Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G067300.1
Synonym Sb07g005320
Functional annotation Cupin domain containing protein, expressed
UniProt C5YI24
Pfam PF07883
Panther DB PTHR31238 PTHR31238:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G39110 : RmlC-like cupins superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g05860.1 : Cupin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054792 , Zm00025a029970 , Zm00025a029971 , Zm00025a029972 , Zm00025a029973 , Zm00025a029974 , Zm00025a029975
Brachypodium KQJ95106
Barley -
Wheat TraesCSU02G253400 , TraesCSU02G222000 , TraesCS5A02G544500 , TraesCS3D02G011000 , TraesCS3A02G012400 , TraesCS4B02G377100 , TraesCSU02G145300 , TraesCS4B02G377400 , TraesCS5A02G544400 , TraesCSU02G145700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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15 Sobic.001G121850 - -
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17 Sobic.001G121850 - -
18 Sobic.001G121850 - -
19 Sobic.001G121850 - -
20 Sobic.001G121850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G067300 Sobic007G067300 Sobic001G342700 Sobic001G342700 Sobic007G067300--Sobic001G342700 Sobic005G169100 Sobic005G169100 Sobic007G067300--Sobic005G169100 Sobic006G206900 Sobic006G206900 Sobic007G067300--Sobic006G206900 Sobic008G068166 Sobic008G068166 Sobic007G067300--Sobic008G068166 Sobic005G045500 Sobic005G045500 Sobic007G067300--Sobic005G045500 Sobic010G102300 Sobic010G102300 Sobic007G067300--Sobic010G102300 Sobic007G015800 Sobic007G015800 Sobic007G067300--Sobic007G015800 Sobic007G066908 Sobic007G066908 Sobic007G067300--Sobic007G066908 Sobic009G009400 Sobic009G009400 Sobic007G067300--Sobic009G009400 Sobic001G342700--Sobic007G067300 Sobic001G343601 Sobic001G343601 Sobic001G342700--Sobic001G343601 Sobic001G342700--Sobic009G009400 Sobic001G342700--Sobic005G169100 Sobic002G146100 Sobic002G146100 Sobic001G342700--Sobic002G146100 Sobic006G033260 Sobic006G033260 Sobic001G342700--Sobic006G033260 Sobic002G182500 Sobic002G182500 Sobic001G342700--Sobic002G182500 Sobic001G342700--Sobic008G068166 Sobic008G054150 Sobic008G054150 Sobic001G342700--Sobic008G054150 Sobic005G169100--Sobic007G067300 Sobic005G169100--Sobic001G342700 Sobic005G169100--Sobic007G015800 Sobic005G169100--Sobic007G066908 Sobic005G169100--Sobic006G206900 Sobic005G169100--Sobic010G102300 Sobic005G169100--Sobic002G182500 Sobic010G035700 Sobic010G035700 Sobic005G169100--Sobic010G035700 Sobic001G319700 Sobic001G319700 Sobic005G169100--Sobic001G319700 Sobic006G206900--Sobic005G045500 Sobic002G024650 Sobic002G024650 Sobic006G206900--Sobic002G024650 Sobic001G121850 Sobic001G121850 Sobic006G206900--Sobic001G121850 Sobic008G068166--Sobic007G067300 Sobic008G068166--Sobic005G169100 Sobic008G068166--Sobic001G342700 Sobic008G068166--Sobic009G009400 Sobic008G068166--Sobic006G206900 Sobic008G068166--Sobic007G066908 Sobic001G495148 Sobic001G495148 Sobic008G068166--Sobic001G495148 Sobic008G068166--Sobic001G121850 Sobic005G045500--Sobic001G121850 Sobic005G045500--Sobic002G024650 Sobic010G102300--Sobic001G319700 Sobic002G195400 Sobic002G195400 Sobic010G102300--Sobic002G195400 Sobic010G102300--Sobic010G035700 Sobic007G066932 Sobic007G066932 Sobic010G102300--Sobic007G066932 Sobic003G426100 Sobic003G426100 Sobic010G102300--Sobic003G426100 Sobic007G067600 Sobic007G067600 Sobic010G102300--Sobic007G067600 Sobic007G067350 Sobic007G067350 Sobic010G102300--Sobic007G067350 Sobic004G304300 Sobic004G304300 Sobic010G102300--Sobic004G304300 Sobic001G231600 Sobic001G231600 Sobic010G102300--Sobic001G231600 Sobic007G015800--Sobic002G024650 Sobic007G015800--Sobic001G121850 Sobic007G066908--Sobic007G015800 Sobic002G024800 Sobic002G024800 Sobic007G066908--Sobic002G024800 Sobic007G066908--Sobic002G024650 Sobic007G066908--Sobic001G121850 Sobic009G009400--Sobic001G343601 Sobic007G169500 Sobic007G169500 Sobic009G009400--Sobic007G169500 Sobic009G009400--Sobic008G054150 Sobic009G009400--Sobic001G342700 Sobic009G043700 Sobic009G043700 Sobic009G009400--Sobic009G043700 Sobic004G115500 Sobic004G115500 Sobic009G009400--Sobic004G115500 Sobic001G260000 Sobic001G260000 Sobic009G009400--Sobic001G260000 Sobic009G009400--Sobic002G146100 Sobic009G009400--Sobic002G182500
Octagon: transcription factors


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