Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G041600.2,Sobic.008G041600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PB80
Pfam -
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g40920.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G041450 - -
2 Sobic.007G101000 - -
3 Sobic.005G157500 zinc knuckle family protein, expressed -
4 Sobic.001G135650 - -
5 Sobic.003G141600 - -
6 Sobic.004G098800 - -
7 Sobic.005G078300 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G110487 - -
9 Sobic.009G253600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
10 Sobic.010G138600 expressed protein -
11 Sobic.004G150901 - -
12 Sobic.008G091785 - -
13 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
14 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.008G084000 - -
16 Sobic.010G134700 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@peptidyl-prolyl isomerase, putative, expressed K09571: FK506-binding protein 4/5
17 Sobic.005G171700 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G078000 - -
19 Sobic.003G392275 - -
20 Sobic.003G385000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@serine/threonine protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G041600 Sobic008G041600 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic008G041600--Sobic008G041450 Sobic007G101000 Sobic007G101000 Sobic008G041600--Sobic007G101000 Sobic005G157500 Sobic005G157500 Sobic008G041600--Sobic005G157500 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic008G041600--Sobic001G135650 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic008G041600--Sobic003G141600 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic008G041600--Sobic004G098800 Sobic005G078300 Sobic005G078300 Sobic008G041600--Sobic005G078300 Sobic005G110487 Sobic005G110487 Sobic008G041600--Sobic005G110487 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic008G041600--Sobic009G253600 Sobic008G041450--Sobic004G098800 Sobic008G041450--Sobic008G041600 Sobic008G041450--Sobic003G141600 Sobic010G134700 Sobic010G134700 Sobic008G041450--Sobic010G134700 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic008G041450--Sobic003G392275 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic008G041450--Sobic003G385000 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic008G041450--Sobic010G006800 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic008G041450--Sobic002G102300 Sobic001G414100 Sobic001G414100 Sobic008G041450--Sobic001G414100 Sobic007G101000--Sobic005G110487 Sobic006G034650 Sobic006G034650 Sobic007G101000--Sobic006G034650 Sobic007G101000--Sobic008G041600 Sobic005G181600 Sobic005G181600 Sobic007G101000--Sobic005G181600 Sobic007G101000--Sobic008G041450 Sobic005G071500 Sobic005G071500 Sobic007G101000--Sobic005G071500 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic007G101000--Sobic001G216900 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic007G101000--Sobic001G509400 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic007G101000--Sobic008G044750 Sobic007G191000 Sobic007G191000 Sobic005G157500--Sobic007G191000 Sobic005G157500--Sobic008G041600 Sobic005G157500--Sobic001G135650 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic005G157500--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic005G157500--Sobic009G021050 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic005G157500--Sobic004G150901 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic005G157500--Sobic008G084000 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic005G157500--Sobic010G138600 Sobic005G157500--Sobic009G253600 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic001G135650--Sobic008G091785 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic001G135650--Sobic002G106700 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic009G253600 Sobic001G135650--Sobic010G138600 Sobic001G135650--Sobic004G150901 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic001G135650--Sobic003G078000 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic001G135650--Sobic008G164000 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic001G135650--Sobic006G230000 Sobic003G141600--Sobic004G098800 Sobic003G141600--Sobic008G041450 Sobic003G141600--Sobic003G392275 Sobic003G141600--Sobic010G006800 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic003G141600--Sobic001G490950 Sobic003G141600--Sobic002G102300 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic003G141600--Sobic002G368100 Sobic003G141600--Sobic010G134700 Sobic004G178700 Sobic004G178700 Sobic003G141600--Sobic004G178700 Sobic004G098800--Sobic010G134700 Sobic004G098800--Sobic008G041450 Sobic004G098800--Sobic003G392275 Sobic004G098800--Sobic003G385000 Sobic004G098800--Sobic010G006800 Sobic004G098800--Sobic003G141600 Sobic004G098800--Sobic001G490950 Sobic004G098800--Sobic002G102300 Sobic004G032600 Sobic004G032600 Sobic004G098800--Sobic004G032600 Sobic005G078300--Sobic003G141600 Sobic005G078300--Sobic001G490950 Sobic005G078300--Sobic010G006800 Sobic005G078300--Sobic008G041450 Sobic005G078300--Sobic002G102300 Sobic005G078300--Sobic004G032600 Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic005G078300--Sobic001G226900 Sobic005G078300--Sobic004G098800 Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic005G078300--Sobic003G356800 Sobic005G110487--Sobic006G034650 Sobic005G110487--Sobic007G101000 Sobic004G045800 Sobic004G045800 Sobic005G110487--Sobic004G045800 Sobic002G342100 Sobic002G342100 Sobic005G110487--Sobic002G342100 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic005G110487--Sobic009G128300 Sobic006G069200 Sobic006G069200 Sobic005G110487--Sobic006G069200 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic005G110487--Sobic002G182800 Sobic003G083000 Sobic003G083000 Sobic005G110487--Sobic003G083000 Sobic005G110487--Sobic001G509400 Sobic009G253600--Sobic010G138600 Sobic009G253600--Sobic004G150901 Sobic009G253600--Sobic008G091785 Sobic009G253600--Sobic008G084000 Sobic009G253600--Sobic007G007400 Sobic009G253600--Sobic002G106700 Sobic009G253600--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic007G139850 Sobic009G253600--Sobic009G021050
Octagon: transcription factors


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