Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G061300.2
Synonym GSO1, Sb10g005310
Functional annotation receptor protein kinase, putative, expressed
UniProt C5Z5F4
Pfam PF08263 PF00560 PF00069 PF13855
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF30
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g46980.1 : receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038879
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G006000 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA homolog CD4B,chloroplast precursor, putative, expressed K03696: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
2 Sobic.004G055300 - -
3 Sobic.002G325000 O-methyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.010G244800 expressed protein -
5 Sobic.008G043450 - -
6 Sobic.003G373700 - -
7 Sobic.001G440401 - -
8 Sobic.002G168750 - -
9 Sobic.005G183900 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G167900 - -
11 Sobic.003G288700 expressed protein -
12 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
13 Sobic.002G025900 expressed protein -
14 Sobic.010G045966 - -
15 Sobic.005G110350 - -
16 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
17 Sobic.001G072100 OsFBX111 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G149000 - -
19 Sobic.007G083700 - -
20 Sobic.009G184450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G061300 Sobic010G061300 Sobic007G006000 Sobic007G006000 Sobic010G061300--Sobic007G006000 Sobic004G055300 Sobic004G055300 Sobic010G061300--Sobic004G055300 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic010G061300--Sobic002G325000 Sobic010G244800 Sobic010G244800 Sobic010G061300--Sobic010G244800 Sobic008G043450 Sobic008G043450 Sobic010G061300--Sobic008G043450 Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic010G061300--Sobic003G373700 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G061300--Sobic001G440401 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic010G061300--Sobic002G168750 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic010G061300--Sobic005G183900 Sobic009G099050 Sobic009G099050 Sobic007G006000--Sobic009G099050 Sobic003G078600 Sobic003G078600 Sobic007G006000--Sobic003G078600 Sobic010G233300 Sobic010G233300 Sobic007G006000--Sobic010G233300 Sobic002G347800 Sobic002G347800 Sobic007G006000--Sobic002G347800 Sobic007G006000--Sobic010G061300 Sobic006G034650 Sobic006G034650 Sobic007G006000--Sobic006G034650 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Octagon: transcription factors


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