Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G094400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QA60
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g07830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G329600 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
2 Sobic.008G018100 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
3 Sobic.002G394466 - -
4 Sobic.001G164800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
5 Sobic.004G142400 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G327600 ethylene receptor, putative, expressed K14509: ETR, ethylene receptor
7 Sobic.003G061500 small hydrophilic plant seed protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G126701 - -
9 Sobic.001G463600 - -
10 Sobic.010G110100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@"A transcription factor(Ortholog in rice:Huang et al., 2012)"(PubMedID : 31659933)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
11 Sobic.001G366300 telomerase reverse transcriptase, putative, expressed K11126: TERT, telomerase reverse transcriptase
12 Sobic.006G234433 - -
13 Sobic.004G349550 - K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
14 Sobic.004G000900 expressed protein -
15 Sobic.005G184700 - -
16 Sobic.002G240000 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase
17 Sobic.002G040201 - -
18 Sobic.005G184800 - -
19 Sobic.008G149300 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G122600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G094400 Sobic002G094400 Sobic004G329600 Sobic004G329600 Sobic002G094400--Sobic004G329600 Sobic008G018100 Sobic008G018100 Sobic002G094400--Sobic008G018100 Sobic002G394466 Sobic002G394466 Sobic002G094400--Sobic002G394466 Sobic001G164800 Sobic001G164800 Sobic002G094400--Sobic001G164800 Sobic004G142400 Sobic004G142400 Sobic002G094400--Sobic004G142400 Sobic002G327600 Sobic002G327600 Sobic002G094400--Sobic002G327600 Sobic003G061500 Sobic003G061500 Sobic002G094400--Sobic003G061500 Sobic005G126701 Sobic005G126701 Sobic002G094400--Sobic005G126701 Sobic001G463600 Sobic001G463600 Sobic002G094400--Sobic001G463600 Sobic004G329600--Sobic001G164800 Sobic005G054900 Sobic005G054900 Sobic004G329600--Sobic005G054900 Sobic010G256100 Sobic010G256100 Sobic004G329600--Sobic010G256100 Sobic004G000900 Sobic004G000900 Sobic004G329600--Sobic004G000900 Sobic004G349550 Sobic004G349550 Sobic004G329600--Sobic004G349550 Sobic010G110100 Sobic010G110100 Sobic004G329600--Sobic010G110100 Sobic004G329600--Sobic003G061500 Sobic005G184700 Sobic005G184700 Sobic004G329600--Sobic005G184700 Sobic005G184800 Sobic005G184800 Sobic004G329600--Sobic005G184800 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic008G018100--Sobic006G083900 Sobic006G234433 Sobic006G234433 Sobic008G018100--Sobic006G234433 Sobic008G149300 Sobic008G149300 Sobic008G018100--Sobic008G149300 Sobic007G025600 Sobic007G025600 Sobic008G018100--Sobic007G025600 Sobic008G018100--Sobic004G349550 Sobic008G018100--Sobic005G126701 Sobic001G122600 Sobic001G122600 Sobic008G018100--Sobic001G122600 Sobic002G394466--Sobic001G463600 Sobic002G040201 Sobic002G040201 Sobic002G394466--Sobic002G040201 Sobic002G394466--Sobic004G349550 Sobic001G366300 Sobic001G366300 Sobic002G394466--Sobic001G366300 Sobic002G394466--Sobic008G149300 Sobic002G394466--Sobic001G122600 Sobic001G164800--Sobic005G054900 Sobic007G008500 Sobic007G008500 Sobic001G164800--Sobic007G008500 Sobic002G046000 Sobic002G046000 Sobic001G164800--Sobic002G046000 Sobic001G164800--Sobic004G349550 Sobic001G166900 Sobic001G166900 Sobic001G164800--Sobic001G166900 Sobic001G164800--Sobic002G327600 Sobic006G248000 Sobic006G248000 Sobic001G164800--Sobic006G248000 Sobic003G443400 Sobic003G443400 Sobic001G164800--Sobic003G443400 Sobic001G164800--Sobic010G256100 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic004G142400--Sobic007G160400 Sobic004G142400--Sobic006G083900 Sobic004G142400--Sobic005G126701 Sobic003G434300 Sobic003G434300 Sobic004G142400--Sobic003G434300 Sobic004G142400--Sobic008G018100 Sobic004G142400--Sobic010G110100 Sobic004G142400--Sobic006G234433 Sobic004G142400--Sobic007G008500 Sobic004G091600 Sobic004G091600 Sobic004G142400--Sobic004G091600 Sobic002G327600--Sobic006G248000 Sobic010G125000 Sobic010G125000 Sobic002G327600--Sobic010G125000 Sobic002G327600--Sobic001G166900 Sobic001G165600 Sobic001G165600 Sobic002G327600--Sobic001G165600 Sobic002G211300 Sobic002G211300 Sobic002G327600--Sobic002G211300 Sobic002G327600--Sobic008G149300 Sobic002G327600--Sobic004G349550 Sobic006G167700 Sobic006G167700 Sobic002G327600--Sobic006G167700 Sobic010G198900 Sobic010G198900 Sobic002G327600--Sobic010G198900 Sobic003G061500--Sobic004G349550 Sobic003G061500--Sobic004G091600 Sobic003G061500--Sobic005G184700 Sobic003G061500--Sobic005G184800 Sobic003G061500--Sobic002G046000 Sobic001G344300 Sobic001G344300 Sobic003G061500--Sobic001G344300 Sobic003G061500--Sobic008G149300 Sobic003G061500--Sobic001G166900 Sobic003G061500--Sobic001G165600 Sobic001G254800 Sobic001G254800 Sobic005G126701--Sobic001G254800 Sobic005G126701--Sobic006G083900 Sobic005G126701--Sobic007G025600 Sobic001G534200 Sobic001G534200 Sobic005G126701--Sobic001G534200 Sobic005G126701--Sobic006G234433 Sobic009G103800 Sobic009G103800 Sobic005G126701--Sobic009G103800 Sobic005G126701--Sobic001G166900 Sobic005G126701--Sobic004G349550 Sobic005G126701--Sobic006G167700 Sobic001G463600--Sobic002G394466 Sobic001G463600--Sobic002G040201 Sobic003G243900 Sobic003G243900 Sobic001G463600--Sobic003G243900 Sobic001G463600--Sobic001G366300 Sobic010G111450 Sobic010G111450 Sobic001G463600--Sobic010G111450 Sobic003G372600 Sobic003G372600 Sobic001G463600--Sobic003G372600 Sobic001G208500 Sobic001G208500 Sobic001G463600--Sobic001G208500 Sobic001G463600--Sobic004G349550 Sobic001G463600--Sobic002G211300
Octagon: transcription factors


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