Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G248000.1
Synonym Sb09g029870
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PA81
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31852 PTHR31852:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G46150 : Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g50720.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044732
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.009G248000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G013400 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed -
2 Sobic.004G157950 - -
3 Sobic.003G421900 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
4 Sobic.007G090442 - -
5 Sobic.009G041100 expressed protein -
6 Sobic.003G153500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.004G270350 - -
8 Sobic.010G237100 expressed protein -
9 Sobic.005G110000 LTPL151 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.009G231500 expressed protein -
11 Sobic.009G169650 - -
12 Sobic.003G213300 expressed protein -
13 Sobic.010G152200 avr9/Cf-9 rapidly elicited protein 194, putative, expressed -
14 Sobic.009G073700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G381250 - -
16 Sobic.001G381250 - -
17 Sobic.001G381250 - -
18 Sobic.001G381250 - -
19 Sobic.001G381250 - -
20 Sobic.001G381250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G248000 Sobic009G248000 Sobic009G013400 Sobic009G013400 Sobic009G248000--Sobic009G013400 Sobic004G157950 Sobic004G157950 Sobic009G248000--Sobic004G157950 Sobic003G421900 Sobic003G421900 Sobic009G248000--Sobic003G421900 Sobic007G090442 Sobic007G090442 Sobic009G248000--Sobic007G090442 Sobic009G041100 Sobic009G041100 Sobic009G248000--Sobic009G041100 Sobic003G153500 Sobic003G153500 Sobic009G248000--Sobic003G153500 Sobic004G270350 Sobic004G270350 Sobic009G248000--Sobic004G270350 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic009G248000--Sobic010G237100 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic009G248000--Sobic005G110000 Sobic009G013400--Sobic003G153500 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic009G013400--Sobic007G082900 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic009G013400--Sobic005G187100 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic009G013400--Sobic008G013100 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic009G013400--Sobic003G323000 Sobic004G254400 Sobic004G254400 Sobic009G013400--Sobic004G254400 Sobic001G394100 Sobic001G394100 Sobic009G013400--Sobic001G394100 Sobic009G022700 Sobic009G022700 Sobic009G013400--Sobic009G022700 Sobic008G013000 Sobic008G013000 Sobic009G013400--Sobic008G013000 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic004G157950--Sobic001G381250 Sobic009G009800 Sobic009G009800 Sobic003G421900--Sobic009G009800 Sobic006G244500 Sobic006G244500 Sobic003G421900--Sobic006G244500 Sobic006G096200 Sobic006G096200 Sobic003G421900--Sobic006G096200 Sobic010G136300 Sobic010G136300 Sobic003G421900--Sobic010G136300 Sobic001G368900 Sobic001G368900 Sobic003G421900--Sobic001G368900 Sobic008G037000 Sobic008G037000 Sobic003G421900--Sobic008G037000 Sobic001G277800 Sobic001G277800 Sobic003G421900--Sobic001G277800 Sobic010G031600 Sobic010G031600 Sobic003G421900--Sobic010G031600 Sobic003G376000 Sobic003G376000 Sobic003G421900--Sobic003G376000 Sobic007G090442--Sobic009G041100 Sobic007G090442--Sobic005G110000 Sobic002G362400 Sobic002G362400 Sobic007G090442--Sobic002G362400 Sobic005G087666 Sobic005G087666 Sobic007G090442--Sobic005G087666 Sobic007G090442--Sobic010G237100 Sobic010G044600 Sobic010G044600 Sobic007G090442--Sobic010G044600 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic007G090442--Sobic009G010000 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic007G090442--Sobic003G392500 Sobic005G199300 Sobic005G199300 Sobic007G090442--Sobic005G199300 Sobic009G041100--Sobic010G237100 Sobic009G041100--Sobic010G044600 Sobic009G041100--Sobic001G381250 Sobic003G153500--Sobic009G013400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic003G153500--Sobic008G088450 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic003G153500--Sobic009G227000 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic003G153500--Sobic009G007500 Sobic010G227400 Sobic010G227400 Sobic003G153500--Sobic010G227400 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic003G153500--Sobic001G170500 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic003G153500--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic003G153500--Sobic010G109700 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic003G153500--Sobic001G096500 Sobic004G270350--Sobic001G381250 Sobic010G237100--Sobic010G044600 Sobic010G237100--Sobic005G110000 Sobic010G237100--Sobic002G362400 Sobic010G237100--Sobic005G087666 Sobic005G169300 Sobic005G169300 Sobic010G237100--Sobic005G169300 Sobic002G370300 Sobic002G370300 Sobic010G237100--Sobic002G370300 Sobic010G237100--Sobic001G381250 Sobic005G110000--Sobic002G362400 Sobic005G110000--Sobic010G044600 Sobic005G110000--Sobic010G237100 Sobic005G110000--Sobic005G087666 Sobic005G110000--Sobic005G199300 Sobic005G110000--Sobic001G381250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.