sobic003G042000--Sobic006G011700 Sobic002G157950--Sobic007G082700 Sobic002G157950--Sobic006G257250 Sobic002G157950--Sobic004G056350 Sobic002G157950--Sobic004G311550 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic002G157950--Sobic004G224350 Sobic002G157950--Sobic009G024166 Sobic002G157950--Sobic003G042000 Sobic002G157950--Sobic008G028850 Sobic002G157950--Sobic009G013850 Sobic006G029250--Sobic009G034250 Sobic006G029250--Sobic009G013850 Sobic006G029250--Sobic007G082700 Sobic006G029250--Sobic004G195650 Sobic006G029250--Sobic003G042000 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic006G029250--Sobic003G407950 Sobic006G029250--Sobic004G311550 Sobic006G029250--Sobic004G056350 Sobic006G029250--Sobic006G257250 Sobic009G024166--Sobic006G257250 Sobic009G024166--Sobic004G056350 Sobic009G024166--Sobic004G311550 Sobic009G024166--Sobic008G028850 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic009G024166--Sobic003G090100 Sobic009G024166--Sobic006G113700 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic009G024166--Sobic005G207900 Sobic009G024166--Sobic003G042000 Sobic009G024166--Sobic006G011700 Sobic009G034250--Sobic006G029250 Sobic009G034250--Sobic009G013850 Sobic009G034250--Sobic007G082700 Sobic009G034250--Sobic004G195650 Sobic009G034250--Sobic003G407950 Sobic009G034250--Sobic003G042000 Sobic009G034250--Sobic004G311550 Sobic009G034250--Sobic004G056350 Sobic009G034250--Sobic006G257250
Octagon: transcription factors


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