Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G191400.1
Synonym Sb05g024820, ATBPM3, BPM3
Functional annotation MBTB63 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt Q8LJX3
Pfam PF00917 PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF168
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39760 : BTB/POZ/MATH-domains containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g40490.1 : MBTB63 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G013850 - -
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19 Sobic.004G127500 - -
20 Sobic.004G224350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G191400 Sobic005G191400 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic005G191400--Sobic009G013850 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic005G191400--Sobic004G311550 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic005G191400--Sobic004G056350 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic005G191400--Sobic006G257250 Sobic004G198350 Sobic004G198350 Sobic005G191400--Sobic004G198350 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic005G191400--Sobic003G042000 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic005G191400--Sobic007G082700 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic005G191400--Sobic009G024166 Sobic006G029250 Sobic006G029250 Sobic005G191400--Sobic006G029250 Sobic009G013850--Sobic004G311550 Sobic009G013850--Sobic004G056350 Sobic009G013850--Sobic006G257250 Sobic009G013850--Sobic007G082700 Sobic009G013850--Sobic003G042000 Sobic009G013850--Sobic006G029250 Sobic009G013850--Sobic009G024166 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic009G013850--Sobic009G034250 Sobic004G195650 Sobic004G195650 Sobic009G013850--Sobic004G195650 Sobic004G311550--Sobic004G056350 Sobic004G311550--Sobic006G257250 Sobic004G311550--Sobic009G024166 Sobic004G311550--Sobic003G042000 Sobic008G028850 Sobic008G028850 Sobic004G311550--Sobic008G028850 Sobic004G311550--Sobic007G082700 Sobic006G113700 Sobic006G113700 Sobic004G311550--Sobic006G113700 Sobic004G311550--Sobic009G013850 Sobic006G011700 Sobic006G011700 Sobic004G311550--Sobic006G011700 Sobic004G056350--Sobic006G257250 Sobic004G056350--Sobic004G311550 Sobic004G056350--Sobic009G024166 Sobic004G056350--Sobic003G042000 Sobic004G056350--Sobic008G028850 Sobic004G056350--Sobic007G082700 Sobic004G056350--Sobic006G113700 Sobic004G056350--Sobic009G013850 Sobic004G056350--Sobic006G011700 Sobic006G257250--Sobic004G056350 Sobic006G257250--Sobic004G311550 Sobic006G257250--Sobic009G024166 Sobic006G257250--Sobic003G042000 Sobic006G257250--Sobic008G028850 Sobic006G257250--Sobic007G082700 Sobic006G257250--Sobic006G113700 Sobic006G257250--Sobic009G013850 Sobic006G257250--Sobic006G011700 Sobic004G198350--Sobic007G082700 Sobic004G198350--Sobic005G191400 Sobic004G198350--Sobic009G013850 Sobic004G198350--Sobic003G042000 Sobic004G198350--Sobic006G029250 Sobic004G198350--Sobic004G311550 Sobic004G198350--Sobic004G056350 Sobic004G198350--Sobic006G257250 Sobic004G198350--Sobic009G034250 Sobic003G042000--Sobic004G311550 Sobic003G042000--Sobic004G056350 Sobic003G042000--Sobic006G257250 Sobic003G042000--Sobic009G024166 Sobic003G042000--Sobic007G082700 Sobic003G042000--Sobic009G013850 Sobic003G042000--Sobic008G028850 Sobic003G042000--Sobic006G113700 Sobic003G042000--Sobic006G011700 Sobic007G082700--Sobic004G311550 Sobic007G082700--Sobic004G056350 Sobic007G082700--Sobic006G257250 Sobic007G082700--Sobic009G013850 Sobic007G082700--Sobic003G042000 Sobic002G157950 Sobic002G157950 Sobic007G082700--Sobic002G157950 Sobic007G082700--Sobic006G029250 Sobic007G082700--Sobic009G024166 Sobic007G082700--Sobic009G034250 Sobic009G024166--Sobic006G257250 Sobic009G024166--Sobic004G056350 Sobic009G024166--Sobic004G311550 Sobic009G024166--Sobic008G028850 Sobic003G090100 Sobic003G090100 Sobic009G024166--Sobic003G090100 Sobic009G024166--Sobic006G113700 Sobic005G207900 Sobic005G207900 Sobic009G024166--Sobic005G207900 Sobic009G024166--Sobic003G042000 Sobic009G024166--Sobic006G011700 Sobic006G029250--Sobic009G034250 Sobic006G029250--Sobic009G013850 Sobic006G029250--Sobic007G082700 Sobic006G029250--Sobic004G195650 Sobic006G029250--Sobic003G042000 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic006G029250--Sobic003G407950 Sobic006G029250--Sobic004G311550 Sobic006G029250--Sobic004G056350 Sobic006G029250--Sobic006G257250
Octagon: transcription factors


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