Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G020800.1
Synonym SbSAUR52, Sb07g001820, small auxin up RNA
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expression not supported" (PubMedID : 20499123)
OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
UniProt C5YMF1
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31374 PTHR31374:SF54
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14488; SAUR family protein
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G21210 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g02520.1 : OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030231
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G010050 - -
2 Sobic.006G075650 - -
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11 Sobic.005G191000 MBTB68 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.003G066200 expressed protein -
13 Sobic.004G264450 - -
14 Sobic.001G539100 - -
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19 Sobic.006G024800 - -
20 Sobic.003G405400 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G020800 Sobic007G020800 Sobic004G010050 Sobic004G010050 Sobic007G020800--Sobic004G010050 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic007G020800--Sobic006G075650 Sobic008G159200 Sobic008G159200 Sobic007G020800--Sobic008G159200 Sobic003G035266 Sobic003G035266 Sobic007G020800--Sobic003G035266 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic007G020800--Sobic005G062300 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic007G020800--Sobic009G037400 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic007G020800--Sobic009G019301 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic007G020800--Sobic005G077666 Sobic009G075300 Sobic009G075300 Sobic007G020800--Sobic009G075300 Sobic004G010050--Sobic003G035266 Sobic004G010050--Sobic009G019301 Sobic004G010050--Sobic006G075650 Sobic004G010050--Sobic008G159200 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic004G010050--Sobic002G369100 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic004G010050--Sobic001G539100 Sobic004G010050--Sobic007G020800 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic004G010050--Sobic003G405400 Sobic004G010050--Sobic005G062300 Sobic006G075650--Sobic003G405400 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic006G075650--Sobic001G211101 Sobic006G075650--Sobic001G539100 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic006G075650--Sobic003G178101 Sobic006G075650--Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic005G062300 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic006G075650--Sobic003G384650 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic006G075650--Sobic002G099500 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic006G075650--Sobic002G218350 Sobic008G159200--Sobic006G075650 Sobic008G159200--Sobic003G035266 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic008G159200--Sobic005G190400 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic008G159200--Sobic005G102750 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic008G159200--Sobic003G094850 Sobic008G159200--Sobic002G218350 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic008G159200--Sobic009G219601 Sobic008G159200--Sobic005G062300 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic008G159200--Sobic003G268650 Sobic003G035266--Sobic008G159200 Sobic003G035266--Sobic009G019301 Sobic003G035266--Sobic002G218350 Sobic003G035266--Sobic006G075650 Sobic003G035266--Sobic001G539100 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic003G035266--Sobic007G078400 Sobic003G035266--Sobic003G405400 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic003G035266--Sobic002G304200 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic003G035266--Sobic010G158300 Sobic005G062300--Sobic006G075650 Sobic005G062300--Sobic001G211101 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic005G062300--Sobic001G218300 Sobic005G062300--Sobic003G178101 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic002G099500 Sobic005G062300--Sobic003G384650 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic005G077666 Sobic001G273600 Sobic001G273600 Sobic009G037400--Sobic001G273600 Sobic002G034900 Sobic002G034900 Sobic009G037400--Sobic002G034900 Sobic009G248700 Sobic009G248700 Sobic009G037400--Sobic009G248700 Sobic003G434500 Sobic003G434500 Sobic009G037400--Sobic003G434500 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G037400--Sobic001G018700 Sobic009G019301--Sobic001G539100 Sobic009G019301--Sobic003G405400 Sobic009G019301--Sobic006G075650 Sobic009G019301--Sobic002G218350 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic009G019301--Sobic005G193900 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic009G019301--Sobic007G146800 Sobic009G019301--Sobic001G018700 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic005G077666--Sobic007G181801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic005G077666--Sobic004G123801 Sobic005G077666--Sobic009G219601 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic005G077666--Sobic010G090550 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic005G077666--Sobic001G338200 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic005G077666--Sobic008G146801 Sobic005G077666--Sobic001G211101 Sobic005G077666--Sobic001G018700 Sobic009G075300--Sobic005G190400 Sobic009G075300--Sobic005G102750 Sobic009G075300--Sobic003G094850 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic009G075300--Sobic003G066200 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic009G075300--Sobic002G397001 Sobic009G075300--Sobic008G146801 Sobic009G075300--Sobic009G037400 Sobic009G075300--Sobic009G219601 Sobic009G075300--Sobic005G193900
Octagon: transcription factors


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