Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K044402.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1W0VQU1
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NCBI CDD -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G055400 expressed protein -
2 Sobic.009G227650 - -
3 Sobic.005G227900 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.010G158601 - -
5 Sobic.008G085600 - -
6 Sobic.002G185400 transporter-related, putative, expressed -
7 Sobic.003G363600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
8 Sobic.010G262650 - K14553: U3 small nucleolar RNA-associated protein 18
9 Sobic.004G067850 - -
10 Sobic.008G032850 - -
11 Sobic.009G147100 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
12 Sobic.010G212900 expressed protein -
13 Sobic.002G342200 expressed protein -
14 Sobic.006G116200 receptor protein kinase CLAVATA1 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G333200 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G024900 OsWAK110 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
17 Sobic.002G157350 - -
18 Sobic.001G001132 - -
19 Sobic.010G229200 - -
20 Sobic.003G286650 - -


Gene co-expression network
sample SobicK044402 SobicK044402 Sobic007G055400 Sobic007G055400 SobicK044402--Sobic007G055400 Sobic009G227650 Sobic009G227650 SobicK044402--Sobic009G227650 Sobic005G227900 Sobic005G227900 SobicK044402--Sobic005G227900 Sobic010G158601 Sobic010G158601 SobicK044402--Sobic010G158601 Sobic008G085600 Sobic008G085600 SobicK044402--Sobic008G085600 Sobic002G185400 Sobic002G185400 SobicK044402--Sobic002G185400 Sobic003G363600 Sobic003G363600 SobicK044402--Sobic003G363600 Sobic010G262650 Sobic010G262650 SobicK044402--Sobic010G262650 Sobic004G067850 Sobic004G067850 SobicK044402--Sobic004G067850 Sobic007G055400--SobicK044402 Sobic003G143401 Sobic003G143401 Sobic007G055400--Sobic003G143401 Sobic007G055400--Sobic004G067850 Sobic008G032850 Sobic008G032850 Sobic007G055400--Sobic008G032850 Sobic001G001132 Sobic001G001132 Sobic007G055400--Sobic001G001132 Sobic007G055400--Sobic009G227650 Sobic007G055400--Sobic008G085600 Sobic007G055400--Sobic010G262650 Sobic007G055400--Sobic010G158601 Sobic009G227650--SobicK044402 Sobic001G318366 Sobic001G318366 Sobic009G227650--Sobic001G318366 Sobic009G227650--Sobic007G055400 Sobic009G227650--Sobic010G158601 Sobic009G227650--Sobic008G085600 Sobic007G074100 Sobic007G074100 Sobic009G227650--Sobic007G074100 Sobic009G227650--Sobic010G262650 Sobic009G147100 Sobic009G147100 Sobic009G227650--Sobic009G147100 Sobic001G530650 Sobic001G530650 Sobic009G227650--Sobic001G530650 Sobic004G041600 Sobic004G041600 Sobic005G227900--Sobic004G041600 Sobic005G227900--SobicK044402 Sobic003G015700 Sobic003G015700 Sobic005G227900--Sobic003G015700 Sobic008G014601 Sobic008G014601 Sobic005G227900--Sobic008G014601 Sobic005G227900--Sobic007G055400 Sobic007G115600 Sobic007G115600 Sobic005G227900--Sobic007G115600 Sobic001G423900 Sobic001G423900 Sobic005G227900--Sobic001G423900 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic005G227900--Sobic007G176300 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic005G227900--Sobic002G342901 Sobic010G158601--Sobic009G147100 Sobic009G066850 Sobic009G066850 Sobic010G158601--Sobic009G066850 Sobic002G380750 Sobic002G380750 Sobic010G158601--Sobic002G380750 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic010G158601--Sobic005G156800 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic010G158601--Sobic001G452400 Sobic010G158601--Sobic008G085600 Sobic008G192100 Sobic008G192100 Sobic010G158601--Sobic008G192100 Sobic002G157350 Sobic002G157350 Sobic010G158601--Sobic002G157350 Sobic007G024900 Sobic007G024900 Sobic010G158601--Sobic007G024900 Sobic002G342200 Sobic002G342200 Sobic008G085600--Sobic002G342200 Sobic008G085600--Sobic009G066850 Sobic008G085600--Sobic009G147100 Sobic004G048600 Sobic004G048600 Sobic008G085600--Sobic004G048600 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic008G085600--Sobic003G291050 Sobic002G302400 Sobic002G302400 Sobic008G085600--Sobic002G302400 Sobic008G085600--Sobic010G158601 Sobic008G085600--Sobic010G262650 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic008G085600--Sobic007G100275 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic002G185400--Sobic001G084200 Sobic002G185400--Sobic001G001132 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic002G185400--Sobic009G168700 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic002G185400--Sobic006G138966 Sobic005G073101 Sobic005G073101 Sobic002G185400--Sobic005G073101 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic002G185400--Sobic001G192750 Sobic002G185400--Sobic004G067850 Sobic002G185400--Sobic008G032850 Sobic002G185400--Sobic002G342200 Sobic004G202900 Sobic004G202900 Sobic003G363600--Sobic004G202900 Sobic003G363600--SobicK044402 Sobic003G363600--Sobic005G227900 Sobic004G317401 Sobic004G317401 Sobic003G363600--Sobic004G317401 Sobic002G373700 Sobic002G373700 Sobic003G363600--Sobic002G373700 Sobic007G191400 Sobic007G191400 Sobic003G363600--Sobic007G191400 Sobic010G019600 Sobic010G019600 Sobic003G363600--Sobic010G019600 Sobic002G085200 Sobic002G085200 Sobic003G363600--Sobic002G085200 Sobic004G341600 Sobic004G341600 Sobic003G363600--Sobic004G341600 Sobic007G005800 Sobic007G005800 Sobic010G262650--Sobic007G005800 Sobic001G497750 Sobic001G497750 Sobic010G262650--Sobic001G497750 Sobic010G262650--Sobic001G530650 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic010G262650--Sobic001G272300 Sobic004G067850--Sobic008G032850 Sobic004G067850--Sobic002G302400 Sobic004G067850--Sobic001G272300
Octagon: transcription factors


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