Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G017000.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PAZ2
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33326 PTHR33326:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.002G175700 STE_MEK_ste7_MAP2K.3 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K04368: MAP2K1, mitogen-activated protein kinase kinase 1
19 Sobic.005G196566 - -
20 Sobic.008G139250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G017000 Sobic008G017000 Sobic002G384600 Sobic002G384600 Sobic008G017000--Sobic002G384600 Sobic008G099166 Sobic008G099166 Sobic008G017000--Sobic008G099166 Sobic001G018350 Sobic001G018350 Sobic008G017000--Sobic001G018350 Sobic001G165301 Sobic001G165301 Sobic008G017000--Sobic001G165301 Sobic003G281700 Sobic003G281700 Sobic008G017000--Sobic003G281700 Sobic002G153900 Sobic002G153900 Sobic008G017000--Sobic002G153900 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic008G017000--Sobic004G358301 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic008G017000--Sobic010G147300 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic008G017000--Sobic003G126750 Sobic002G384600--Sobic002G153900 Sobic006G026300 Sobic006G026300 Sobic002G384600--Sobic006G026300 Sobic002G384600--Sobic004G358301 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic002G384600--Sobic005G031901 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic002G384600--Sobic004G358200 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic002G384600--Sobic001G261464 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic002G384600--Sobic006G109600 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic002G384600--Sobic002G026150 Sobic002G384600--Sobic010G147300 Sobic008G099166--Sobic002G153900 Sobic004G243700 Sobic004G243700 Sobic008G099166--Sobic004G243700 Sobic008G099166--Sobic003G126750 Sobic008G099166--Sobic001G261464 Sobic002G269900 Sobic002G269900 Sobic008G099166--Sobic002G269900 Sobic008G099166--Sobic002G026150 Sobic008G099166--Sobic008G017000 Sobic008G099166--Sobic006G109600 Sobic008G099166--Sobic002G384600 Sobic001G018350--Sobic001G165301 Sobic001G018350--Sobic005G031901 Sobic001G018350--Sobic006G109600 Sobic001G018350--Sobic003G126750 Sobic001G018350--Sobic010G147300 Sobic001G018350--Sobic001G261464 Sobic001G018350--Sobic004G358301 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic001G018350--Sobic002G100100 Sobic001G018350--Sobic002G026150 Sobic001G165301--Sobic001G018350 Sobic001G165301--Sobic005G031901 Sobic001G165301--Sobic006G109600 Sobic001G165301--Sobic003G126750 Sobic001G165301--Sobic010G147300 Sobic001G165301--Sobic001G261464 Sobic001G165301--Sobic004G358301 Sobic001G165301--Sobic002G100100 Sobic001G165301--Sobic002G026150 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic003G281700--Sobic007G064000 Sobic003G281700--Sobic003G126750 Sobic003G281700--Sobic005G031901 Sobic003G281700--Sobic004G358301 Sobic003G281700--Sobic010G147300 Sobic003G281700--Sobic006G109600 Sobic003G281700--Sobic001G261464 Sobic003G281700--Sobic002G100100 Sobic003G281700--Sobic004G358200 Sobic002G153900--Sobic003G126750 Sobic002G153900--Sobic004G358200 Sobic002G153900--Sobic001G261464 Sobic002G153900--Sobic002G026150 Sobic002G153900--Sobic006G026300 Sobic002G153900--Sobic006G109600 Sobic002G153900--Sobic005G031901 Sobic002G153900--Sobic004G358301 Sobic002G153900--Sobic002G100100 Sobic004G358301--Sobic005G031901 Sobic004G358301--Sobic010G147300 Sobic004G358301--Sobic003G126750 Sobic004G358301--Sobic006G109600 Sobic004G358301--Sobic001G261464 Sobic004G358301--Sobic002G100100 Sobic004G358301--Sobic002G026150 Sobic004G358301--Sobic002G153900 Sobic004G358301--Sobic004G243700 Sobic010G147300--Sobic005G031901 Sobic010G147300--Sobic006G109600 Sobic010G147300--Sobic003G126750 Sobic010G147300--Sobic001G261464 Sobic010G147300--Sobic004G358301 Sobic010G147300--Sobic002G100100 Sobic010G147300--Sobic002G026150 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic010G147300--Sobic002G175700 Sobic010G147300--Sobic007G064000 Sobic003G126750--Sobic006G109600 Sobic003G126750--Sobic005G031901 Sobic003G126750--Sobic002G026150 Sobic003G126750--Sobic001G261464 Sobic003G126750--Sobic010G147300 Sobic003G126750--Sobic002G100100 Sobic003G126750--Sobic004G358301 Sobic003G126750--Sobic004G243700 Sobic003G126750--Sobic002G153900
Octagon: transcription factors


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