Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G264450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQ54
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G211101 - -
2 Sobic.005G062300 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.008G106550 - -
4 Sobic.006G075650 - -
5 Sobic.001G218300 MATH domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G304200 expressed protein -
7 Sobic.005G077666 - -
8 Sobic.006G190950 - K10706: SETX, senataxin
9 Sobic.001G338200 RNA-directed DNA polymerase, putative, expressed -
10 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.003G178101 - K09490: HSPA5, endoplasmic reticulum chaperone BiP
12 Sobic.010G090550 - -
13 Sobic.002G026600 OsMADS90 - MADS-box family gene with M-beta type-box, expressed -
14 Sobic.003G197700 OsFBX12 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G218050 - -
16 Sobic.005G181400 - -
17 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
18 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G264450 Sobic004G264450 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic004G264450--Sobic001G211101 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic004G264450--Sobic005G062300 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic004G264450--Sobic008G106550 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic004G264450--Sobic006G075650 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic004G264450--Sobic001G218300 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic004G264450--Sobic002G304200 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic004G264450--Sobic005G077666 Sobic006G190950 Sobic006G190950 Sobic004G264450--Sobic006G190950 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic004G264450--Sobic001G338200 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic001G211101--Sobic003G178101 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic001G211101--Sobic001G018700 Sobic005G062300--Sobic006G075650 Sobic005G062300--Sobic001G211101 Sobic005G062300--Sobic001G218300 Sobic005G062300--Sobic003G178101 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic005G120466 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic005G062300--Sobic002G099500 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G062300--Sobic003G384650 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic005G077666 Sobic008G106550--Sobic006G190950 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic008G106550--Sobic009G067700 Sobic008G106550--Sobic001G018700 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic006G075650--Sobic003G405400 Sobic006G075650--Sobic001G211101 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic003G178101 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic005G062300 Sobic006G075650--Sobic003G384650 Sobic006G075650--Sobic002G099500 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic006G075650--Sobic002G218350 Sobic001G218300--Sobic005G062300 Sobic001G218300--Sobic001G211101 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic001G218300--Sobic007G023650 Sobic001G218300--Sobic003G178101 Sobic001G218300--Sobic006G075650 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic001G218300--Sobic005G193900 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic001G218300--Sobic002G069700 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic001G218300--Sobic009G110300 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic001G218300--Sobic009G196500 Sobic002G304200--Sobic008G106550 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic002G304200--Sobic007G078400 Sobic002G304200--Sobic002G218350 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic002G304200--Sobic010G158300 Sobic002G304200--Sobic006G190950 Sobic002G304200--Sobic009G067700 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic002G304200--Sobic002G026600 Sobic002G304200--Sobic001G338200 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic002G304200--Sobic010G090550 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic005G077666--Sobic007G181801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic005G077666--Sobic004G123801 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic005G077666--Sobic009G219601 Sobic005G077666--Sobic010G090550 Sobic005G077666--Sobic001G338200 Sobic008G146801 Sobic008G146801 Sobic005G077666--Sobic008G146801 Sobic005G077666--Sobic001G211101 Sobic005G077666--Sobic001G018700 Sobic006G190950--Sobic008G106550 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic006G190950--Sobic001G030800 Sobic006G190950--Sobic003G178101 Sobic003G262000 Sobic003G262000 Sobic006G190950--Sobic003G262000 Sobic006G190950--Sobic003G384650 Sobic006G190950--Sobic001G018700 Sobic001G338200--Sobic010G090550 Sobic001G338200--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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