Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G122200.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt Q8LJZ1 , A0A1B6PEG1 , Q8W0S7 , Q9XEQ1 , Q8LJY0 , Q8LK03 , C6JRK8
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45540 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g05400.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.001G120850 - -
15 Sobic.008G163750 - -
16 Sobic.008G145700 expressed protein -
17 Sobic.001G196950 - -
18 Sobic.007G086400 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
19 Sobic.005G214900 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.009G186100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G122200 Sobic008G122200 Sobic007G002400 Sobic007G002400 Sobic008G122200--Sobic007G002400 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic008G122200--Sobic004G093300 Sobic005G159100 Sobic005G159100 Sobic008G122200--Sobic005G159100 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic008G122200--Sobic009G185601 Sobic006G175100 Sobic006G175100 Sobic008G122200--Sobic006G175100 Sobic008G175966 Sobic008G175966 Sobic008G122200--Sobic008G175966 Sobic003G077001 Sobic003G077001 Sobic008G122200--Sobic003G077001 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic008G122200--Sobic002G113066 Sobic001G415901 Sobic001G415901 Sobic008G122200--Sobic001G415901 Sobic001G196950 Sobic001G196950 Sobic007G002400--Sobic001G196950 Sobic007G002400--Sobic004G093300 Sobic007G002400--Sobic009G185601 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic007G002400--Sobic001G097300 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic007G002400--Sobic007G086400 Sobic007G002400--Sobic006G175100 Sobic003G437900 Sobic003G437900 Sobic007G002400--Sobic003G437900 Sobic007G002400--Sobic008G122200 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic007G002400--Sobic005G120466 Sobic004G093300--Sobic009G185601 Sobic004G093300--Sobic005G120466 Sobic004G093300--Sobic007G086400 Sobic004G093300--Sobic001G097300 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic004G093300--Sobic003G095301 Sobic004G093300--Sobic003G437900 Sobic004G093300--Sobic007G002400 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic004G093300--Sobic003G123800 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic004G093300--Sobic009G005000 Sobic005G159100--Sobic001G415901 Sobic005G159100--Sobic003G077001 Sobic006G221900 Sobic006G221900 Sobic005G159100--Sobic006G221900 Sobic010G172600 Sobic010G172600 Sobic005G159100--Sobic010G172600 Sobic005G159100--Sobic002G113066 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic005G159100--Sobic001G120850 Sobic001G210500 Sobic001G210500 Sobic005G159100--Sobic001G210500 Sobic010G216500 Sobic010G216500 Sobic005G159100--Sobic010G216500 Sobic008G145700 Sobic008G145700 Sobic005G159100--Sobic008G145700 Sobic009G185601--Sobic001G097300 Sobic001G146450 Sobic001G146450 Sobic009G185601--Sobic001G146450 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic009G185601--Sobic001G374301 Sobic009G185601--Sobic005G120466 Sobic009G185601--Sobic007G086400 Sobic009G185601--Sobic004G093300 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G185601--Sobic001G018700 Sobic006G175100--Sobic004G093300 Sobic006G175100--Sobic003G123800 Sobic006G175100--Sobic009G185601 Sobic006G175100--Sobic007G002400 Sobic006G175100--Sobic009G005000 Sobic006G175100--Sobic003G437900 Sobic006G175100--Sobic005G120466 Sobic006G175100--Sobic001G097300 Sobic008G048000 Sobic008G048000 Sobic006G175100--Sobic008G048000 Sobic008G175966--Sobic006G221900 Sobic008G175966--Sobic001G415901 Sobic008G175966--Sobic005G159100 Sobic008G175966--Sobic010G172600 Sobic008G175966--Sobic003G077001 Sobic008G175966--Sobic001G210500 Sobic008G175966--Sobic001G120850 Sobic008G175966--Sobic010G216500 Sobic008G175966--Sobic002G113066 Sobic003G077001--Sobic002G113066 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic003G077001--Sobic003G003900 Sobic003G077001--Sobic001G415901 Sobic003G077001--Sobic005G159100 Sobic003G077001--Sobic006G221900 Sobic003G077001--Sobic001G120850 Sobic003G077001--Sobic008G145700 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic003G077001--Sobic005G214900 Sobic003G077001--Sobic010G172600 Sobic002G113066--Sobic003G077001 Sobic002G113066--Sobic003G003900 Sobic002G113066--Sobic001G415901 Sobic002G113066--Sobic005G214900 Sobic002G113066--Sobic001G120850 Sobic002G113066--Sobic005G159100 Sobic002G113066--Sobic006G221900 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic002G113066--Sobic005G035850 Sobic002G113066--Sobic008G145700 Sobic001G415901--Sobic003G077001 Sobic001G415901--Sobic006G221900 Sobic001G415901--Sobic002G113066 Sobic001G415901--Sobic005G159100 Sobic001G415901--Sobic001G120850 Sobic001G415901--Sobic010G172600 Sobic001G415901--Sobic003G003900 Sobic001G415901--Sobic008G145700 Sobic001G415901--Sobic001G210500
Octagon: transcription factors


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