Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G029300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P6E6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G409850 - -
2 Sobic.008G079650 - -
3 Sobic.009G120850 - -
4 Sobic.001G270301 - -
5 Sobic.003G154200 serine carboxypeptidase, putative, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
6 Sobic.004G081701 - -
7 Sobic.002G094400 expressed protein -
8 Sobic.001G011100 - -
9 Sobic.009G206150 - -
10 Sobic.001G448900 OsFBX210 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G348800 - -
12 Sobic.002G215932 - -
13 Sobic.001G417100 - -
14 Sobic.007G115050 - -
15 Sobic.001G071250 - -
16 Sobic.002G104600 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
19 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
20 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase


Gene co-expression network
sample Sobic009G029300 Sobic009G029300 Sobic003G409850 Sobic003G409850 Sobic009G029300--Sobic003G409850 Sobic008G079650 Sobic008G079650 Sobic009G029300--Sobic008G079650 Sobic009G120850 Sobic009G120850 Sobic009G029300--Sobic009G120850 Sobic001G270301 Sobic001G270301 Sobic009G029300--Sobic001G270301 Sobic003G154200 Sobic003G154200 Sobic009G029300--Sobic003G154200 Sobic004G081701 Sobic004G081701 Sobic009G029300--Sobic004G081701 Sobic002G094400 Sobic002G094400 Sobic009G029300--Sobic002G094400 Sobic001G011100 Sobic001G011100 Sobic009G029300--Sobic001G011100 Sobic009G206150 Sobic009G206150 Sobic009G029300--Sobic009G206150 Sobic003G409850--Sobic009G120850 Sobic003G409850--Sobic009G029300 Sobic003G409850--Sobic008G079650 Sobic003G409850--Sobic001G011100 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic003G409850--Sobic005G083932 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic003G409850--Sobic001G317900 Sobic004G329600 Sobic004G329600 Sobic008G079650--Sobic004G329600 Sobic004G000900 Sobic004G000900 Sobic008G079650--Sobic004G000900 Sobic008G079650--Sobic009G029300 Sobic001G164800 Sobic001G164800 Sobic008G079650--Sobic001G164800 Sobic002G394900 Sobic002G394900 Sobic008G079650--Sobic002G394900 Sobic006G234433 Sobic006G234433 Sobic008G079650--Sobic006G234433 Sobic001G166900 Sobic001G166900 Sobic008G079650--Sobic001G166900 Sobic001G122600 Sobic001G122600 Sobic008G079650--Sobic001G122600 Sobic009G120850--Sobic003G409850 Sobic009G120850--Sobic001G317900 Sobic009G120850--Sobic005G083932 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic009G120850--Sobic008G174400 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic009G120850--Sobic002G191200 Sobic002G373500 Sobic002G373500 Sobic009G120850--Sobic002G373500 Sobic001G270301--Sobic009G206150 Sobic001G448900 Sobic001G448900 Sobic001G270301--Sobic001G448900 Sobic002G215932 Sobic002G215932 Sobic001G270301--Sobic002G215932 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic001G270301--Sobic001G071250 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic001G270301--Sobic001G417100 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic001G270301--Sobic007G115050 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic001G270301--Sobic007G135301 Sobic001G270301--Sobic001G317900 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic003G154200--Sobic010G173600 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic003G154200--Sobic006G147350 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic003G154200--Sobic005G093600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic003G154200--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic003G154200--Sobic006G017266 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic003G154200--Sobic001G249900 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic003G154200--Sobic006G020350 Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic003G154200--Sobic002G104600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic003G154200--Sobic009G069450 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic004G081701--Sobic004G346800 Sobic004G081701--Sobic009G206150 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic004G081701--Sobic001G045500 Sobic004G081701--Sobic007G135301 Sobic004G081701--Sobic001G071250 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic004G081701--Sobic001G195550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic004G081701--Sobic004G346700 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic004G081701--Sobic005G008400 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic004G081701--Sobic006G087250 Sobic002G094400--Sobic004G329600 Sobic008G018100 Sobic008G018100 Sobic002G094400--Sobic008G018100 Sobic002G394466 Sobic002G394466 Sobic002G094400--Sobic002G394466 Sobic002G094400--Sobic001G164800 Sobic004G142400 Sobic004G142400 Sobic002G094400--Sobic004G142400 Sobic002G327600 Sobic002G327600 Sobic002G094400--Sobic002G327600 Sobic003G061500 Sobic003G061500 Sobic002G094400--Sobic003G061500 Sobic005G126701 Sobic005G126701 Sobic002G094400--Sobic005G126701 Sobic001G463600 Sobic001G463600 Sobic002G094400--Sobic001G463600 Sobic001G011100--Sobic008G174400 Sobic001G011100--Sobic002G373500 Sobic002G277000 Sobic002G277000 Sobic001G011100--Sobic002G277000 Sobic007G080660 Sobic007G080660 Sobic001G011100--Sobic007G080660 Sobic001G011100--Sobic005G083932 Sobic001G011100--Sobic001G317900 Sobic009G206150--Sobic001G270301 Sobic009G206150--Sobic001G448900 Sobic009G206150--Sobic004G346800 Sobic009G206150--Sobic001G045500 Sobic009G206150--Sobic001G071250 Sobic009G206150--Sobic007G135301 Sobic009G206150--Sobic002G215932 Sobic009G206150--Sobic004G081701 Sobic009G206150--Sobic006G087250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.