Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G373700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q791
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039534
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G115532 - -
2 Sobic.008G157400 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
3 Sobic.004G115950 - -
4 Sobic.007G203600 transferase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G133750 - -
6 Sobic.001G404950 - -
7 Sobic.003G340500 curculin-like lectin family protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G461101 - -
9 Sobic.003G198850 - -
10 Sobic.010G263151 - -
11 Sobic.009G190100 expressed protein -
12 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
13 Sobic.003G254400 expressed protein -
14 Sobic.K004201 - -
15 Sobic.003G383000 expressed protein -
16 Sobic.003G318600 - -
17 Sobic.003G360500 glycosyl transferase, putative, expressed K00750: GYG1, glycogenin
18 Sobic.005G080075 - -
19 Sobic.001G209000 secretory protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G073200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic006G115532 Sobic006G115532 Sobic003G373700--Sobic006G115532 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic003G373700--Sobic008G157400 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic003G373700--Sobic004G115950 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic003G373700--Sobic007G203600 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic003G373700--Sobic008G133750 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic003G373700--Sobic001G404950 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic003G373700--Sobic003G340500 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic003G373700--Sobic001G461101 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic003G373700--Sobic003G198850 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic006G115532--Sobic004G233100 Sobic006G115532--Sobic003G373700 Sobic006G115532--Sobic008G157400 Sobic002G307700 Sobic002G307700 Sobic006G115532--Sobic002G307700 Sobic006G115532--Sobic004G115950 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic006G115532--Sobic010G263151 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic006G115532--Sobic010G165925 Sobic006G212300 Sobic006G212300 Sobic006G115532--Sobic006G212300 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic006G115532--Sobic006G196800 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic008G157400--Sobic009G190100 Sobic008G157400--Sobic007G203600 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic008G157400--Sobic003G008400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic008G157400--Sobic003G254400 Sobic008G157400--Sobic001G404950 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic008G157400--Sobic003G318600 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic008G157400--Sobic005G080075 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic008G157400--Sobic003G360500 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic008G157400--Sobic001G100650 Sobic004G115950--Sobic003G198850 Sobic004G115950--Sobic001G404950 Sobic004G115950--Sobic003G340500 Sobic004G115950--Sobic006G115532 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic004G115950--Sobic003G383000 Sobic004G115950--Sobic003G373700 Sobic004G115950--Sobic008G157400 Sobic002G359500 Sobic002G359500 Sobic004G115950--Sobic002G359500 Sobic004G115950--Sobic008G133750 Sobic007G203600--Sobic010G263151 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic007G203600--Sobic007G043050 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic007G203600--Sobic006G007700 Sobic007G203600--Sobic008G157400 Sobic003G267400 Sobic003G267400 Sobic007G203600--Sobic003G267400 Sobic007G203600--Sobic006G196800 Sobic007G203600--Sobic003G008400 Sobic007G203600--Sobic003G254400 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic007G203600--Sobic001G519500 Sobic008G133750--Sobic009G190100 Sobic008G133750--Sobic001G461101 SobicK004201 SobicK004201 Sobic008G133750--SobicK004201 Sobic008G133750--Sobic008G157400 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic008G133750--Sobic004G092950 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic008G133750--Sobic002G117800 Sobic008G133750--Sobic005G080075 Sobic008G133750--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic008G133750--Sobic010G064050 Sobic001G404950--Sobic003G383000 Sobic001G404950--Sobic008G157400 Sobic001G404950--Sobic003G198850 Sobic001G404950--Sobic001G461101 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic001G404950--Sobic001G072100 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic001G404950--Sobic003G288700 Sobic001G404950--Sobic004G115950 Sobic001G404950--Sobic003G340500 Sobic001G404950--Sobic009G190100 Sobic003G340500--Sobic001G461101 Sobic003G340500--Sobic009G190100 Sobic003G340500--Sobic008G157400 Sobic003G340500--Sobic008G133750 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic003G340500--Sobic009G055700 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic003G340500--Sobic003G348300 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G340500--Sobic008G053800 Sobic003G340500--Sobic001G404950 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G340500--Sobic002G082350 Sobic001G461101--Sobic009G055700 Sobic001G461101--Sobic009G190100 Sobic001G461101--Sobic002G082350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic001G461101--Sobic007G145300 Sobic001G461101--Sobic010G064050 Sobic001G461101--Sobic001G100650 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic001G461101--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic001G461101--Sobic009G156700 Sobic001G461101--Sobic005G080075 Sobic003G198850--Sobic003G383000 Sobic003G198850--Sobic001G404950 Sobic003G198850--Sobic008G053800 Sobic003G198850--Sobic004G115950 Sobic003G198850--Sobic001G072100 Sobic003G198850--Sobic003G288700 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic003G198850--Sobic004G023800 Sobic003G198850--SobicK004201 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic003G198850--Sobic002G149500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.