Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G174850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R7E1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G376332 - -
2 Sobic.006G113301 - -
3 Sobic.007G182700 POLD4B - Putative DNA polymerase delta complex subunit, expressed K03505: DNA polymerase delta subunit 4
4 Sobic.001G235600 - -
5 Sobic.006G250350 - -
6 Sobic.008G081100 - -
7 Sobic.008G174200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G259800 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed K00621: GNPNAT1, glucosamine-phosphate N-acetyltransferase
9 Sobic.009G078401 - -
10 Sobic.009G078300 expressed protein -
11 Sobic.003G185800 - -
12 Sobic.001G042100 expressed protein -
13 Sobic.005G148300 - -
14 Sobic.005G197900 expressed protein -
15 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
16 Sobic.002G075400 receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.008G138850 - -
18 Sobic.003G373050 - -
19 Sobic.003G059450 - -
20 Sobic.006G225000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G174850 Sobic008G174850 Sobic001G376332 Sobic001G376332 Sobic008G174850--Sobic001G376332 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic008G174850--Sobic006G113301 Sobic007G182700 Sobic007G182700 Sobic008G174850--Sobic007G182700 Sobic001G235600 Sobic001G235600 Sobic008G174850--Sobic001G235600 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic008G174850--Sobic006G250350 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic008G174850--Sobic008G081100 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic008G174850--Sobic008G174200 Sobic004G259800 Sobic004G259800 Sobic008G174850--Sobic004G259800 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic008G174850--Sobic009G078401 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic001G376332--Sobic002G168700 Sobic001G376332--Sobic001G235600 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic001G376332--Sobic003G373050 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic001G376332--Sobic009G078300 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic001G376332--Sobic003G031300 Sobic006G233900 Sobic006G233900 Sobic001G376332--Sobic006G233900 Sobic001G376332--Sobic009G078401 Sobic008G178600 Sobic008G178600 Sobic001G376332--Sobic008G178600 Sobic007G013700 Sobic007G013700 Sobic001G376332--Sobic007G013700 Sobic006G113301--Sobic006G250350 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic006G113301--Sobic001G112550 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic006G113301--Sobic007G050650 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic006G113301--Sobic007G050750 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic006G113301--Sobic001G042100 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic006G113301--Sobic005G049100 Sobic003G148950 Sobic003G148950 Sobic006G113301--Sobic003G148950 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic006G113301--Sobic002G018800 Sobic006G060400 Sobic006G060400 Sobic006G113301--Sobic006G060400 Sobic005G197900 Sobic005G197900 Sobic007G182700--Sobic005G197900 Sobic003G185800 Sobic003G185800 Sobic007G182700--Sobic003G185800 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic007G182700--Sobic003G059450 Sobic007G182700--Sobic006G113301 Sobic005G148300 Sobic005G148300 Sobic007G182700--Sobic005G148300 Sobic007G182700--Sobic008G174200 Sobic007G182700--Sobic009G078401 Sobic007G182700--Sobic003G031300 Sobic001G277700 Sobic001G277700 Sobic007G182700--Sobic001G277700 Sobic001G235600--Sobic003G373050 Sobic001G235600--Sobic002G168700 Sobic001G235600--Sobic009G078300 Sobic001G235600--Sobic001G376332 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic001G235600--Sobic009G077901 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic001G235600--Sobic002G018200 Sobic001G235600--Sobic009G078401 Sobic001G235600--Sobic008G174200 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic001G235600--Sobic009G178650 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic006G250350--Sobic001G443400 Sobic006G250350--Sobic006G113301 Sobic006G250350--Sobic001G042100 Sobic006G250350--Sobic008G081100 Sobic006G250350--Sobic002G018800 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic006G250350--Sobic005G165300 Sobic006G250350--Sobic007G050650 Sobic006G250350--Sobic001G112550 Sobic006G250350--Sobic008G174200 Sobic008G081100--Sobic001G443400 Sobic008G081100--Sobic008G174200 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic008G081100--Sobic005G192350 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic008G081100--Sobic010G166201 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic008G081100--Sobic010G259800 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic008G081100--Sobic009G258800 Sobic008G081100--Sobic006G250350 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic008G081100--Sobic002G022500 Sobic010G033750 Sobic010G033750 Sobic008G081100--Sobic010G033750 Sobic008G174200--Sobic008G081100 Sobic008G174200--Sobic009G078401 Sobic008G174200--Sobic009G078300 Sobic008G174200--Sobic001G443400 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic008G174200--Sobic008G138850 Sobic008G174200--Sobic010G033750 Sobic008G174200--Sobic001G235600 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic008G174200--Sobic004G278800 Sobic008G174200--Sobic003G059450 Sobic002G145600 Sobic002G145600 Sobic004G259800--Sobic002G145600 Sobic010G132100 Sobic010G132100 Sobic004G259800--Sobic010G132100 Sobic004G259800--Sobic008G174850 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic004G259800--Sobic001G449300 Sobic002G248800 Sobic002G248800 Sobic004G259800--Sobic002G248800 Sobic009G134766 Sobic009G134766 Sobic004G259800--Sobic009G134766 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic004G259800--Sobic009G255400 Sobic002G075300 Sobic002G075300 Sobic004G259800--Sobic002G075300 Sobic007G177901 Sobic007G177901 Sobic004G259800--Sobic007G177901 Sobic009G078401--Sobic009G078300 Sobic009G078401--Sobic008G138850 Sobic002G075400 Sobic002G075400 Sobic009G078401--Sobic002G075400 Sobic009G078401--Sobic004G278800 Sobic009G078401--Sobic008G174200 Sobic009G078401--Sobic002G168700 Sobic009G078401--Sobic003G059450 Sobic009G078401--Sobic001G235600 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic009G078401--Sobic001G325100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.