Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G010050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5XS82 , H0I495
Pfam -
Panther DB PTHR33075 PTHR33075:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g25310.1 : zinc knuckle family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G035266 - -
2 Sobic.009G019301 - -
3 Sobic.006G075650 - -
4 Sobic.008G159200 - -
5 Sobic.002G369100 expressed protein -
6 Sobic.001G539100 - -
7 Sobic.007G020800 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
8 Sobic.003G405400 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G062300 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.002G182601 - -
11 Sobic.005G222300 enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed K05605: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase
12 Sobic.003G262000 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
13 Sobic.007G086400 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
14 Sobic.005G191000 MBTB68 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.007G116733 - -
16 Sobic.002G218350 - -
17 Sobic.003G293550 - -
18 Sobic.004G256550 - -
19 Sobic.003G066200 expressed protein -
20 Sobic.001G211101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G010050 Sobic004G010050 Sobic003G035266 Sobic003G035266 Sobic004G010050--Sobic003G035266 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic004G010050--Sobic009G019301 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic004G010050--Sobic006G075650 Sobic008G159200 Sobic008G159200 Sobic004G010050--Sobic008G159200 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic004G010050--Sobic002G369100 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic004G010050--Sobic001G539100 Sobic007G020800 Sobic007G020800 Sobic004G010050--Sobic007G020800 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic004G010050--Sobic003G405400 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic004G010050--Sobic005G062300 Sobic003G035266--Sobic008G159200 Sobic003G035266--Sobic009G019301 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic003G035266--Sobic002G218350 Sobic003G035266--Sobic006G075650 Sobic003G035266--Sobic001G539100 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic003G035266--Sobic007G078400 Sobic003G035266--Sobic003G405400 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic003G035266--Sobic002G304200 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic003G035266--Sobic010G158300 Sobic009G019301--Sobic001G539100 Sobic009G019301--Sobic003G405400 Sobic009G019301--Sobic006G075650 Sobic009G019301--Sobic002G218350 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic009G019301--Sobic005G193900 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic009G019301--Sobic007G146800 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G019301--Sobic001G018700 Sobic006G075650--Sobic003G405400 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic006G075650--Sobic001G211101 Sobic006G075650--Sobic001G539100 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic006G075650--Sobic003G178101 Sobic006G075650--Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic005G062300 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic006G075650--Sobic003G384650 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic006G075650--Sobic002G099500 Sobic006G075650--Sobic002G218350 Sobic008G159200--Sobic006G075650 Sobic008G159200--Sobic003G035266 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic008G159200--Sobic005G190400 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic008G159200--Sobic005G102750 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic008G159200--Sobic003G094850 Sobic008G159200--Sobic002G218350 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic008G159200--Sobic009G219601 Sobic008G159200--Sobic005G062300 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic008G159200--Sobic003G268650 Sobic002G369100--Sobic009G019301 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic002G369100--Sobic004G204700 Sobic002G369100--Sobic001G539100 Sobic002G369100--Sobic003G405400 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic002G369100--Sobic009G067700 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic002G369100--Sobic009G225250 Sobic002G369100--Sobic006G075650 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic002G369100--Sobic009G062150 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic002G369100--Sobic002G291850 Sobic001G539100--Sobic003G405400 Sobic001G539100--Sobic009G019301 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic001G539100--Sobic001G030800 Sobic001G539100--Sobic002G218350 Sobic001G539100--Sobic005G193900 Sobic001G539100--Sobic001G018700 Sobic007G020800--Sobic004G010050 Sobic007G020800--Sobic006G075650 Sobic007G020800--Sobic008G159200 Sobic007G020800--Sobic003G035266 Sobic007G020800--Sobic005G062300 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic007G020800--Sobic009G037400 Sobic007G020800--Sobic009G019301 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic007G020800--Sobic005G077666 Sobic009G075300 Sobic009G075300 Sobic007G020800--Sobic009G075300 Sobic003G405400--Sobic001G539100 Sobic003G405400--Sobic001G018700 Sobic005G062300--Sobic006G075650 Sobic005G062300--Sobic001G211101 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic005G062300--Sobic001G218300 Sobic005G062300--Sobic003G178101 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic002G099500 Sobic005G062300--Sobic003G384650 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic005G077666
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.