Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G181400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTB1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G197700 OsFBX12 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G026600 OsMADS90 - MADS-box family gene with M-beta type-box, expressed -
3 Sobic.010G052450 - -
4 Sobic.010G017600 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
5 Sobic.005G125100 basic region leucine zipper domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G106550 - -
7 Sobic.002G304200 expressed protein -
8 Sobic.004G285300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.002G080500 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
10 Sobic.006G190950 - K10706: SETX, senataxin
11 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
12 Sobic.004G264450 - -
13 Sobic.002G291850 - -
14 Sobic.008G130350 - -
15 Sobic.005G097201 - -
16 Sobic.004G015050 - -
17 Sobic.004G080350 - -
18 Sobic.002G349200 expressed protein K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G181400 Sobic005G181400 Sobic003G197700 Sobic003G197700 Sobic005G181400--Sobic003G197700 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic005G181400--Sobic002G026600 Sobic010G052450 Sobic010G052450 Sobic005G181400--Sobic010G052450 Sobic010G017600 Sobic010G017600 Sobic005G181400--Sobic010G017600 Sobic005G125100 Sobic005G125100 Sobic005G181400--Sobic005G125100 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic005G181400--Sobic008G106550 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic005G181400--Sobic002G304200 Sobic004G285300 Sobic004G285300 Sobic005G181400--Sobic004G285300 Sobic002G080500 Sobic002G080500 Sobic005G181400--Sobic002G080500 Sobic003G197700--Sobic005G181400 Sobic003G197700--Sobic002G026600 Sobic003G197700--Sobic010G052450 Sobic003G197700--Sobic010G017600 Sobic003G197700--Sobic005G125100 Sobic003G197700--Sobic008G106550 Sobic003G197700--Sobic002G304200 Sobic003G197700--Sobic004G285300 Sobic003G197700--Sobic002G080500 Sobic002G026600--Sobic003G197700 Sobic002G026600--Sobic005G181400 Sobic002G026600--Sobic010G017600 Sobic002G026600--Sobic010G052450 Sobic002G026600--Sobic008G106550 Sobic002G026600--Sobic005G125100 Sobic002G026600--Sobic002G304200 Sobic002G026600--Sobic004G285300 Sobic006G190950 Sobic006G190950 Sobic002G026600--Sobic006G190950 Sobic010G052450--Sobic005G181400 Sobic010G052450--Sobic003G197700 Sobic010G052450--Sobic002G026600 Sobic010G052450--Sobic010G017600 Sobic010G052450--Sobic002G080500 Sobic010G052450--Sobic004G285300 Sobic010G052450--Sobic005G125100 Sobic004G015050 Sobic004G015050 Sobic010G052450--Sobic004G015050 Sobic005G097201 Sobic005G097201 Sobic010G052450--Sobic005G097201 Sobic010G017600--Sobic002G026600 Sobic010G017600--Sobic003G197700 Sobic010G017600--Sobic005G181400 Sobic010G017600--Sobic010G052450 Sobic010G017600--Sobic008G106550 Sobic010G017600--Sobic005G125100 Sobic010G017600--Sobic002G304200 Sobic010G017600--Sobic004G285300 Sobic010G017600--Sobic006G190950 Sobic005G125100--Sobic003G197700 Sobic005G125100--Sobic005G181400 Sobic005G125100--Sobic002G026600 Sobic005G125100--Sobic010G052450 Sobic005G125100--Sobic010G017600 Sobic005G125100--Sobic008G106550 Sobic002G349200 Sobic002G349200 Sobic005G125100--Sobic002G349200 Sobic005G125100--Sobic002G304200 Sobic005G125100--Sobic004G285300 Sobic008G106550--Sobic006G190950 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic008G106550--Sobic009G067700 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic008G106550--Sobic001G018700 Sobic002G304200--Sobic008G106550 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic002G304200--Sobic007G078400 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic002G304200--Sobic002G218350 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic002G304200--Sobic010G158300 Sobic002G304200--Sobic006G190950 Sobic002G304200--Sobic009G067700 Sobic002G304200--Sobic002G026600 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic002G304200--Sobic001G338200 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic002G304200--Sobic010G090550 Sobic004G285300--Sobic010G052450 Sobic004G285300--Sobic010G017600 Sobic004G285300--Sobic005G181400 Sobic004G285300--Sobic003G197700 Sobic004G285300--Sobic002G080500 Sobic004G285300--Sobic002G026600 Sobic001G538200 Sobic001G538200 Sobic004G285300--Sobic001G538200 Sobic004G285300--Sobic004G015050 Sobic004G285300--Sobic005G097201 Sobic002G080500--Sobic004G015050 Sobic002G080500--Sobic010G052450 Sobic005G189600 Sobic005G189600 Sobic002G080500--Sobic005G189600 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic002G080500--Sobic010G121900 Sobic002G080500--Sobic005G097201 Sobic002G080500--Sobic005G181400 Sobic002G080500--Sobic003G197700 Sobic002G080500--Sobic004G285300 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic002G080500--Sobic004G015150
Octagon: transcription factors


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