Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G047900.2
Synonym Sb10g004190
Functional annotation OsFBDUF30 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0VRG6
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33110 PTHR33110:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33190 : F-box family protein with a domain of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05580.1 : OsFBDUF30 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS4A02G397600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G407950 - -
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12 Sobic.005G191400 MBTB63 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.007G082700 expressed protein -
14 Sobic.004G311550 - -
15 Sobic.004G056350 - -
16 Sobic.006G257250 - -
17 Sobic.003G042000 - -
18 Sobic.005G125100 basic region leucine zipper domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G251050 - -
20 Sobic.006G011700 dirigent, putative -


Gene co-expression network
sample Sobic010G047900 Sobic010G047900 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic010G047900--Sobic003G407950 Sobic004G198350 Sobic004G198350 Sobic010G047900--Sobic004G198350 Sobic001G405200 Sobic001G405200 Sobic010G047900--Sobic001G405200 Sobic006G029250 Sobic006G029250 Sobic010G047900--Sobic006G029250 Sobic004G195650 Sobic004G195650 Sobic010G047900--Sobic004G195650 Sobic002G349200 Sobic002G349200 Sobic010G047900--Sobic002G349200 Sobic009G013850 Sobic009G013850 Sobic010G047900--Sobic009G013850 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic010G047900--Sobic009G034250 Sobic004G099000 Sobic004G099000 Sobic010G047900--Sobic004G099000 Sobic003G407950--Sobic006G029250 Sobic003G407950--Sobic009G034250 Sobic002G251050 Sobic002G251050 Sobic003G407950--Sobic002G251050 Sobic003G407950--Sobic001G405200 Sobic009G187150 Sobic009G187150 Sobic003G407950--Sobic009G187150 Sobic003G407950--Sobic004G198350 Sobic001G405450 Sobic001G405450 Sobic003G407950--Sobic001G405450 Sobic003G407950--Sobic009G013850 Sobic003G407950--Sobic004G195650 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic004G198350--Sobic007G082700 Sobic005G191400 Sobic005G191400 Sobic004G198350--Sobic005G191400 Sobic004G198350--Sobic009G013850 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic004G198350--Sobic003G042000 Sobic004G198350--Sobic006G029250 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic004G198350--Sobic004G311550 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic004G198350--Sobic004G056350 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic004G198350--Sobic006G257250 Sobic004G198350--Sobic009G034250 Sobic001G405200--Sobic003G407950 Sobic001G405200--Sobic006G029250 Sobic001G405200--Sobic002G251050 Sobic001G405200--Sobic009G034250 Sobic001G405200--Sobic004G198350 Sobic001G166100 Sobic001G166100 Sobic001G405200--Sobic001G166100 Sobic001G405200--Sobic007G082700 Sobic001G405200--Sobic009G187150 Sobic001G405200--Sobic004G195650 Sobic006G029250--Sobic009G034250 Sobic006G029250--Sobic009G013850 Sobic006G029250--Sobic007G082700 Sobic006G029250--Sobic004G195650 Sobic006G029250--Sobic003G042000 Sobic006G029250--Sobic003G407950 Sobic006G029250--Sobic004G311550 Sobic006G029250--Sobic004G056350 Sobic006G029250--Sobic006G257250 Sobic004G195650--Sobic006G029250 Sobic004G195650--Sobic009G013850 Sobic004G195650--Sobic007G082700 Sobic004G195650--Sobic004G311550 Sobic004G195650--Sobic004G056350 Sobic004G195650--Sobic006G257250 Sobic004G195650--Sobic003G042000 Sobic004G195650--Sobic009G034250 Sobic006G113700 Sobic006G113700 Sobic004G195650--Sobic006G113700 Sobic005G125100 Sobic005G125100 Sobic002G349200--Sobic005G125100 Sobic002G349200--Sobic004G099000 Sobic010G052450 Sobic010G052450 Sobic002G349200--Sobic010G052450 Sobic005G097201 Sobic005G097201 Sobic002G349200--Sobic005G097201 Sobic005G181400 Sobic005G181400 Sobic002G349200--Sobic005G181400 Sobic003G197700 Sobic003G197700 Sobic002G349200--Sobic003G197700 Sobic002G349200--Sobic004G198350 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic002G349200--Sobic002G026600 Sobic010G017600 Sobic010G017600 Sobic002G349200--Sobic010G017600 Sobic009G013850--Sobic004G311550 Sobic009G013850--Sobic004G056350 Sobic009G013850--Sobic006G257250 Sobic009G013850--Sobic007G082700 Sobic009G013850--Sobic003G042000 Sobic009G013850--Sobic006G029250 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic009G013850--Sobic009G024166 Sobic009G013850--Sobic009G034250 Sobic009G013850--Sobic004G195650 Sobic009G034250--Sobic006G029250 Sobic009G034250--Sobic009G013850 Sobic009G034250--Sobic007G082700 Sobic009G034250--Sobic004G195650 Sobic009G034250--Sobic003G407950 Sobic009G034250--Sobic003G042000 Sobic009G034250--Sobic004G311550 Sobic009G034250--Sobic004G056350 Sobic009G034250--Sobic006G257250 Sobic004G099000--Sobic002G349200 Sobic004G015050 Sobic004G015050 Sobic004G099000--Sobic004G015050 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic004G099000--Sobic010G121900 Sobic005G189600 Sobic005G189600 Sobic004G099000--Sobic005G189600 Sobic002G080500 Sobic002G080500 Sobic004G099000--Sobic002G080500 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic004G099000--Sobic004G015150 Sobic003G066600 Sobic003G066600 Sobic004G099000--Sobic003G066600 Sobic006G234200 Sobic006G234200 Sobic004G099000--Sobic006G234200 Sobic004G099000--Sobic005G097201
Octagon: transcription factors


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